103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3322 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3322  domain of unknown function DUF1745  100 
 
 		 373 aa  759    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0012  hypothetical protein  47.89 
 
 		 379 aa  348  1e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0572769  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1899  hypothetical protein  48.74 
 
 		 395 aa  334  2e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.598311  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0354  hypothetical protein  45.62 
 
 		 387 aa  311  1e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0140  FIST C domain protein  47.32 
 
 		 379 aa  309  6.999999999999999e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1520  domain of unknown function DUF1745  44.27 
 
 		 1101 aa  308  8e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.593307 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3184  hypothetical protein  46.35 
 
 		 377 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2954  hypothetical protein  44.44 
 
 		 395 aa  302  6.000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0331  hypothetical protein  45.01 
 
 		 387 aa  300  4e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4141  hypothetical protein  47.18 
 
 		 365 aa  298  1e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1241  hypothetical protein  41.41 
 
 		 381 aa  261  2e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3884  domain of unknown function DUF1745  39.17 
 
 		 1852 aa  229  6e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1909  domain of unknown function DUF1745  30.68 
 
 		 408 aa  150  4e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2107  domain of unknown function DUF1745  31.95 
 
 		 401 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.206498 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2079  domain of unknown function DUF1745  29.95 
 
 		 417 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00286991  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2153  hypothetical protein  29.91 
 
 		 400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2864  domain of unknown function DUF1745  28.4 
 
 		 396 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.965957  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2151  hypothetical protein  25.29 
 
 		 383 aa  107  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.509879 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1476  domain of unknown function DUF1745  25 
 
 		 629 aa  106  6e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.153758  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1352  domain of unknown function DUF1745  28.4 
 
 		 396 aa  104  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3322200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0294  hypothetical protein  24.86 
 
 		 375 aa  103  7e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1203  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  26.23 
 
 		 932 aa  102  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00343755  normal  0.259486 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2119  hypothetical protein  27.94 
 
 		 402 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1204  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  26.13 
 
 		 931 aa  100  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271509 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2305  domain of unknown function DUF1745  26.59 
 
 		 389 aa  98.6  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0268  diguanylate cyclase  26.84 
 
 		 933 aa  99  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0380534  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1269  hypothetical protein  26.59 
 
 		 387 aa  95.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4131  domain of unknown function DUF1745  27.17 
 
 		 396 aa  95.1  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4040  domain of unknown function DUF1745  26.69 
 
 		 396 aa  94.4  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1202  fused sensor protein/response regulator  25 
 
 		 934 aa  89.4  8e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127641  normal  0.087847 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0824  hypothetical protein  27.7 
 
 		 379 aa  83.2  0.000000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0690  hypothetical protein  25.2 
 
 		 376 aa  80.1  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000847515 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3657  domain of unknown function DUF1745  26.35 
 
 		 416 aa  74.3  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3953  hypothetical protein  27.07 
 
 		 389 aa  71.6  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0895  FIST C domain protein  29.8 
 
 		 350 aa  71.6  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000443325  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2665  domain of unknown function DUF1745  23.59 
 
 		 427 aa  70.5  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.955158 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0911  hypothetical protein  24.86 
 
 		 400 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.36206  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4044  hypothetical protein  25.43 
 
 		 401 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0444  hypothetical protein  26.45 
 
 		 412 aa  65.5  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3141  hypothetical protein  24.93 
 
 		 460 aa  64.3  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2052  domain of unknown function DUF1745  24.42 
 
 		 379 aa  63.2  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05570  hypothetical protein  26.34 
 
 		 387 aa  62.8  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3362  hypothetical protein  26.35 
 
 		 377 aa  61.2  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.103972 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3344  hypothetical protein  25.27 
 
 		 464 aa  60.5  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3113  hypothetical protein  27.05 
 
 		 397 aa  59.7  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.680527  hitchhiker  0.0000208643 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2659  hypothetical protein  25.93 
 
 		 406 aa  59.3  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0466  domain of unknown function DUF1745  26.14 
 
 		 385 aa  59.3  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3254  domain of unknown function DUF1745  25.41 
 
 		 385 aa  58.9  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126453  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2247  hypothetical protein  22.77 
 
 		 382 aa  58.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00169518  normal  0.316904 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6102  domain of unknown function DUF1745  26.96 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8558  hypothetical protein  26.7 
 
 		 398 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0128  hypothetical protein  24.75 
 
 		 379 aa  57.4  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.193314  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4193  domain of unknown function DUF1745  27.27 
 
 		 386 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351241  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0526  hypothetical protein  21.69 
 
 		 380 aa  56.6  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1661  hypothetical protein  24.71 
 
 		 384 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0710  hypothetical protein  24.71 
 
 		 384 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.251408  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1872  hypothetical protein  21.08 
 
 		 381 aa  55.8  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1717  hypothetical protein  24.71 
 
 		 392 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1924  hypothetical protein  24.71 
 
 		 392 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2313  GfdT protein  24.71 
 
 		 392 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2230  hypothetical protein  24.71 
 
 		 392 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0600  hypothetical protein  24.71 
 
 		 392 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2479  hypothetical protein  25.39 
 
 		 379 aa  55.1  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.492023 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2592  hypothetical protein  24.12 
 
 		 386 aa  54.3  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71341  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1891  hypothetical protein  26.94 
 
 		 391 aa  54.3  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.473859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1250  hypothetical protein  24.12 
 
 		 386 aa  54.3  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.7579 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0696  transcriptional regulator, TrmB  22.22 
 
 		 512 aa  54.3  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1139  hypothetical protein  23.94 
 
 		 392 aa  54.3  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0732  hypothetical protein  24.12 
 
 		 386 aa  53.9  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2538  hypothetical protein  22.49 
 
 		 382 aa  53.5  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1883  hypothetical protein  22.34 
 
 		 382 aa  53.1  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2675  hypothetical protein  24.12 
 
 		 399 aa  53.1  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0296571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3242  domain of unknown function DUF1745  20.22 
 
 		 371 aa  53.1  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0186777  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1527  hypothetical protein  25.6 
 
 		 390 aa  52.8  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.039182 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0889  hypothetical protein  25.94 
 
 		 374 aa  52.4  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2881  hypothetical protein  25.6 
 
 		 390 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1931  hypothetical protein  23.79 
 
 		 385 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.429127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2940  hypothetical protein  25.08 
 
 		 402 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00513133 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1055  domain of unknown function DUF1745  25.26 
 
 		 389 aa  52  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0091  domain of unknown function DUF1745  26.27 
 
 		 383 aa  50.8  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1503  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.4 
 
 		 947 aa  50.8  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1561  hypothetical protein  22.9 
 
 		 404 aa  50.4  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5581  hypothetical protein  28.36 
 
 		 396 aa  50.1  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.19369  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2542  hypothetical protein  23.02 
 
 		 395 aa  49.3  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2201  domain of unknown function DUF1745  25.78 
 
 		 398 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2724  domain of unknown function DUF1745  24.92 
 
 		 374 aa  49.3  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.43445  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1925  hypothetical protein  25.78 
 
 		 398 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.795435 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3617  hypothetical protein  24.7 
 
 		 378 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0308687  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1054  hypothetical protein  22.64 
 
 		 405 aa  47.8  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0688  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.91 
 
 		 951 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00399648  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1892  hypothetical protein  22.78 
 
 		 382 aa  47.4  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.056146  normal  0.181862 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002115  sensory box/GGDEF family protein  24.4 
 
 		 828 aa  47.4  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02305  hypothetical protein  24.29 
 
 		 395 aa  46.6  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1434  domain of unknown function DUF1745  24.58 
 
 		 402 aa  46.6  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.318192  normal  0.236861 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4519  domain of unknown function DUF1745  27.13 
 
 		 387 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317884  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2993  hypothetical protein  23.51 
 
 		 368 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00305  sensory transduction protein kinase  28.97 
 
 		 828 aa  45.4  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1816  protein of unknown function DUF1745  25.15 
 
 		 389 aa  45.8  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.988519 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3551  hypothetical protein  23.19 
 
 		 371 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0438  domain of unknown function DUF1745  24.38 
 
 		 398 aa  45.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>