22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1415 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1415  prophage antirepressor  100 
 
 		 221 aa  462  1e-129  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000182946  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1645  prophage antirepressor  48.03 
 
 		 294 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1058  BRO domain-containing protein  50.41 
 
 		 225 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4931  prophage antirepressor-like protein  42.97 
 
 		 353 aa  108  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2178  hypothetical protein  44.63 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2212  hypothetical protein  44.44 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.803951  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0323  hypothetical protein  45.54 
 
 		 208 aa  95.5  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.161575  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1061  prophage antirepressor-like protein  41.51 
 
 		 210 aa  92.8  3e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000179859  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0652  gp30  40 
 
 		 212 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0371314  hitchhiker  0.0000154147 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1080  prophage antirepressor-like protein  41.18 
 
 		 206 aa  87.4  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174443  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2513  BRO, N-terminal  33.67 
 
 		 172 aa  51.2  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0512852  normal  0.446294 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0998  hypothetical protein  29.66 
 
 		 356 aa  50.1  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000328283 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1060  prophage antirepressor  28.85 
 
 		 262 aa  45.8  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000214143  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0789  BRO, N-terminal  30.93 
 
 		 172 aa  45.4  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000825833 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1118  BRO domain-containing protein  23.47 
 
 		 247 aa  44.3  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.296909  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1205  prophage antirepressor  24 
 
 		 535 aa  44.3  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.312147  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1825  prophage antirepressor  24 
 
 		 535 aa  44.3  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3521  BRO, N-terminal  30.85 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000239324  decreased coverage  0.000343043 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1000  BRO family protein  31.52 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.173667  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3254  prophage antirepressor  29.59 
 
 		 270 aa  43.1  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000711854  decreased coverage  0.00000000000000707487 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1714  BRO family protein, truncation  26.92 
 
 		 101 aa  43.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109606  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1804  prophage antirepressor  28.32 
 
 		 244 aa  42.7  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>