87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A2230 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1661  hypothetical protein  99.74 
 
 
384 aa  771    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0600  hypothetical protein  99.74 
 
 
392 aa  788    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2230  hypothetical protein  100 
 
 
392 aa  790    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2313  GfdT protein  99.74 
 
 
392 aa  788    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0710  hypothetical protein  100 
 
 
384 aa  774    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.251408  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1924  hypothetical protein  99.74 
 
 
392 aa  788    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1717  hypothetical protein  99.74 
 
 
392 aa  788    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0732  hypothetical protein  95.55 
 
 
386 aa  733    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6102  domain of unknown function DUF1745  55.95 
 
 
386 aa  416  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2339  domain of unknown function DUF1745  43.87 
 
 
383 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1883  hypothetical protein  39.57 
 
 
382 aa  285  1.0000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0700  hypothetical protein  41.47 
 
 
380 aa  278  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.155862  normal  0.0832434 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2538  hypothetical protein  39.42 
 
 
382 aa  277  2e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2247  hypothetical protein  39.12 
 
 
382 aa  273  3e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00169518  normal  0.316904 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2171  hypothetical protein  40.21 
 
 
387 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2663  hypothetical protein  40.21 
 
 
387 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3140  hypothetical protein  40.48 
 
 
387 aa  269  7e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4045  hypothetical protein  40.33 
 
 
378 aa  267  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1872  hypothetical protein  39.12 
 
 
381 aa  265  8e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1939  hypothetical protein  38.5 
 
 
384 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2724  domain of unknown function DUF1745  40.62 
 
 
374 aa  260  3e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.43445  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38990  hypothetical protein  40.77 
 
 
387 aa  256  6e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.880326  normal  0.566256 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2479  hypothetical protein  41.03 
 
 
379 aa  255  1.0000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.492023 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3320  hypothetical protein  41.62 
 
 
387 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3953  hypothetical protein  38.79 
 
 
389 aa  248  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1139  hypothetical protein  39.89 
 
 
392 aa  245  8e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1925  hypothetical protein  39.14 
 
 
398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.795435 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2675  hypothetical protein  40.82 
 
 
399 aa  243  6e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0296571  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2201  domain of unknown function DUF1745  38.97 
 
 
398 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290365  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1816  protein of unknown function DUF1745  38.57 
 
 
389 aa  242  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.988519 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3617  hypothetical protein  41.74 
 
 
378 aa  237  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0308687  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4193  domain of unknown function DUF1745  40.63 
 
 
386 aa  237  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351241  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2940  hypothetical protein  40 
 
 
402 aa  236  4e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00513133 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1250  hypothetical protein  40.85 
 
 
386 aa  236  6e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.7579 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2592  hypothetical protein  41.35 
 
 
386 aa  236  7e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71341  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2881  hypothetical protein  42.44 
 
 
390 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1527  hypothetical protein  42.49 
 
 
390 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.039182 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4519  domain of unknown function DUF1745  39.71 
 
 
387 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317884  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3518  hypothetical protein  38.35 
 
 
400 aa  231  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.49503  normal  0.689004 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3668  hypothetical protein  40.52 
 
 
385 aa  229  5e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432885  hitchhiker  0.00253652 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0466  domain of unknown function DUF1745  34.2 
 
 
385 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1931  hypothetical protein  41.77 
 
 
385 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.429127  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2353  hypothetical protein  36.13 
 
 
393 aa  208  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.18015  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3141  hypothetical protein  33.6 
 
 
460 aa  205  9e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3344  hypothetical protein  35.92 
 
 
464 aa  204  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2474  hypothetical protein  35.11 
 
 
447 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3551  hypothetical protein  34.4 
 
 
371 aa  196  7e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2993  hypothetical protein  32.23 
 
 
368 aa  171  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1241  hypothetical protein  27.39 
 
 
381 aa  102  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2590  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.47 
 
 
675 aa  92.4  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182127  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5004  chemotaxis sensory transducer  26.2 
 
 
672 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.71371 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2918  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.54 
 
 
669 aa  88.6  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2665  domain of unknown function DUF1745  27.2 
 
 
427 aa  87.8  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.955158 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0690  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  27.83 
 
 
1186 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2083  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.89 
 
 
647 aa  84  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0223967  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0982  domain of unknown function DUF1745  28.53 
 
 
666 aa  82  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.505903  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1866  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.82 
 
 
650 aa  72.8  0.000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2153  hypothetical protein  25 
 
 
400 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0690  hypothetical protein  27.04 
 
 
376 aa  67.8  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000847515 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2107  domain of unknown function DUF1745  25.07 
 
 
401 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.206498 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0354  hypothetical protein  26.62 
 
 
387 aa  63.9  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3657  domain of unknown function DUF1745  25.07 
 
 
416 aa  62  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1269  hypothetical protein  25 
 
 
387 aa  60.5  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1909  domain of unknown function DUF1745  23.58 
 
 
408 aa  59.3  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0012  hypothetical protein  24.93 
 
 
379 aa  59.7  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0572769  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0331  hypothetical protein  24.46 
 
 
387 aa  58.2  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1520  domain of unknown function DUF1745  26.37 
 
 
1101 aa  57.8  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.593307 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3322  domain of unknown function DUF1745  24.71 
 
 
373 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0824  hypothetical protein  24.85 
 
 
379 aa  54.7  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2954  hypothetical protein  27.42 
 
 
395 aa  53.1  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0911  hypothetical protein  22.92 
 
 
400 aa  52.8  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.36206  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3884  domain of unknown function DUF1745  34.81 
 
 
1852 aa  52.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2305  domain of unknown function DUF1745  27.69 
 
 
389 aa  50.1  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2151  hypothetical protein  23.15 
 
 
383 aa  49.7  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.509879 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1203  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  20.53 
 
 
932 aa  48.9  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00343755  normal  0.259486 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4141  hypothetical protein  25.5 
 
 
365 aa  48.1  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2079  domain of unknown function DUF1745  22.93 
 
 
417 aa  48.9  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00286991  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4040  domain of unknown function DUF1745  22.28 
 
 
396 aa  47.4  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05570  hypothetical protein  27.78 
 
 
387 aa  47  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2864  domain of unknown function DUF1745  23.13 
 
 
396 aa  46.6  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.965957  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1202  fused sensor protein/response regulator  20.95 
 
 
934 aa  45.8  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127641  normal  0.087847 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1476  domain of unknown function DUF1745  22.64 
 
 
629 aa  46.2  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.153758  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0268  diguanylate cyclase  23.29 
 
 
933 aa  45.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0380534  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1352  domain of unknown function DUF1745  23.35 
 
 
396 aa  44.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3322200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3184  hypothetical protein  23.93 
 
 
377 aa  44.3  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0294  hypothetical protein  24.35 
 
 
375 aa  43.5  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0615  hypothetical protein  19.66 
 
 
468 aa  42.7  0.01  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.948448  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>