26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_49500 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_49500  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000177569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4227  hypothetical protein  93.39 
 
 		 122 aa  223  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4230  hypothetical protein  85.94 
 
 		 64 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33290  hypothetical protein  36.26 
 
 		 251 aa  94.4  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00174462  normal  0.221973 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2833  hypothetical protein  37.43 
 
 		 170 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.977223  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1652  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215639  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3096  hypothetical protein  33.53 
 
 		 214 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.880364  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3820  hypothetical protein  33.91 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391965 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3726  hypothetical protein  32.77 
 
 		 191 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1040  hypothetical protein  31.64 
 
 		 170 aa  77.8  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4296  BRO-like  40.18 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.836622  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1877  prophage LambdaSa2, antirepressor protein, putative  26.98 
 
 		 236 aa  53.5  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0256664  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1161  hypothetical protein  29.32 
 
 		 193 aa  49.3  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00000000330342  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2135  phage-encoded protein  27.07 
 
 		 260 aa  47.8  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000332219  n/a   
 
 
-
 
NC_013208  Aaci_3150  prophage antirepressor  21.77 
 
 		 206 aa  45.1  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1142  phage antirepressor protein  29.03 
 
 		 267 aa  44.7  0.0007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000418777  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1644  BRO domain-containing protein  27.06 
 
 		 239 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0834656  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1205  prophage antirepressor  33.33 
 
 		 535 aa  43.5  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.312147  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1825  prophage antirepressor  33.33 
 
 		 535 aa  43.5  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3400  prophage antirepressor  26.81 
 
 		 284 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000183753  unclonable  1.97476e-16 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1367  prophage antirepressor  25.83 
 
 		 264 aa  42  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000214644  unclonable  1.53039e-25 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1177  hypothetical protein  36.84 
 
 		 420 aa  41.6  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.163274  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1616  hypothetical protein  28.95 
 
 		 151 aa  41.6  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0345712  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0789  BRO, N-terminal  24.39 
 
 		 172 aa  41.6  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000825833 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1235  prophage antirepressor  26.67 
 
 		 263 aa  41.2  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298657  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2380  BRO domain-containing protein  23.21 
 
 		 335 aa  41.2  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.016925  normal  0.26363 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>