89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6102 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6102  domain of unknown function DUF1745  100 
 
 		 386 aa  789    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1661  hypothetical protein  55.95 
 
 		 384 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0600  hypothetical protein  55.95 
 
 		 392 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2230  hypothetical protein  55.95 
 
 		 392 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2313  GfdT protein  55.95 
 
 		 392 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0710  hypothetical protein  55.95 
 
 		 384 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.251408  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1924  hypothetical protein  55.95 
 
 		 392 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1717  hypothetical protein  55.95 
 
 		 392 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0732  hypothetical protein  54.96 
 
 		 386 aa  412  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2339  domain of unknown function DUF1745  45.09 
 
 		 383 aa  334  2e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1939  hypothetical protein  41.88 
 
 		 384 aa  310  4e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3140  hypothetical protein  41.49 
 
 		 387 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2171  hypothetical protein  41.49 
 
 		 387 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2663  hypothetical protein  41.49 
 
 		 387 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38990  hypothetical protein  42.28 
 
 		 387 aa  292  8e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.880326  normal  0.566256 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1883  hypothetical protein  39.07 
 
 		 382 aa  291  1e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1872  hypothetical protein  40.56 
 
 		 381 aa  286  4e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3320  hypothetical protein  41.51 
 
 		 387 aa  286  5e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2538  hypothetical protein  38.48 
 
 		 382 aa  284  2.0000000000000002e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2724  domain of unknown function DUF1745  40.32 
 
 		 374 aa  283  5.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.43445  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2247  hypothetical protein  39 
 
 		 382 aa  281  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00169518  normal  0.316904 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2479  hypothetical protein  42.86 
 
 		 379 aa  280  2e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.492023 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4045  hypothetical protein  40.05 
 
 		 378 aa  271  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1139  hypothetical protein  42.55 
 
 		 392 aa  270  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2675  hypothetical protein  40.46 
 
 		 399 aa  258  1e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0296571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1925  hypothetical protein  39.36 
 
 		 398 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.795435 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0700  hypothetical protein  37.73 
 
 		 380 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.155862  normal  0.0832434 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2201  domain of unknown function DUF1745  39.36 
 
 		 398 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2881  hypothetical protein  42.65 
 
 		 390 aa  252  7e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1816  protein of unknown function DUF1745  39.31 
 
 		 389 aa  252  8.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.988519 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3518  hypothetical protein  38.64 
 
 		 400 aa  252  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.49503  normal  0.689004 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3668  hypothetical protein  40.87 
 
 		 385 aa  251  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432885  hitchhiker  0.00253652 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1527  hypothetical protein  42.36 
 
 		 390 aa  249  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.039182 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3617  hypothetical protein  40.52 
 
 		 378 aa  248  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0308687  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4519  domain of unknown function DUF1745  39.36 
 
 		 387 aa  248  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317884  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4193  domain of unknown function DUF1745  40.23 
 
 		 386 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351241  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3953  hypothetical protein  35.7 
 
 		 389 aa  233  6e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2940  hypothetical protein  40.87 
 
 		 402 aa  233  6e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00513133 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0466  domain of unknown function DUF1745  36.22 
 
 		 385 aa  213  5.999999999999999e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1250  hypothetical protein  35.62 
 
 		 386 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.7579 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2592  hypothetical protein  35.62 
 
 		 386 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71341  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2353  hypothetical protein  35.17 
 
 		 393 aa  202  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.18015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1931  hypothetical protein  36.19 
 
 		 385 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.429127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3551  hypothetical protein  33.06 
 
 		 371 aa  186  7e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2474  hypothetical protein  31.72 
 
 		 447 aa  180  4e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3141  hypothetical protein  32.37 
 
 		 460 aa  177  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2993  hypothetical protein  32.94 
 
 		 368 aa  172  6.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3344  hypothetical protein  31.27 
 
 		 464 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0690  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 		 1186 aa  94.4  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2918  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.1 
 
 		 669 aa  93.2  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2590  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.07 
 
 		 675 aa  92.4  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182127  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2083  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.11 
 
 		 647 aa  90.1  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0223967  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0982  domain of unknown function DUF1745  29.12 
 
 		 666 aa  85.9  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.505903  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1866  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.57 
 
 		 650 aa  82.8  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2665  domain of unknown function DUF1745  24.74 
 
 		 427 aa  81.3  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.955158 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1520  domain of unknown function DUF1745  28.99 
 
 		 1101 aa  77.4  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.593307 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5004  chemotaxis sensory transducer  28.25 
 
 		 672 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.71371 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0690  hypothetical protein  24.79 
 
 		 376 aa  75.9  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000847515 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1269  hypothetical protein  24.86 
 
 		 387 aa  72  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1241  hypothetical protein  25.71 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0268  diguanylate cyclase  25 
 
 		 933 aa  67  0.0000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0380534  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3657  domain of unknown function DUF1745  26.06 
 
 		 416 aa  66.2  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1909  domain of unknown function DUF1745  22.4 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0012  hypothetical protein  24.93 
 
 		 379 aa  63.9  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0572769  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1202  fused sensor protein/response regulator  22.56 
 
 		 934 aa  63.9  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127641  normal  0.087847 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2079  domain of unknown function DUF1745  23.63 
 
 		 417 aa  63.2  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00286991  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1352  domain of unknown function DUF1745  24.16 
 
 		 396 aa  63.2  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3322200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2305  domain of unknown function DUF1745  25.07 
 
 		 389 aa  60.8  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2864  domain of unknown function DUF1745  23.53 
 
 		 396 aa  58.9  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.965957  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1203  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  20.71 
 
 		 932 aa  59.3  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00343755  normal  0.259486 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0354  hypothetical protein  23.77 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3322  domain of unknown function DUF1745  26.96 
 
 		 373 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0331  hypothetical protein  24.66 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0696  transcriptional regulator, TrmB  24.44 
 
 		 512 aa  57.8  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2954  hypothetical protein  25.67 
 
 		 395 aa  55.5  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4040  domain of unknown function DUF1745  25 
 
 		 396 aa  55.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4131  domain of unknown function DUF1745  23.29 
 
 		 396 aa  55.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2119  hypothetical protein  22.49 
 
 		 402 aa  53.9  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3884  domain of unknown function DUF1745  32.82 
 
 		 1852 aa  53.9  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2107  domain of unknown function DUF1745  22.38 
 
 		 401 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.206498 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0615  hypothetical protein  20.15 
 
 		 468 aa  52  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.948448  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2151  hypothetical protein  23.28 
 
 		 383 aa  50.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.509879 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2153  hypothetical protein  22.48 
 
 		 400 aa  50.4  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0824  hypothetical protein  23.1 
 
 		 379 aa  49.7  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1476  domain of unknown function DUF1745  24.33 
 
 		 629 aa  49.3  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.153758  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1204  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  20.82 
 
 		 931 aa  48.5  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271509 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0911  hypothetical protein  23.49 
 
 		 400 aa  45.8  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.36206  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05570  hypothetical protein  26.44 
 
 		 387 aa  44.7  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1899  hypothetical protein  26.59 
 
 		 395 aa  44.3  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.598311  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>