41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_0855 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_0871  BRO domain-containing protein  100 
 
 
255 aa  525  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0855  prophage antirepressor  100 
 
 
255 aa  525  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1649  BRO-like protein  41.85 
 
 
265 aa  148  8e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000543299  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1235  prophage antirepressor  38.14 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298657  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1740  BRO-like protein  29.3 
 
 
254 aa  104  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000880579  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0555  prophage LambdaSa1, antirepressor, putative  47.27 
 
 
249 aa  101  9e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0930  BRO domain-containing protein  47.83 
 
 
243 aa  95.5  8e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0480253  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0803  prophage antirepressor  41.51 
 
 
257 aa  84.7  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000145423  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2852  AntA/AntB antirepressor domain protein  40.57 
 
 
250 aa  84  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000203262  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0382  phage antirepressor protein, putative  40.57 
 
 
250 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000707014  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1142  phage antirepressor protein  40.78 
 
 
267 aa  82.8  0.000000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000418777  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1367  prophage antirepressor  26.32 
 
 
264 aa  79  0.00000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000214644  unclonable  1.53039e-25 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5813  prophage antirepressor  36.54 
 
 
256 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2475  prophage antirepressor  30 
 
 
261 aa  68.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000554878  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1874  prophage antirepressor  31.39 
 
 
299 aa  55.5  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000268327  normal  0.0527213 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3073  prophage antirepressor  26.34 
 
 
270 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.229766  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2462  BRO-like protein  28.18 
 
 
248 aa  53.1  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000468179  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1198  putative DNA-binding protein (Roi)  30.53 
 
 
275 aa  52  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0554  prophage antirepressor  25.1 
 
 
269 aa  51.6  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.239939  hitchhiker  0.000124341 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1867  prophage antirepressor  47.17 
 
 
272 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000186522  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2795  prophage antirepressor-like  36.04 
 
 
197 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1741  prophage antirepressor-like  36.04 
 
 
184 aa  49.7  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.729676  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1804  prophage antirepressor  26.38 
 
 
244 aa  48.1  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1118  BRO domain-containing protein  28 
 
 
247 aa  47.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.296909  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2402  prophage antirepressor  31.78 
 
 
230 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2135  phage-encoded protein  32.94 
 
 
260 aa  47  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000332219  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1398  prophage antirepressor  52.5 
 
 
204 aa  46.6  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.178309  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3440  prophage antirepressor  29.25 
 
 
285 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000105678  unclonable  9.66468e-17 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0898  prophage antirepressor  28.28 
 
 
217 aa  43.5  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.798648  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1177  hypothetical protein  29.32 
 
 
420 aa  43.5  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.163274  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3227  prophage antirepressor  25.13 
 
 
252 aa  43.5  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.323772  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2342  Prophage antirepressor protein  28.41 
 
 
263 aa  43.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a013  putative antirepressor, BRO family  41.86 
 
 
183 aa  43.1  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2504  BRO family protein  37.25 
 
 
58 aa  43.5  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.880081 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1070  AntA/AntB family antirepressor  26.05 
 
 
247 aa  43.5  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1181  prophage antirepressor  22.02 
 
 
188 aa  42.7  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000354678  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1877  prophage LambdaSa2, antirepressor protein, putative  32.5 
 
 
236 aa  43.1  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0256664  n/a   
 
 
-
 
NC_013208  Aaci_3150  prophage antirepressor  31.13 
 
 
206 aa  42.7  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2133  phage antirepressor protein  28.57 
 
 
244 aa  42.4  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0524  prophage antirepressor  28.26 
 
 
259 aa  42.4  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.844398  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1083  BRO family protein  45 
 
 
134 aa  42  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>