98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2107 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2107  domain of unknown function DUF1745  100 
 
 
401 aa  806    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.206498 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2153  hypothetical protein  63.91 
 
 
400 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2079  domain of unknown function DUF1745  62.22 
 
 
417 aa  491  1e-137  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00286991  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1909  domain of unknown function DUF1745  60.56 
 
 
408 aa  483  1e-135  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2151  hypothetical protein  29.32 
 
 
383 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.509879 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1241  hypothetical protein  31.47 
 
 
381 aa  173  5e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3184  hypothetical protein  28.21 
 
 
377 aa  158  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2954  hypothetical protein  32.04 
 
 
395 aa  155  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4141  hypothetical protein  31.79 
 
 
365 aa  153  4e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2119  hypothetical protein  28.32 
 
 
402 aa  150  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1269  hypothetical protein  29.15 
 
 
387 aa  149  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0012  hypothetical protein  29.35 
 
 
379 aa  146  5e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0572769  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2864  domain of unknown function DUF1745  27.54 
 
 
396 aa  146  6e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.965957  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3322  domain of unknown function DUF1745  32.34 
 
 
373 aa  143  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0824  hypothetical protein  26.7 
 
 
379 aa  140  4.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1899  hypothetical protein  29.71 
 
 
395 aa  137  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.598311  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1352  domain of unknown function DUF1745  26.42 
 
 
396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3322200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3657  domain of unknown function DUF1745  31.54 
 
 
416 aa  137  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0690  hypothetical protein  26.58 
 
 
376 aa  135  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000847515 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1520  domain of unknown function DUF1745  28.3 
 
 
1101 aa  132  6.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.593307 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2305  domain of unknown function DUF1745  30.46 
 
 
389 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0354  hypothetical protein  31.32 
 
 
387 aa  130  6e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0140  FIST C domain protein  31.75 
 
 
379 aa  128  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4040  domain of unknown function DUF1745  25.39 
 
 
396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0331  hypothetical protein  30.55 
 
 
387 aa  125  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4131  domain of unknown function DUF1745  25 
 
 
396 aa  117  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3884  domain of unknown function DUF1745  30.23 
 
 
1852 aa  116  6.9999999999999995e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2665  domain of unknown function DUF1745  24.81 
 
 
427 aa  102  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.955158 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0294  hypothetical protein  24.41 
 
 
375 aa  94  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0911  hypothetical protein  24.53 
 
 
400 aa  92.4  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.36206  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1883  hypothetical protein  23.88 
 
 
382 aa  75.9  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1203  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  23.89 
 
 
932 aa  74.3  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00343755  normal  0.259486 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0895  FIST C domain protein  25 
 
 
350 aa  72.8  0.000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000443325  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1661  hypothetical protein  25.07 
 
 
384 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0710  hypothetical protein  25.07 
 
 
384 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.251408  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1717  hypothetical protein  25.07 
 
 
392 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1924  hypothetical protein  25.07 
 
 
392 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2313  GfdT protein  25.07 
 
 
392 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2230  hypothetical protein  25.07 
 
 
392 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0600  hypothetical protein  25.07 
 
 
392 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0550  hypothetical protein  22.8 
 
 
467 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0732  hypothetical protein  25.93 
 
 
386 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1369  hypothetical protein  23.06 
 
 
468 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1204  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  22.78 
 
 
931 aa  67  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.271509 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2247  hypothetical protein  22.44 
 
 
382 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00169518  normal  0.316904 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2659  hypothetical protein  25.25 
 
 
406 aa  65.1  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0615  hypothetical protein  23.24 
 
 
468 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.948448  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1202  fused sensor protein/response regulator  23.89 
 
 
934 aa  64.3  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127641  normal  0.087847 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1816  protein of unknown function DUF1745  26.57 
 
 
389 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.988519 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3551  hypothetical protein  26.49 
 
 
371 aa  63.5  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2675  hypothetical protein  25.78 
 
 
399 aa  63.2  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0296571  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0288  hypothetical protein  25.64 
 
 
467 aa  63.2  0.000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2474  hypothetical protein  25.34 
 
 
447 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1872  hypothetical protein  23.33 
 
 
381 aa  62.4  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0268  diguanylate cyclase  22.1 
 
 
933 aa  62  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0380534  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2339  domain of unknown function DUF1745  24.08 
 
 
383 aa  62  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2191  diguanylate cyclase  22.96 
 
 
806 aa  61.2  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00068502 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2538  hypothetical protein  23.28 
 
 
382 aa  60.8  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1925  hypothetical protein  26.42 
 
 
398 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.795435 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2201  domain of unknown function DUF1745  26.42 
 
 
398 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290365  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1435  hypothetical protein  25.89 
 
 
501 aa  59.7  0.00000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.95663  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3362  hypothetical protein  22.36 
 
 
377 aa  59.7  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.103972 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6102  domain of unknown function DUF1745  22.61 
 
 
386 aa  59.3  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3518  hypothetical protein  24.86 
 
 
400 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.49503  normal  0.689004 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2881  hypothetical protein  32.7 
 
 
390 aa  57.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1527  hypothetical protein  32.7 
 
 
390 aa  57.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.039182 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1476  domain of unknown function DUF1745  22.68 
 
 
629 aa  57  0.0000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.153758  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1139  hypothetical protein  28.57 
 
 
392 aa  57  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1561  hypothetical protein  23.92 
 
 
404 aa  56.2  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1054  hypothetical protein  23.31 
 
 
405 aa  55.1  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4193  domain of unknown function DUF1745  29.73 
 
 
386 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351241  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1892  hypothetical protein  25.98 
 
 
382 aa  52.8  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.056146  normal  0.181862 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2940  hypothetical protein  30.36 
 
 
402 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00513133 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02305  hypothetical protein  22.44 
 
 
395 aa  51.6  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0526  hypothetical protein  21.67 
 
 
380 aa  50.8  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3141  hypothetical protein  21.81 
 
 
460 aa  50.4  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2592  hypothetical protein  25.61 
 
 
386 aa  49.7  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71341  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3344  hypothetical protein  23.98 
 
 
464 aa  49.7  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3617  hypothetical protein  24.71 
 
 
378 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0308687  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2171  hypothetical protein  26.51 
 
 
387 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3246  domain of unknown function DUF1745  23.66 
 
 
396 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116005  normal  0.61148 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1250  hypothetical protein  25.61 
 
 
386 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.7579 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3140  hypothetical protein  25.9 
 
 
387 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10891  hypothetical protein  26.89 
 
 
386 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.824347  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2663  hypothetical protein  26.51 
 
 
387 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1049  hypothetical protein  26.27 
 
 
406 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198533 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10639  hypothetical protein  27.14 
 
 
383 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000135133  normal  0.805152 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0360  hypothetical protein  24.68 
 
 
398 aa  48.5  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.435591  normal  0.396986 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0700  hypothetical protein  24.42 
 
 
380 aa  47.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.155862  normal  0.0832434 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1931  hypothetical protein  28.9 
 
 
385 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.429127  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0466  domain of unknown function DUF1745  23.36 
 
 
385 aa  47.4  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1939  hypothetical protein  25.81 
 
 
384 aa  46.2  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4045  hypothetical protein  23.3 
 
 
378 aa  45.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0889  hypothetical protein  25.26 
 
 
374 aa  45.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0444  hypothetical protein  26.86 
 
 
412 aa  45.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1434  domain of unknown function DUF1745  21.99 
 
 
402 aa  44.3  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.318192  normal  0.236861 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2993  hypothetical protein  28.33 
 
 
368 aa  43.1  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2479  hypothetical protein  23.76 
 
 
379 aa  43.1  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.492023 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>