40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0139 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0139  BRO domain-containing protein  100 
 
 		 191 aa  379  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.598761  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0803  prophage antirepressor  33.59 
 
 		 257 aa  67  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000145423  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1877  prophage LambdaSa2, antirepressor protein, putative  34.11 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0256664  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1000  BRO family protein  28.47 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.173667  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1142  phage antirepressor protein  30.83 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000418777  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2402  prophage antirepressor  28.03 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1740  BRO-like protein  33.33 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000880579  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1322  prophage antirepressor  30.28 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000035001  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1644  BRO domain-containing protein  27.07 
 
 		 239 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0834656  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1804  prophage antirepressor  32.46 
 
 		 244 aa  54.3  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1118  BRO domain-containing protein  29.77 
 
 		 247 aa  52.8  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.296909  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1161  hypothetical protein  27.82 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00000000330342  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1177  hypothetical protein  27.48 
 
 		 420 aa  50.4  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.163274  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1060  prophage antirepressor  26.92 
 
 		 262 aa  50.4  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000214143  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1825  prophage antirepressor  33.01 
 
 		 535 aa  49.3  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1205  prophage antirepressor  33.01 
 
 		 535 aa  49.3  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.312147  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3254  prophage antirepressor  27.69 
 
 		 270 aa  48.9  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000711854  decreased coverage  0.00000000000000707487 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2135  phage-encoded protein  27.94 
 
 		 260 aa  48.9  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000332219  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4013  BRO domain-containing protein  25.74 
 
 		 284 aa  48.5  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2462  BRO-like protein  26.83 
 
 		 248 aa  47.4  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000468179  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3440  prophage antirepressor  25.6 
 
 		 285 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000105678  unclonable  9.66468e-17 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2133  phage antirepressor protein  22.73 
 
 		 244 aa  47  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1181  prophage antirepressor  25 
 
 		 188 aa  46.6  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000354678  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1649  BRO-like protein  28.93 
 
 		 265 aa  47  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000543299  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2795  prophage antirepressor-like  38.6 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5813  prophage antirepressor  27.41 
 
 		 256 aa  46.2  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0225  prophage antirepressor  30.89 
 
 		 180 aa  44.7  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.285205  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3791  prophage antirepressor  25 
 
 		 283 aa  44.7  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013208  Aaci_3150  prophage antirepressor  25 
 
 		 206 aa  44.7  0.0009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3740  prophage antirepressor  25 
 
 		 283 aa  44.7  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1235  prophage antirepressor  23.48 
 
 		 263 aa  44.3  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298657  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1741  prophage antirepressor-like  36.84 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.729676  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1555  antirepressor protein  28.26 
 
 		 292 aa  42.7  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0345805  hitchhiker  0.000277946 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3521  BRO, N-terminal  25.4 
 
 		 199 aa  42.7  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000239324  decreased coverage  0.000343043 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0554  prophage antirepressor  25.18 
 
 		 269 aa  42.7  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.239939  hitchhiker  0.000124341 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0797  BRO, N-terminal  35.19 
 
 		 111 aa  43.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.651064  hitchhiker  0.00000114436 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1867  prophage antirepressor  25.6 
 
 		 272 aa  42.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000186522  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1315  prophage antirepressor  25.47 
 
 		 256 aa  41.6  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.930298  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1083  BRO family protein  27.07 
 
 		 134 aa  41.6  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100944  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3227  prophage antirepressor  25.76 
 
 		 252 aa  41.2  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.323772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>