73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8558 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8558  hypothetical protein  100 
 
 
398 aa  788    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3113  hypothetical protein  73.97 
 
 
397 aa  579  1e-164  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.680527  hitchhiker  0.0000208643 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1055  domain of unknown function DUF1745  58.96 
 
 
389 aa  426  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0091  domain of unknown function DUF1745  57.18 
 
 
383 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189874  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0444  hypothetical protein  57.81 
 
 
412 aa  404  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1891  hypothetical protein  52.99 
 
 
391 aa  370  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.473859  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1400  domain of unknown function DUF1745  38.07 
 
 
398 aa  256  3e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.653815  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10639  hypothetical protein  46.36 
 
 
383 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000135133  normal  0.805152 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3254  domain of unknown function DUF1745  45.03 
 
 
385 aa  247  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126453  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10891  hypothetical protein  44.55 
 
 
386 aa  246  6.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.824347  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3246  domain of unknown function DUF1745  38.81 
 
 
396 aa  231  2e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116005  normal  0.61148 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1561  hypothetical protein  34.69 
 
 
404 aa  213  3.9999999999999995e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1049  hypothetical protein  34.02 
 
 
406 aa  206  7e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198533 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4044  hypothetical protein  35.64 
 
 
401 aa  203  6e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3390  hypothetical protein  36.45 
 
 
414 aa  195  1e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.0973611 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4078  domain of unknown function DUF1745  34.95 
 
 
411 aa  192  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0940  domain of unknown function DUF1745  32.58 
 
 
414 aa  189  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0913  domain of unknown function DUF1745  32.58 
 
 
414 aa  189  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4241  domain of unknown function DUF1745  31.48 
 
 
411 aa  189  9e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000432273  hitchhiker  0.00000452646 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0360  hypothetical protein  30.65 
 
 
398 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.435591  normal  0.396986 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24381  hypothetical protein  31.02 
 
 
429 aa  156  7e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0281  hypothetical protein  33.33 
 
 
431 aa  148  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.812324  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2063  hypothetical protein  32.2 
 
 
425 aa  140  3.9999999999999997e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.748308  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4040  domain of unknown function DUF1745  29.37 
 
 
396 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0889  hypothetical protein  31.03 
 
 
374 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4131  domain of unknown function DUF1745  29.1 
 
 
396 aa  125  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1108  domain of unknown function DUF1745  33.94 
 
 
378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1387  hypothetical protein  33.94 
 
 
378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3636  hypothetical protein  30.2 
 
 
408 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0371475  normal  0.276921 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2119  hypothetical protein  25.71 
 
 
402 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3261  hypothetical protein  35.32 
 
 
419 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.389498 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0438  domain of unknown function DUF1745  32.98 
 
 
398 aa  111  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3242  domain of unknown function DUF1745  31.66 
 
 
371 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0186777  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2864  domain of unknown function DUF1745  27.11 
 
 
396 aa  107  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.965957  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1352  domain of unknown function DUF1745  26.84 
 
 
396 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3322200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3887  hypothetical protein  30.57 
 
 
421 aa  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.894307 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3160  domain of unknown function DUF1745  30.57 
 
 
421 aa  105  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0306  hypothetical protein  29.79 
 
 
447 aa  102  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2912  hypothetical protein  32.64 
 
 
387 aa  100  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4934  hypothetical protein  29.75 
 
 
422 aa  99.8  9e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4508  hypothetical protein  29.67 
 
 
439 aa  98.2  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.260066 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2568  FIST C domain protein  29.86 
 
 
375 aa  96.3  8e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0105627  normal  0.0110126 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5581  hypothetical protein  33.2 
 
 
396 aa  96.3  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.19369  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0450  hypothetical protein  29.18 
 
 
430 aa  96.3  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2266  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0750  domain of unknown function DUF1745  30.55 
 
 
426 aa  94  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0622  hypothetical protein  27.94 
 
 
427 aa  89.7  8e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1241  hypothetical protein  26.35 
 
 
381 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29005  predicted protein  26.11 
 
 
313 aa  70.5  0.00000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.161534  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2191  diguanylate cyclase  25.4 
 
 
806 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00068502 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0527  hypothetical protein  28.82 
 
 
411 aa  65.1  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.437223  hitchhiker  0.00000299697 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1899  hypothetical protein  25.07 
 
 
395 aa  64.7  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.598311  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1154  hypothetical protein  30.84 
 
 
338 aa  63.5  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2954  hypothetical protein  29.89 
 
 
395 aa  62.8  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2659  hypothetical protein  24.93 
 
 
406 aa  62.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4141  hypothetical protein  27.89 
 
 
365 aa  61.6  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0911  hypothetical protein  23.04 
 
 
400 aa  61.6  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.36206  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2151  hypothetical protein  22.89 
 
 
383 aa  61.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.509879 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3322  domain of unknown function DUF1745  26.7 
 
 
373 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3141  hypothetical protein  22.97 
 
 
460 aa  55.1  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0012  hypothetical protein  26.77 
 
 
379 aa  54.7  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0572769  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1269  hypothetical protein  23.82 
 
 
387 aa  53.5  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0852  hypothetical protein  24.73 
 
 
366 aa  51.6  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.214609  normal  0.0568349 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0996  hypothetical protein  24.73 
 
 
366 aa  51.6  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0343118  normal  0.112953 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1520  domain of unknown function DUF1745  24.65 
 
 
1101 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.593307 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2665  domain of unknown function DUF1745  26.39 
 
 
427 aa  46.2  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.955158 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3344  hypothetical protein  24.36 
 
 
464 aa  46.2  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1476  domain of unknown function DUF1745  24.02 
 
 
629 aa  45.1  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.153758  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0268  diguanylate cyclase  20.05 
 
 
933 aa  44.7  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0380534  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3657  domain of unknown function DUF1745  24.38 
 
 
416 aa  44.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4045  hypothetical protein  24.58 
 
 
378 aa  44.3  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0690  hypothetical protein  26.35 
 
 
376 aa  43.9  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000847515 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0700  hypothetical protein  22.88 
 
 
380 aa  43.5  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.155862  normal  0.0832434 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0294  hypothetical protein  23.16 
 
 
375 aa  42.7  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>