52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1080 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1080  prophage antirepressor-like protein  100 
 
 		 206 aa  430  1e-120  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174443  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1061  prophage antirepressor-like protein  86.67 
 
 		 210 aa  380  1e-105  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000179859  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1161  hypothetical protein  42.27 
 
 		 193 aa  153  2e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00000000330342  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1645  prophage antirepressor  50.47 
 
 		 294 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2178  hypothetical protein  44.66 
 
 		 187 aa  98.6  6e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1058  BRO domain-containing protein  41.35 
 
 		 225 aa  97.4  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4931  prophage antirepressor-like protein  41.75 
 
 		 353 aa  90.9  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0323  hypothetical protein  47.56 
 
 		 208 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.161575  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1415  prophage antirepressor  41.18 
 
 		 221 aa  87.4  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000182946  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2212  hypothetical protein  38.24 
 
 		 216 aa  87.8  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.803951  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0652  gp30  39.6 
 
 		 212 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0371314  hitchhiker  0.0000154147 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1183  hypothetical protein  81.4 
 
 		 128 aa  73.6  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00000193226  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1185  hypothetical protein  81.4 
 
 		 128 aa  73.9  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00257658  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1184  hypothetical protein  73.91 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000553912  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1182  hypothetical protein  69.57 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00000000219154  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1181  prophage antirepressor  31.06 
 
 		 188 aa  62  0.000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000354678  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1118  BRO domain-containing protein  30 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.296909  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0554  prophage antirepressor  38.02 
 
 		 269 aa  58.5  0.00000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.239939  hitchhiker  0.000124341 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1142  phage antirepressor protein  26.52 
 
 		 267 aa  58.5  0.00000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000418777  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3440  prophage antirepressor  33.62 
 
 		 285 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000105678  unclonable  9.66468e-17 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1235  prophage antirepressor  29.17 
 
 		 263 aa  55.1  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298657  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0803  prophage antirepressor  25.2 
 
 		 257 aa  55.1  0.0000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000145423  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1000  BRO family protein  27.39 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.173667  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1804  prophage antirepressor  33.63 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4209  prophage antirepressor  26.85 
 
 		 246 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000536971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1864  prophage antirepressor  32.77 
 
 		 293 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.886046 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2642  hypothetical protein  32.17 
 
 		 252 aa  50.8  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.226633  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1060  prophage antirepressor  31.48 
 
 		 262 aa  51.2  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000214143  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1867  prophage antirepressor  26.27 
 
 		 272 aa  49.7  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000186522  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_013208  Aaci_3150  prophage antirepressor  30.36 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3254  prophage antirepressor  31.58 
 
 		 270 aa  48.9  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000711854  decreased coverage  0.00000000000000707487 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1073  BRO family protein  31.15 
 
 		 313 aa  48.5  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00174599  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1740  BRO-like protein  35.04 
 
 		 254 aa  48.1  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000880579  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0898  prophage antirepressor  28.83 
 
 		 217 aa  48.1  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.798648  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3227  prophage antirepressor  29.25 
 
 		 252 aa  47.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.323772  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1644  BRO domain-containing protein  32.41 
 
 		 239 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0834656  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1874  prophage antirepressor  25.81 
 
 		 299 aa  46.2  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000268327  normal  0.0527213 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2135  phage-encoded protein  26.67 
 
 		 260 aa  46.2  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000332219  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1616  hypothetical protein  29.91 
 
 		 151 aa  45.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0345712  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2462  BRO-like protein  28.21 
 
 		 248 aa  45.8  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000468179  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4120  prophage antirepressor  26.52 
 
 		 192 aa  45.8  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0152271  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1555  antirepressor protein  30.09 
 
 		 292 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0345805  hitchhiker  0.000277946 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0575  prophage antirepressor  29.82 
 
 		 295 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1877  prophage LambdaSa2, antirepressor protein, putative  23.64 
 
 		 236 aa  45.1  0.0007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0256664  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3521  BRO, N-terminal  33 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000239324  decreased coverage  0.000343043 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2513  BRO, N-terminal  31.73 
 
 		 172 aa  44.7  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0512852  normal  0.446294 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0524  prophage antirepressor  32.11 
 
 		 259 aa  44.3  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.844398  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1825  prophage antirepressor  25.22 
 
 		 535 aa  43.1  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1205  prophage antirepressor  25.22 
 
 		 535 aa  43.1  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.312147  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3400  prophage antirepressor  29.03 
 
 		 284 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000183753  unclonable  1.97476e-16 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1177  hypothetical protein  26.09 
 
 		 420 aa  42.7  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.163274  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2504  BRO family protein  38.89 
 
 		 58 aa  42.4  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.880081 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>