59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1054 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1054  hypothetical protein  100 
 
 		 405 aa  839    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02305  hypothetical protein  44.92 
 
 		 395 aa  353  4e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003465  hypothetical protein  43.8 
 
 		 393 aa  350  2e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1561  hypothetical protein  43.18 
 
 		 394 aa  327  2.0000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0408772  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1434  domain of unknown function DUF1745  37.16 
 
 		 402 aa  241  2e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.318192  normal  0.236861 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1892  hypothetical protein  39.71 
 
 		 382 aa  225  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.056146  normal  0.181862 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02432  hypothetical protein  35.29 
 
 		 391 aa  197  3e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2542  hypothetical protein  35.11 
 
 		 395 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05570  hypothetical protein  26.1 
 
 		 387 aa  104  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1269  hypothetical protein  23.55 
 
 		 387 aa  73.9  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3518  hypothetical protein  25.69 
 
 		 400 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.49503  normal  0.689004 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2151  hypothetical protein  22.96 
 
 		 383 aa  66.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.509879 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4141  hypothetical protein  21.35 
 
 		 365 aa  62.8  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1909  domain of unknown function DUF1745  22.51 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1925  hypothetical protein  24.04 
 
 		 398 aa  60.1  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.795435 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2201  domain of unknown function DUF1745  23.26 
 
 		 398 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0690  hypothetical protein  24.33 
 
 		 376 aa  59.7  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000847515 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1816  protein of unknown function DUF1745  23.61 
 
 		 389 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.988519 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4045  hypothetical protein  25.79 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1939  hypothetical protein  27.16 
 
 		 384 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0696  transcriptional regulator, TrmB  21.15 
 
 		 512 aa  57  0.0000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2724  domain of unknown function DUF1745  25 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.43445  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3617  hypothetical protein  23.08 
 
 		 378 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0308687  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3184  hypothetical protein  26.61 
 
 		 377 aa  55.8  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2663  hypothetical protein  27.14 
 
 		 387 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3140  hypothetical protein  26.39 
 
 		 387 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0824  hypothetical protein  23.89 
 
 		 379 aa  55.5  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2305  domain of unknown function DUF1745  26.38 
 
 		 389 aa  55.5  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1872  hypothetical protein  22.86 
 
 		 381 aa  54.7  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0700  hypothetical protein  25.63 
 
 		 380 aa  53.9  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.155862  normal  0.0832434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2171  hypothetical protein  26.77 
 
 		 387 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2107  domain of unknown function DUF1745  22.95 
 
 		 401 aa  53.1  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.206498 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0268  diguanylate cyclase  31.63 
 
 		 933 aa  53.1  0.000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0380534  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3141  hypothetical protein  21.2 
 
 		 460 aa  53.1  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38990  hypothetical protein  24.94 
 
 		 387 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.880326  normal  0.566256 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2864  domain of unknown function DUF1745  24.45 
 
 		 396 aa  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.965957  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0911  hypothetical protein  20.81 
 
 		 400 aa  51.6  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.36206  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1202  fused sensor protein/response regulator  24.15 
 
 		 934 aa  50.8  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127641  normal  0.087847 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2954  hypothetical protein  25.51 
 
 		 395 aa  50.4  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1203  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  23.28 
 
 		 932 aa  50.1  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00343755  normal  0.259486 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3551  hypothetical protein  21.95 
 
 		 371 aa  50.1  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4040  domain of unknown function DUF1745  25.1 
 
 		 396 aa  49.7  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1352  domain of unknown function DUF1745  25.42 
 
 		 396 aa  49.3  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3322200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1139  hypothetical protein  24.58 
 
 		 392 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3320  hypothetical protein  25.73 
 
 		 387 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4519  domain of unknown function DUF1745  21.26 
 
 		 387 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317884  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2119  hypothetical protein  25.58 
 
 		 402 aa  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0012  hypothetical protein  23.29 
 
 		 379 aa  47.8  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0572769  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4193  domain of unknown function DUF1745  21.39 
 
 		 386 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351241  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3322  domain of unknown function DUF1745  22.64 
 
 		 373 aa  47.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1241  hypothetical protein  25.42 
 
 		 381 aa  47  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3344  hypothetical protein  21.53 
 
 		 464 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4131  domain of unknown function DUF1745  25 
 
 		 396 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2474  hypothetical protein  21.36 
 
 		 447 aa  45.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1899  hypothetical protein  22.28 
 
 		 395 aa  44.3  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.598311  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0354  hypothetical protein  24.88 
 
 		 387 aa  44.3  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1883  hypothetical protein  23.79 
 
 		 382 aa  44.3  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2940  hypothetical protein  24.43 
 
 		 402 aa  43.5  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00513133 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1369  hypothetical protein  23.25 
 
 		 468 aa  43.9  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>