47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4934 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4934  hypothetical protein  100 
 
 
422 aa  847    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4508  hypothetical protein  72.48 
 
 
439 aa  598  1e-170  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.260066 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0750  domain of unknown function DUF1745  67.91 
 
 
426 aa  533  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0622  hypothetical protein  65.12 
 
 
427 aa  526  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0306  hypothetical protein  63.89 
 
 
447 aa  526  1e-148  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3160  domain of unknown function DUF1745  70.05 
 
 
421 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3887  hypothetical protein  70.05 
 
 
421 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.894307 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0450  hypothetical protein  63.74 
 
 
430 aa  509  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2266  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3636  hypothetical protein  54.98 
 
 
408 aa  410  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0371475  normal  0.276921 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3261  hypothetical protein  56.6 
 
 
419 aa  390  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.389498 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5581  hypothetical protein  47.97 
 
 
396 aa  347  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.19369  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0438  domain of unknown function DUF1745  47.22 
 
 
398 aa  325  1e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2912  hypothetical protein  46.92 
 
 
387 aa  306  4.0000000000000004e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0527  hypothetical protein  47.88 
 
 
411 aa  301  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.437223  hitchhiker  0.00000299697 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1387  hypothetical protein  35.7 
 
 
378 aa  240  4e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1108  domain of unknown function DUF1745  35.7 
 
 
378 aa  240  4e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0889  hypothetical protein  37.05 
 
 
374 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3242  domain of unknown function DUF1745  35.1 
 
 
371 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0186777  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2568  FIST C domain protein  32.24 
 
 
375 aa  168  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0105627  normal  0.0110126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8558  hypothetical protein  29.75 
 
 
398 aa  99.8  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1049  hypothetical protein  25.73 
 
 
406 aa  94.7  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198533 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1561  hypothetical protein  25.93 
 
 
404 aa  94  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0360  hypothetical protein  24.5 
 
 
398 aa  92.8  9e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.435591  normal  0.396986 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3113  hypothetical protein  30.58 
 
 
397 aa  91.3  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.680527  hitchhiker  0.0000208643 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4078  domain of unknown function DUF1745  21.19 
 
 
411 aa  87  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0913  domain of unknown function DUF1745  22.12 
 
 
414 aa  86.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4241  domain of unknown function DUF1745  23.75 
 
 
411 aa  86.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000432273  hitchhiker  0.00000452646 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0940  domain of unknown function DUF1745  22.12 
 
 
414 aa  86.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1891  hypothetical protein  30.15 
 
 
391 aa  85.9  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.473859  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24381  hypothetical protein  24.46 
 
 
429 aa  83.6  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1055  domain of unknown function DUF1745  28.22 
 
 
389 aa  78.2  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4044  hypothetical protein  27.17 
 
 
401 aa  76.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3390  hypothetical protein  23.4 
 
 
414 aa  75.1  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.0973611 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3246  domain of unknown function DUF1745  25.88 
 
 
396 aa  73.6  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116005  normal  0.61148 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10639  hypothetical protein  28.63 
 
 
383 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000135133  normal  0.805152 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1400  domain of unknown function DUF1745  27.08 
 
 
398 aa  72.8  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.653815  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10891  hypothetical protein  29.75 
 
 
386 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.824347  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2063  hypothetical protein  24.39 
 
 
425 aa  71.6  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.748308  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0444  hypothetical protein  26.97 
 
 
412 aa  65.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3254  domain of unknown function DUF1745  27.46 
 
 
385 aa  63.2  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126453  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0281  hypothetical protein  24.89 
 
 
431 aa  61.6  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.812324  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2119  hypothetical protein  22.79 
 
 
402 aa  61.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0091  domain of unknown function DUF1745  27.05 
 
 
383 aa  58.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189874  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2864  domain of unknown function DUF1745  24.91 
 
 
396 aa  57.4  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.965957  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1352  domain of unknown function DUF1745  24.54 
 
 
396 aa  55.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3322200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2191  diguanylate cyclase  22.69 
 
 
806 aa  53.1  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00068502 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4131  domain of unknown function DUF1745  21.77 
 
 
396 aa  44.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>