37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3820 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3820  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391965 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3096  hypothetical protein  84.88 
 
 		 214 aa  303  8.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.880364  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1040  hypothetical protein  49.33 
 
 		 170 aa  159  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3726  hypothetical protein  50.91 
 
 		 191 aa  157  8e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1652  hypothetical protein  53.1 
 
 		 191 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215639  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4296  BRO-like  48.8 
 
 		 176 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.836622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33290  hypothetical protein  33.93 
 
 		 251 aa  94  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00174462  normal  0.221973 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2833  hypothetical protein  34.32 
 
 		 170 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.977223  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49500  hypothetical protein  33.91 
 
 		 184 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000177569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1644  BRO domain-containing protein  28.18 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0834656  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1000  BRO family protein  30.97 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.173667  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1235  prophage antirepressor  26.04 
 
 		 263 aa  53.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298657  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1877  prophage LambdaSa2, antirepressor protein, putative  26 
 
 		 236 aa  52.4  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0256664  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1161  hypothetical protein  29.47 
 
 		 193 aa  51.2  0.000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00000000330342  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3740  prophage antirepressor  28.71 
 
 		 283 aa  50.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3791  prophage antirepressor  28.71 
 
 		 283 aa  50.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2513  BRO, N-terminal  26.77 
 
 		 172 aa  49.7  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0512852  normal  0.446294 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4227  hypothetical protein  35.64 
 
 		 122 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2642  hypothetical protein  29.17 
 
 		 252 aa  48.1  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.226633  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1367  prophage antirepressor  26.67 
 
 		 264 aa  47.4  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000214644  unclonable  1.53039e-25 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1874  prophage antirepressor  22.12 
 
 		 299 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000268327  normal  0.0527213 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3521  BRO, N-terminal  28.74 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000239324  decreased coverage  0.000343043 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2135  phage-encoded protein  26.04 
 
 		 260 aa  46.6  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000332219  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4013  BRO domain-containing protein  32 
 
 		 284 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3254  prophage antirepressor  25.25 
 
 		 270 aa  46.6  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000711854  decreased coverage  0.00000000000000707487 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0524  prophage antirepressor  28.42 
 
 		 259 aa  45.8  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.844398  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3400  prophage antirepressor  26.92 
 
 		 284 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000183753  unclonable  1.97476e-16 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0789  BRO, N-terminal  28.74 
 
 		 172 aa  45.1  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000825833 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0554  prophage antirepressor  30.12 
 
 		 269 aa  43.9  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.239939  hitchhiker  0.000124341 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1165  prophage antirepressor  28.41 
 
 		 149 aa  43.9  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0803  prophage antirepressor  22.11 
 
 		 257 aa  43.5  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000145423  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1073  BRO family protein  24 
 
 		 313 aa  43.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00174599  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2133  phage antirepressor protein  27.47 
 
 		 244 aa  43.1  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2462  BRO-like protein  21.51 
 
 		 248 aa  42.4  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000468179  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1616  hypothetical protein  26.92 
 
 		 151 aa  42.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0345712  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5813  prophage antirepressor  23.86 
 
 		 256 aa  42.4  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1322  prophage antirepressor  24.14 
 
 		 236 aa  41.6  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000035001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>