71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1649 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1649  BRO-like protein  100 
 
 		 265 aa  551  1e-156  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000543299  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1235  prophage antirepressor  43.12 
 
 		 263 aa  207  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298657  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1740  BRO-like protein  43.46 
 
 		 254 aa  202  6e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000880579  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0871  BRO domain-containing protein  41.85 
 
 		 255 aa  148  9e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0855  prophage antirepressor  41.85 
 
 		 255 aa  148  9e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0382  phage antirepressor protein, putative  51.11 
 
 		 250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000707014  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2852  AntA/AntB antirepressor domain protein  51.11 
 
 		 250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000203262  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1804  prophage antirepressor  34.78 
 
 		 244 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3917  prophage antirepressor  50.44 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0381452  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1142  phage antirepressor protein  36.47 
 
 		 267 aa  107  3e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000418777  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0803  prophage antirepressor  34.5 
 
 		 257 aa  105  6e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000145423  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1060  prophage antirepressor  51.96 
 
 		 262 aa  103  4e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000214143  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0555  prophage LambdaSa1, antirepressor, putative  43.65 
 
 		 249 aa  102  7e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3440  prophage antirepressor  45.79 
 
 		 285 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000105678  unclonable  9.66468e-17 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1367  prophage antirepressor  31.33 
 
 		 264 aa  97.1  3e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000214644  unclonable  1.53039e-25 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5813  prophage antirepressor  27.38 
 
 		 256 aa  92.4  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1825  prophage antirepressor  51.09 
 
 		 535 aa  88.2  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1205  prophage antirepressor  51.09 
 
 		 535 aa  88.2  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.312147  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1118  BRO domain-containing protein  43.4 
 
 		 247 aa  85.5  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.296909  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2475  prophage antirepressor  29.89 
 
 		 261 aa  81.6  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000554878  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2462  BRO-like protein  25.97 
 
 		 248 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000468179  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3073  prophage antirepressor  29.02 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.229766  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0554  prophage antirepressor  29.63 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.239939  hitchhiker  0.000124341 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2135  phage-encoded protein  29.35 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000332219  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1177  hypothetical protein  38.54 
 
 		 420 aa  72.4  0.000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.163274  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1874  prophage antirepressor  26.18 
 
 		 299 aa  72  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000268327  normal  0.0527213 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1161  hypothetical protein  37.74 
 
 		 193 aa  71.6  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00000000330342  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1322  prophage antirepressor  32.2 
 
 		 236 aa  71.2  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000035001  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1867  prophage antirepressor  31.58 
 
 		 272 aa  68.9  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000186522  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0898  prophage antirepressor  37.98 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.798648  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1877  prophage LambdaSa2, antirepressor protein, putative  30.34 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0256664  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1181  prophage antirepressor  33.67 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000354678  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3740  prophage antirepressor  33.02 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3791  prophage antirepressor  33.02 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1083  BRO family protein  33.62 
 
 		 134 aa  57.4  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100944  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3227  prophage antirepressor  37.76 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.323772  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2642  hypothetical protein  26.82 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.226633  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1644  BRO domain-containing protein  27.41 
 
 		 239 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0834656  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0789  BRO, N-terminal  29.68 
 
 		 172 aa  55.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000825833 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2133  phage antirepressor protein  24.73 
 
 		 244 aa  55.5  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2513  BRO, N-terminal  29.33 
 
 		 172 aa  55.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0512852  normal  0.446294 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4013  BRO domain-containing protein  33.33 
 
 		 284 aa  53.9  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3254  prophage antirepressor  35.2 
 
 		 270 aa  53.5  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000711854  decreased coverage  0.00000000000000707487 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2342  Prophage antirepressor protein  30.16 
 
 		 263 aa  53.1  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0278  BRO family protein  27.43 
 
 		 140 aa  52.8  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000343854  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0258  BRO family protein  27.43 
 
 		 140 aa  52.8  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0524  prophage antirepressor  27.49 
 
 		 259 aa  52  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.844398  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1864  prophage antirepressor  24.88 
 
 		 293 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.886046 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2380  BRO domain-containing protein  34.29 
 
 		 335 aa  50.4  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.016925  normal  0.26363 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3400  prophage antirepressor  32.67 
 
 		 284 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000183753  unclonable  1.97476e-16 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2402  prophage antirepressor  44.19 
 
 		 230 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2795  prophage antirepressor-like  36.73 
 
 		 197 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_013208  Aaci_3150  prophage antirepressor  30.93 
 
 		 206 aa  48.5  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3521  BRO, N-terminal  32.65 
 
 		 199 aa  47.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000239324  decreased coverage  0.000343043 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1073  BRO family protein  34.34 
 
 		 313 aa  47.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00174599  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1741  prophage antirepressor-like  35.71 
 
 		 184 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.729676  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1398  prophage antirepressor  52.38 
 
 		 204 aa  48.1  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.178309  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3546  BRO-like  25.98 
 
 		 191 aa  47  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.301745  normal  0.324893 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3552  BRO-like  25.98 
 
 		 191 aa  47  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.815124  normal  0.1258 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0139  BRO domain-containing protein  28.93 
 
 		 191 aa  46.6  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.598761  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0930  BRO domain-containing protein  31.03 
 
 		 243 aa  46.6  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0480253  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0797  BRO, N-terminal  35.35 
 
 		 111 aa  46.6  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.651064  hitchhiker  0.00000114436 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2185  putative antirepressor protein encoded by prophage CP-933N  29.13 
 
 		 192 aa  46.2  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0690247  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0575  prophage antirepressor  31.09 
 
 		 295 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4120  prophage antirepressor  30.39 
 
 		 192 aa  45.8  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0152271  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1555  antirepressor protein  28.93 
 
 		 292 aa  44.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0345805  hitchhiker  0.000277946 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1061  prophage antirepressor-like protein  30.58 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000179859  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2504  BRO family protein  36.36 
 
 		 58 aa  43.9  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.880081 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0902  prophage antirepressor  26.38 
 
 		 226 aa  42.4  0.008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1000  BRO family protein  24.49 
 
 		 211 aa  42.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.173667  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a013  putative antirepressor, BRO family  47.5 
 
 		 183 aa  42  0.01  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>