25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0930 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0930  BRO domain-containing protein  100 
 
 		 243 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0480253  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1505  antirepressor  34.76 
 
 		 252 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.116394 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0871  BRO domain-containing protein  47.83 
 
 		 255 aa  95.5  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0855  prophage antirepressor  47.83 
 
 		 255 aa  95.5  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2967  hypothetical protein  43.16 
 
 		 278 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000420619  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2475  prophage antirepressor  27.67 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000554878  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2133  phage antirepressor protein  36.11 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3440  prophage antirepressor  27.92 
 
 		 285 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000105678  unclonable  9.66468e-17 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1867  prophage antirepressor  29.01 
 
 		 272 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000186522  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1740  BRO-like protein  27.71 
 
 		 254 aa  47.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000880579  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1649  BRO-like protein  31.03 
 
 		 265 aa  46.6  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000543299  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2795  prophage antirepressor-like  32.46 
 
 		 197 aa  47  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1804  prophage antirepressor  29.03 
 
 		 244 aa  47  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1118  BRO domain-containing protein  28.93 
 
 		 247 aa  46.2  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.296909  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1741  prophage antirepressor-like  26.67 
 
 		 184 aa  45.8  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.729676  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1877  prophage LambdaSa2, antirepressor protein, putative  26.67 
 
 		 236 aa  45.4  0.0007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0256664  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1398  prophage antirepressor  45.45 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.178309  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3917  prophage antirepressor  27.46 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0381452  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1073  BRO family protein  24.81 
 
 		 313 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00174599  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2402  prophage antirepressor  25.35 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2462  BRO-like protein  31.25 
 
 		 248 aa  42.7  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000468179  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1644  BRO domain-containing protein  31.51 
 
 		 239 aa  42.4  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0834656  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1083  BRO family protein  28.95 
 
 		 134 aa  42.4  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100944  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1061  prophage antirepressor-like protein  27.73 
 
 		 210 aa  42  0.01  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000179859  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1874  prophage antirepressor  33.33 
 
 		 299 aa  42  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000268327  normal  0.0527213 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>