57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2659 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2659  hypothetical protein  100 
 
 		 406 aa  822    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2191  diguanylate cyclase  35.61 
 
 		 806 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00068502 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1352  domain of unknown function DUF1745  27.98 
 
 		 396 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3322200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2864  domain of unknown function DUF1745  27.74 
 
 		 396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.965957  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2119  hypothetical protein  26.34 
 
 		 402 aa  106  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4131  domain of unknown function DUF1745  27.95 
 
 		 396 aa  100  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4040  domain of unknown function DUF1745  27.23 
 
 		 396 aa  95.9  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2079  domain of unknown function DUF1745  24.82 
 
 		 417 aa  73.2  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00286991  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0690  hypothetical protein  28.25 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000847515 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1269  hypothetical protein  24.53 
 
 		 387 aa  66.6  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3636  hypothetical protein  28.51 
 
 		 408 aa  65.5  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0371475  normal  0.276921 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1909  domain of unknown function DUF1745  24.29 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2665  domain of unknown function DUF1745  30.27 
 
 		 427 aa  64.3  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.955158 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2151  hypothetical protein  22.92 
 
 		 383 aa  63.5  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.509879 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3246  domain of unknown function DUF1745  26.47 
 
 		 396 aa  63.2  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116005  normal  0.61148 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3113  hypothetical protein  25.26 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.680527  hitchhiker  0.0000208643 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8558  hypothetical protein  24.93 
 
 		 398 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1561  hypothetical protein  24.9 
 
 		 404 aa  60.5  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2153  hypothetical protein  25.3 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2107  domain of unknown function DUF1745  25.19 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.206498 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3322  domain of unknown function DUF1745  25.93 
 
 		 373 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1435  hypothetical protein  26.46 
 
 		 501 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.95663  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3254  domain of unknown function DUF1745  27.75 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126453  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1899  hypothetical protein  24.62 
 
 		 395 aa  57  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.598311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0824  hypothetical protein  26.05 
 
 		 379 aa  56.6  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3887  hypothetical protein  27.8 
 
 		 421 aa  55.5  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.894307 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3160  domain of unknown function DUF1745  27.8 
 
 		 421 aa  55.5  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1049  hypothetical protein  26.32 
 
 		 406 aa  54.7  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198533 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10639  hypothetical protein  26.79 
 
 		 383 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000135133  normal  0.805152 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0622  hypothetical protein  27.38 
 
 		 427 aa  52.4  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0438  domain of unknown function DUF1745  29.02 
 
 		 398 aa  52.4  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4044  hypothetical protein  26.52 
 
 		 401 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4141  hypothetical protein  26.59 
 
 		 365 aa  51.2  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3261  hypothetical protein  29.78 
 
 		 419 aa  51.2  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.389498 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24381  hypothetical protein  24.32 
 
 		 429 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0306  hypothetical protein  27.54 
 
 		 447 aa  50.8  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3657  domain of unknown function DUF1745  25.93 
 
 		 416 aa  50.8  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2912  hypothetical protein  28.7 
 
 		 387 aa  50.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2954  hypothetical protein  28.1 
 
 		 395 aa  50.1  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1891  hypothetical protein  24.46 
 
 		 391 aa  49.3  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.473859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4508  hypothetical protein  27.2 
 
 		 439 aa  48.9  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260066 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1369  hypothetical protein  24.38 
 
 		 468 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5581  hypothetical protein  27.75 
 
 		 396 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.19369  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0911  hypothetical protein  23.42 
 
 		 400 aa  48.5  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.36206  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1108  domain of unknown function DUF1745  26.27 
 
 		 378 aa  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1387  hypothetical protein  26.27 
 
 		 378 aa  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0696  transcriptional regulator, TrmB  29.24 
 
 		 512 aa  47.8  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10891  hypothetical protein  25.93 
 
 		 386 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.824347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3242  domain of unknown function DUF1745  28.36 
 
 		 371 aa  47.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0186777  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1520  domain of unknown function DUF1745  23.76 
 
 		 1101 aa  47  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.593307 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0550  hypothetical protein  23.41 
 
 		 467 aa  46.6  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2568  FIST C domain protein  26.6 
 
 		 375 aa  46.6  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0105627  normal  0.0110126 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1400  domain of unknown function DUF1745  24.53 
 
 		 398 aa  45.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.653815  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0288  hypothetical protein  22.73 
 
 		 467 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0750  domain of unknown function DUF1745  27.08 
 
 		 426 aa  45.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0012  hypothetical protein  25.42 
 
 		 379 aa  43.9  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0572769  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0444  hypothetical protein  23.81 
 
 		 412 aa  43.9  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>