27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0128 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0128  hypothetical protein  100 
 
 		 379 aa  775    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.193314  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3362  hypothetical protein  34.15 
 
 		 377 aa  238  9e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.103972 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0526  hypothetical protein  29.63 
 
 		 380 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3873  hypothetical protein  27.15 
 
 		 380 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0895  FIST C domain protein  31.16 
 
 		 350 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000443325  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0690  hypothetical protein  30.3 
 
 		 376 aa  133  6e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000847515 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1269  hypothetical protein  26.42 
 
 		 387 aa  104  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0824  hypothetical protein  28.81 
 
 		 379 aa  96.3  7e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2954  hypothetical protein  24.35 
 
 		 395 aa  72.4  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3184  hypothetical protein  25.32 
 
 		 377 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3322  domain of unknown function DUF1745  24.62 
 
 		 373 aa  68.9  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2052  domain of unknown function DUF1745  22.78 
 
 		 379 aa  66.6  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2665  domain of unknown function DUF1745  23.68 
 
 		 427 aa  66.2  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.955158 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0696  transcriptional regulator, TrmB  24.1 
 
 		 512 aa  62  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1899  hypothetical protein  23.19 
 
 		 395 aa  62  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.598311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0294  hypothetical protein  22.14 
 
 		 375 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0012  hypothetical protein  22.67 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0572769  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4141  hypothetical protein  24.16 
 
 		 365 aa  57  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1520  domain of unknown function DUF1745  22.81 
 
 		 1101 aa  55.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.593307 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0268  diguanylate cyclase  20.09 
 
 		 933 aa  51.6  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0380534  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02432  hypothetical protein  23.92 
 
 		 391 aa  51.6  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1241  hypothetical protein  22.62 
 
 		 381 aa  49.3  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0354  hypothetical protein  23.39 
 
 		 387 aa  48.9  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1909  domain of unknown function DUF1745  21.74 
 
 		 408 aa  48.5  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2079  domain of unknown function DUF1745  21.2 
 
 		 417 aa  47  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00286991  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2305  domain of unknown function DUF1745  21.43 
 
 		 389 aa  45.8  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1434  domain of unknown function DUF1745  21.26 
 
 		 402 aa  44.3  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.318192  normal  0.236861 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>