69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0294 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0294  hypothetical protein  100 
 
 
375 aa  767    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1520  domain of unknown function DUF1745  27.87 
 
 
1101 aa  124  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.593307 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0012  hypothetical protein  27.67 
 
 
379 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0572769  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3184  hypothetical protein  26.57 
 
 
377 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1899  hypothetical protein  26.85 
 
 
395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.598311  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4141  hypothetical protein  27.05 
 
 
365 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0140  FIST C domain protein  30.14 
 
 
379 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2954  hypothetical protein  25.73 
 
 
395 aa  105  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3322  domain of unknown function DUF1745  24.86 
 
 
373 aa  103  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0354  hypothetical protein  24.04 
 
 
387 aa  99.8  7e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0331  hypothetical protein  24.59 
 
 
387 aa  99.8  7e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0268  diguanylate cyclase  28.21 
 
 
933 aa  97.4  4e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0380534  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2151  hypothetical protein  25.33 
 
 
383 aa  95.1  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.509879 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2107  domain of unknown function DUF1745  26.02 
 
 
401 aa  92.8  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.206498 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2079  domain of unknown function DUF1745  25.86 
 
 
417 aa  90.1  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00286991  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1203  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  26.28 
 
 
932 aa  88.6  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00343755  normal  0.259486 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2153  hypothetical protein  27.01 
 
 
400 aa  87.8  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1909  domain of unknown function DUF1745  26.47 
 
 
408 aa  87.4  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1476  domain of unknown function DUF1745  26.98 
 
 
629 aa  81.6  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.153758  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2305  domain of unknown function DUF1745  25.21 
 
 
389 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3884  domain of unknown function DUF1745  25.64 
 
 
1852 aa  76.6  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1241  hypothetical protein  24.9 
 
 
381 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0690  hypothetical protein  23.28 
 
 
376 aa  73.2  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000847515 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1202  fused sensor protein/response regulator  25.4 
 
 
934 aa  69.3  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127641  normal  0.087847 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4044  hypothetical protein  24.81 
 
 
401 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4131  domain of unknown function DUF1745  23.48 
 
 
396 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2864  domain of unknown function DUF1745  25.09 
 
 
396 aa  65.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.965957  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1352  domain of unknown function DUF1745  24.73 
 
 
396 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3322200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4040  domain of unknown function DUF1745  23.02 
 
 
396 aa  64.7  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3254  domain of unknown function DUF1745  26.18 
 
 
385 aa  63.2  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126453  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1049  hypothetical protein  25.59 
 
 
406 aa  62.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198533 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1204  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  25.32 
 
 
931 aa  61.2  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.271509 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1269  hypothetical protein  22.07 
 
 
387 aa  60.1  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2119  hypothetical protein  23.7 
 
 
402 aa  60.1  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0360  hypothetical protein  24.72 
 
 
398 aa  56.6  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.435591  normal  0.396986 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2665  domain of unknown function DUF1745  23.53 
 
 
427 aa  55.8  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.955158 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002115  sensory box/GGDEF family protein  23.14 
 
 
828 aa  54.3  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3344  hypothetical protein  23.9 
 
 
464 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3246  domain of unknown function DUF1745  22.63 
 
 
396 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116005  normal  0.61148 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2940  hypothetical protein  24.69 
 
 
402 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00513133 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3141  hypothetical protein  24.01 
 
 
460 aa  48.9  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00305  sensory transduction protein kinase  20.57 
 
 
828 aa  48.1  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10639  hypothetical protein  24.77 
 
 
383 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000135133  normal  0.805152 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2479  hypothetical protein  27.27 
 
 
379 aa  48.5  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.492023 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3242  domain of unknown function DUF1745  25.44 
 
 
371 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0186777  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0688  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  22.22 
 
 
951 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00399648  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2339  domain of unknown function DUF1745  24.89 
 
 
383 aa  47.4  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4078  domain of unknown function DUF1745  21.76 
 
 
411 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0732  hypothetical protein  26.23 
 
 
386 aa  47  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2474  hypothetical protein  26.39 
 
 
447 aa  47  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3657  domain of unknown function DUF1745  25.35 
 
 
416 aa  46.6  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4193  domain of unknown function DUF1745  24.4 
 
 
386 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351241  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0128  hypothetical protein  22.14 
 
 
379 aa  46.2  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.193314  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0824  hypothetical protein  22.32 
 
 
379 aa  45.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0913  domain of unknown function DUF1745  21.75 
 
 
414 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0940  domain of unknown function DUF1745  21.75 
 
 
414 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10891  hypothetical protein  23.87 
 
 
386 aa  44.7  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.824347  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0710  hypothetical protein  24.35 
 
 
384 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.251408  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1661  hypothetical protein  24.35 
 
 
384 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2230  hypothetical protein  24.35 
 
 
392 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0600  hypothetical protein  24.35 
 
 
392 aa  43.5  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2313  GfdT protein  24.35 
 
 
392 aa  43.5  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1924  hypothetical protein  24.35 
 
 
392 aa  43.5  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1717  hypothetical protein  24.35 
 
 
392 aa  43.5  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1561  hypothetical protein  25.19 
 
 
394 aa  43.1  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0408772  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0700  hypothetical protein  23.86 
 
 
380 aa  43.1  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.155862  normal  0.0832434 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3390  hypothetical protein  18.66 
 
 
414 aa  43.1  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.0973611 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1400  domain of unknown function DUF1745  19.78 
 
 
398 aa  43.1  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.653815  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8558  hypothetical protein  23.16 
 
 
398 aa  42.7  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>