78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4193 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4193  domain of unknown function DUF1745  100 
 
 		 386 aa  773    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351241  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2940  hypothetical protein  85.38 
 
 		 402 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00513133 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4519  domain of unknown function DUF1745  69.11 
 
 		 387 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317884  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3668  hypothetical protein  68.59 
 
 		 385 aa  474  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432885  hitchhiker  0.00253652 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3617  hypothetical protein  64.8 
 
 		 378 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0308687  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1925  hypothetical protein  63.12 
 
 		 398 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.795435 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2201  domain of unknown function DUF1745  63.12 
 
 		 398 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1816  protein of unknown function DUF1745  63.38 
 
 		 389 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.988519 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3518  hypothetical protein  62.99 
 
 		 400 aa  450  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.49503  normal  0.689004 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1939  hypothetical protein  41.18 
 
 		 384 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2663  hypothetical protein  40.21 
 
 		 387 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2171  hypothetical protein  39.15 
 
 		 387 aa  258  9e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3320  hypothetical protein  41.38 
 
 		 387 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0700  hypothetical protein  38.87 
 
 		 380 aa  250  4e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.155862  normal  0.0832434 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3140  hypothetical protein  39.84 
 
 		 387 aa  249  7e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1139  hypothetical protein  42.86 
 
 		 392 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6102  domain of unknown function DUF1745  38.01 
 
 		 386 aa  247  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1883  hypothetical protein  35.61 
 
 		 382 aa  246  3e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2247  hypothetical protein  37.79 
 
 		 382 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00169518  normal  0.316904 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2881  hypothetical protein  43.02 
 
 		 390 aa  242  1e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2538  hypothetical protein  35.68 
 
 		 382 aa  242  1e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1527  hypothetical protein  43.02 
 
 		 390 aa  242  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.039182 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38990  hypothetical protein  39.45 
 
 		 387 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.880326  normal  0.566256 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0732  hypothetical protein  40.8 
 
 		 386 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1661  hypothetical protein  40.63 
 
 		 384 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0600  hypothetical protein  40.63 
 
 		 392 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2313  GfdT protein  40.63 
 
 		 392 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1924  hypothetical protein  40.63 
 
 		 392 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1717  hypothetical protein  40.63 
 
 		 392 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2230  hypothetical protein  40.63 
 
 		 392 aa  237  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0710  hypothetical protein  40.63 
 
 		 384 aa  237  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.251408  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1872  hypothetical protein  35.85 
 
 		 381 aa  229  5e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1250  hypothetical protein  37.4 
 
 		 386 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.7579 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2592  hypothetical protein  37.4 
 
 		 386 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71341  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2675  hypothetical protein  39.83 
 
 		 399 aa  225  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0296571  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2724  domain of unknown function DUF1745  37.47 
 
 		 374 aa  224  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.43445  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2339  domain of unknown function DUF1745  37.29 
 
 		 383 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2353  hypothetical protein  37.9 
 
 		 393 aa  213  3.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.18015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3953  hypothetical protein  35.5 
 
 		 389 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1931  hypothetical protein  39.75 
 
 		 385 aa  210  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.429127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0466  domain of unknown function DUF1745  34.86 
 
 		 385 aa  208  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2479  hypothetical protein  35.29 
 
 		 379 aa  203  4e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.492023 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4045  hypothetical protein  33.96 
 
 		 378 aa  189  8e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3141  hypothetical protein  34.32 
 
 		 460 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3551  hypothetical protein  32.52 
 
 		 371 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2474  hypothetical protein  30.11 
 
 		 447 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2993  hypothetical protein  30.59 
 
 		 368 aa  151  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3344  hypothetical protein  31.76 
 
 		 464 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5004  chemotaxis sensory transducer  28.26 
 
 		 672 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.71371 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2590  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.7 
 
 		 675 aa  83.6  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182127  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2083  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.46 
 
 		 647 aa  83.6  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0223967  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2918  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.31 
 
 		 669 aa  79.3  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0982  domain of unknown function DUF1745  27.34 
 
 		 666 aa  77.4  0.0000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.505903  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1909  domain of unknown function DUF1745  27.63 
 
 		 408 aa  73.9  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0690  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 1186 aa  72  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1866  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.93 
 
 		 650 aa  70.9  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003465  hypothetical protein  22.63 
 
 		 393 aa  62.4  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1269  hypothetical protein  26.87 
 
 		 387 aa  60.8  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2665  domain of unknown function DUF1745  26.44 
 
 		 427 aa  59.3  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.955158 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3322  domain of unknown function DUF1745  27.27 
 
 		 373 aa  56.2  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1241  hypothetical protein  24.56 
 
 		 381 aa  55.5  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2107  domain of unknown function DUF1745  29.73 
 
 		 401 aa  53.9  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.206498 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0696  transcriptional regulator, TrmB  22.28 
 
 		 512 aa  52.4  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02305  hypothetical protein  23.7 
 
 		 395 aa  50.8  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1054  hypothetical protein  20.53 
 
 		 405 aa  48.5  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1202  fused sensor protein/response regulator  21.3 
 
 		 934 aa  48.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127641  normal  0.087847 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1203  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  20.17 
 
 		 932 aa  47.4  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00343755  normal  0.259486 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1899  hypothetical protein  26.23 
 
 		 395 aa  47  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.598311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0268  diguanylate cyclase  23.04 
 
 		 933 aa  46.6  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0380534  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2153  hypothetical protein  26.58 
 
 		 400 aa  46.6  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2864  domain of unknown function DUF1745  23.68 
 
 		 396 aa  46.2  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.965957  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0294  hypothetical protein  24.4 
 
 		 375 aa  45.8  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1352  domain of unknown function DUF1745  23.16 
 
 		 396 aa  45.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3322200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1476  domain of unknown function DUF1745  24.05 
 
 		 629 aa  45.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.153758  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2151  hypothetical protein  23.41 
 
 		 383 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.509879 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4040  domain of unknown function DUF1745  23.14 
 
 		 396 aa  43.9  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0824  hypothetical protein  25.53 
 
 		 379 aa  43.5  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2119  hypothetical protein  24.26 
 
 		 402 aa  43.1  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>