22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3359 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3359  phage-encoded protein-like  100 
 
 		 259 aa  535  1e-151  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2408  phage-encoded protein-like  80.31 
 
 		 254 aa  417  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.665477  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3542  DNA-binding protein Roi  43.5 
 
 		 240 aa  133  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.206304  hitchhiker  0.00000000735314 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3775  hypothetical protein  36.29 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000000000361227  hitchhiker  0.000220505 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1198  putative DNA-binding protein (Roi)  40.93 
 
 		 275 aa  122  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2913  Roi protein  39.59 
 
 		 240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00203388  hitchhiker  0.00000000000553867 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1250  hypothetical protein  38.34 
 
 		 235 aa  103  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000878472  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1690  uncharacterized phage-encoded protein  34.54 
 
 		 236 aa  92.8  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637795 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01961  hypothetical protein  29.57 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3395  phage-encoded protein  28.84 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000514274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6402  anti-repressor protein  40.91 
 
 		 88 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0306  DNA-binding protein Roi  34.74 
 
 		 247 aa  52  0.000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000394975  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1112  DNA-binding protein Roi  34.74 
 
 		 247 aa  52  0.000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000052914  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2481  hypothetical protein  25.97 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0996832 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2652  Rha family phage regulatory protein  25.63 
 
 		 290 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1435  DNA-binding protein Roi  29.13 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2183  phage regulatory protein  23.5 
 
 		 265 aa  43.5  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.408291 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1864  prophage antirepressor  29.77 
 
 		 293 aa  43.9  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.886046 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1804  prophage antirepressor  27.55 
 
 		 244 aa  42.7  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3221  hypothetical protein  24.71 
 
 		 237 aa  42.7  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.393793  normal  0.185811 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0869  Phage regulatory protein, Rha-like protein  28.57 
 
 		 231 aa  42.4  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2502  Rha family phage regulatory protein  27.07 
 
 		 200 aa  42  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526208  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>