54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3261 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3261  hypothetical protein  100 
 
 		 419 aa  828    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.389498 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3636  hypothetical protein  59.33 
 
 		 408 aa  464  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0371475  normal  0.276921 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4508  hypothetical protein  57.89 
 
 		 439 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260066 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4934  hypothetical protein  57.55 
 
 		 422 aa  434  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3160  domain of unknown function DUF1745  59.24 
 
 		 421 aa  414  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3887  hypothetical protein  59.24 
 
 		 421 aa  414  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.894307 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0306  hypothetical protein  54.86 
 
 		 447 aa  413  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0750  domain of unknown function DUF1745  54.67 
 
 		 426 aa  411  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0622  hypothetical protein  53.58 
 
 		 427 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0450  hypothetical protein  54.5 
 
 		 430 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5581  hypothetical protein  53.16 
 
 		 396 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.19369  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0438  domain of unknown function DUF1745  52.65 
 
 		 398 aa  335  1e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2912  hypothetical protein  47.96 
 
 		 387 aa  315  9.999999999999999e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0889  hypothetical protein  38.58 
 
 		 374 aa  231  3e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0527  hypothetical protein  40.38 
 
 		 411 aa  221  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.437223  hitchhiker  0.00000299697 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1387  hypothetical protein  35.06 
 
 		 378 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1108  domain of unknown function DUF1745  35.06 
 
 		 378 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3242  domain of unknown function DUF1745  36.22 
 
 		 371 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0186777  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2568  FIST C domain protein  33.68 
 
 		 375 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0105627  normal  0.0110126 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0360  hypothetical protein  28.1 
 
 		 398 aa  124  3e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.435591  normal  0.396986 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1561  hypothetical protein  27.55 
 
 		 404 aa  120  3.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8558  hypothetical protein  35.44 
 
 		 398 aa  120  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3113  hypothetical protein  38.34 
 
 		 397 aa  117  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.680527  hitchhiker  0.0000208643 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1049  hypothetical protein  29.1 
 
 		 406 aa  113  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198533 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4241  domain of unknown function DUF1745  27.56 
 
 		 411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000432273  hitchhiker  0.00000452646 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4078  domain of unknown function DUF1745  27.32 
 
 		 411 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4044  hypothetical protein  27.95 
 
 		 401 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1891  hypothetical protein  32.74 
 
 		 391 aa  101  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.473859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0940  domain of unknown function DUF1745  26.56 
 
 		 414 aa  99.8  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0913  domain of unknown function DUF1745  26.56 
 
 		 414 aa  99.8  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24381  hypothetical protein  26.46 
 
 		 429 aa  97.1  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3246  domain of unknown function DUF1745  28.2 
 
 		 396 aa  96.3  9e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116005  normal  0.61148 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1055  domain of unknown function DUF1745  32.23 
 
 		 389 aa  95.9  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3390  hypothetical protein  26.93 
 
 		 414 aa  95.9  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.0973611 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0444  hypothetical protein  33.05 
 
 		 412 aa  91.7  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10891  hypothetical protein  31.45 
 
 		 386 aa  89  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.824347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10639  hypothetical protein  31.3 
 
 		 383 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000135133  normal  0.805152 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2063  hypothetical protein  24.24 
 
 		 425 aa  85.5  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.748308  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1400  domain of unknown function DUF1745  28.76 
 
 		 398 aa  82  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.653815  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0091  domain of unknown function DUF1745  32.77 
 
 		 383 aa  77  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3254  domain of unknown function DUF1745  31.82 
 
 		 385 aa  75.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126453  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0281  hypothetical protein  25.89 
 
 		 431 aa  73.9  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.812324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2119  hypothetical protein  24.53 
 
 		 402 aa  63.9  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1241  hypothetical protein  27.27 
 
 		 381 aa  63.2  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1352  domain of unknown function DUF1745  27.04 
 
 		 396 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3322200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2864  domain of unknown function DUF1745  26.67 
 
 		 396 aa  57.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.965957  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2659  hypothetical protein  29.78 
 
 		 406 aa  57  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2191  diguanylate cyclase  23.08 
 
 		 806 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00068502 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4131  domain of unknown function DUF1745  25.37 
 
 		 396 aa  53.9  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4040  domain of unknown function DUF1745  23.86 
 
 		 396 aa  52.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0911  hypothetical protein  23.46 
 
 		 400 aa  49.3  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.36206  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1899  hypothetical protein  24.3 
 
 		 395 aa  47.4  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.598311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2954  hypothetical protein  26.8 
 
 		 395 aa  45.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1520  domain of unknown function DUF1745  25.41 
 
 		 1101 aa  44.3  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.593307 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>