54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1040 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1040  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  356  9.999999999999999e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3820  hypothetical protein  49.33 
 
 		 181 aa  159  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391965 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3096  hypothetical protein  48.32 
 
 		 214 aa  157  6e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.880364  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1652  hypothetical protein  51.05 
 
 		 191 aa  152  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215639  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3726  hypothetical protein  49.65 
 
 		 191 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4296  BRO-like  47.26 
 
 		 176 aa  124  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.836622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33290  hypothetical protein  36.05 
 
 		 251 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00174462  normal  0.221973 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2833  hypothetical protein  35.37 
 
 		 170 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.977223  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49500  hypothetical protein  31.64 
 
 		 184 aa  77.8  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000177569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1161  hypothetical protein  27.63 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00000000330342  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3521  BRO, N-terminal  31.33 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000239324  decreased coverage  0.000343043 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1877  prophage LambdaSa2, antirepressor protein, putative  22.22 
 
 		 236 aa  58.2  0.00000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0256664  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2462  BRO-like protein  25.93 
 
 		 248 aa  57.8  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000468179  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2513  BRO, N-terminal  29.41 
 
 		 172 aa  57.4  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0512852  normal  0.446294 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1000  BRO family protein  30.91 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.173667  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1142  phage antirepressor protein  24 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000418777  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1644  BRO domain-containing protein  30.51 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0834656  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0789  BRO, N-terminal  25.2 
 
 		 172 aa  53.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000825833 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2642  hypothetical protein  25.23 
 
 		 252 aa  51.2  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.226633  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3254  prophage antirepressor  25.88 
 
 		 270 aa  51.2  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000711854  decreased coverage  0.00000000000000707487 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1867  prophage antirepressor  27.72 
 
 		 272 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000186522  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3400  prophage antirepressor  25.77 
 
 		 284 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000183753  unclonable  1.97476e-16 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0554  prophage antirepressor  30.85 
 
 		 269 aa  49.3  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.239939  hitchhiker  0.000124341 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5813  prophage antirepressor  25 
 
 		 256 aa  48.5  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3740  prophage antirepressor  27.19 
 
 		 283 aa  48.9  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3791  prophage antirepressor  27.19 
 
 		 283 aa  48.9  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1874  prophage antirepressor  22.32 
 
 		 299 aa  47.8  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000268327  normal  0.0527213 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1804  prophage antirepressor  23.86 
 
 		 244 aa  46.6  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1235  prophage antirepressor  21.65 
 
 		 263 aa  47  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298657  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2135  phage-encoded protein  23.81 
 
 		 260 aa  47.4  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000332219  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1205  prophage antirepressor  25.56 
 
 		 535 aa  46.2  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.312147  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1825  prophage antirepressor  25.56 
 
 		 535 aa  46.2  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1181  prophage antirepressor  23.85 
 
 		 188 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000354678  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1616  hypothetical protein  27.18 
 
 		 151 aa  45.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0345712  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2133  phage antirepressor protein  24.75 
 
 		 244 aa  45.4  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0797  BRO, N-terminal  27.37 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.651064  hitchhiker  0.00000114436 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1322  prophage antirepressor  22.22 
 
 		 236 aa  45.8  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000035001  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1174  hypothetical protein  65.62 
 
 		 44 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0540022 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0575  prophage antirepressor  27.1 
 
 		 295 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0524  prophage antirepressor  25.53 
 
 		 259 aa  44.7  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.844398  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2380  BRO domain-containing protein  26.61 
 
 		 335 aa  44.3  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.016925  normal  0.26363 
 
 
-
 
NC_013208  Aaci_3150  prophage antirepressor  21.51 
 
 		 206 aa  44.3  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1315  prophage antirepressor  28.46 
 
 		 256 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.930298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3440  prophage antirepressor  22.13 
 
 		 285 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000105678  unclonable  9.66468e-17 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1165  prophage antirepressor  29.63 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4227  hypothetical protein  31.73 
 
 		 122 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1367  prophage antirepressor  23.96 
 
 		 264 aa  42.4  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000214644  unclonable  1.53039e-25 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1073  BRO family protein  24.82 
 
 		 313 aa  42.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00174599  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2402  prophage antirepressor  29.07 
 
 		 230 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1060  prophage antirepressor  26.02 
 
 		 262 aa  42  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000214143  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0898  prophage antirepressor  24.49 
 
 		 217 aa  42  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.798648  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0803  prophage antirepressor  17.82 
 
 		 257 aa  42  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000145423  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2795  prophage antirepressor-like  27.91 
 
 		 197 aa  41.6  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1175  hypothetical protein  71.43 
 
 		 31 aa  41.6  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.103603 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>