82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2724 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2724  domain of unknown function DUF1745  100 
 
 		 374 aa  769    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.43445  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4045  hypothetical protein  44.24 
 
 		 378 aa  328  7e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6102  domain of unknown function DUF1745  40.59 
 
 		 386 aa  283  3.0000000000000004e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2479  hypothetical protein  38.77 
 
 		 379 aa  275  1.0000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.492023 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0732  hypothetical protein  40.55 
 
 		 386 aa  268  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1661  hypothetical protein  40.62 
 
 		 384 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1717  hypothetical protein  40.62 
 
 		 392 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1924  hypothetical protein  40.62 
 
 		 392 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2313  GfdT protein  40.62 
 
 		 392 aa  265  8e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0600  hypothetical protein  40.62 
 
 		 392 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2230  hypothetical protein  40.62 
 
 		 392 aa  265  8e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0710  hypothetical protein  40.62 
 
 		 384 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.251408  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1939  hypothetical protein  39.84 
 
 		 384 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2247  hypothetical protein  37.2 
 
 		 382 aa  255  8e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00169518  normal  0.316904 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0700  hypothetical protein  38.77 
 
 		 380 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.155862  normal  0.0832434 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2339  domain of unknown function DUF1745  38.17 
 
 		 383 aa  251  1e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2663  hypothetical protein  38.48 
 
 		 387 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2171  hypothetical protein  38.48 
 
 		 387 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3140  hypothetical protein  37.94 
 
 		 387 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1883  hypothetical protein  36.53 
 
 		 382 aa  247  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2592  hypothetical protein  40.59 
 
 		 386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71341  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1250  hypothetical protein  40.59 
 
 		 386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.7579 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2538  hypothetical protein  35.44 
 
 		 382 aa  241  2e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1139  hypothetical protein  36.19 
 
 		 392 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38990  hypothetical protein  37.87 
 
 		 387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.880326  normal  0.566256 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0466  domain of unknown function DUF1745  39.74 
 
 		 385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3953  hypothetical protein  36.34 
 
 		 389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3320  hypothetical protein  39.06 
 
 		 387 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1872  hypothetical protein  34.04 
 
 		 381 aa  231  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3518  hypothetical protein  36.44 
 
 		 400 aa  231  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.49503  normal  0.689004 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1931  hypothetical protein  41.12 
 
 		 385 aa  230  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.429127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2675  hypothetical protein  36.39 
 
 		 399 aa  228  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0296571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3617  hypothetical protein  37.57 
 
 		 378 aa  227  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0308687  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1527  hypothetical protein  37.25 
 
 		 390 aa  226  7e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.039182 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2353  hypothetical protein  38.26 
 
 		 393 aa  225  8e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.18015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2881  hypothetical protein  37.25 
 
 		 390 aa  225  9e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3668  hypothetical protein  38.44 
 
 		 385 aa  223  6e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432885  hitchhiker  0.00253652 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4519  domain of unknown function DUF1745  36.89 
 
 		 387 aa  218  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317884  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4193  domain of unknown function DUF1745  37.18 
 
 		 386 aa  218  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351241  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2940  hypothetical protein  39.37 
 
 		 402 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00513133 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2201  domain of unknown function DUF1745  36.34 
 
 		 398 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1925  hypothetical protein  36.34 
 
 		 398 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.795435 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1816  protein of unknown function DUF1745  35.61 
 
 		 389 aa  211  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.988519 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3551  hypothetical protein  33.06 
 
 		 371 aa  180  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3141  hypothetical protein  29.26 
 
 		 460 aa  179  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2474  hypothetical protein  31.72 
 
 		 447 aa  176  8e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2993  hypothetical protein  32.11 
 
 		 368 aa  164  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3344  hypothetical protein  32.77 
 
 		 464 aa  162  6e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5004  chemotaxis sensory transducer  27.82 
 
 		 672 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.71371 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0982  domain of unknown function DUF1745  31.07 
 
 		 666 aa  95.9  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.505903  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2590  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.98 
 
 		 675 aa  94.4  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182127  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0690  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 		 1186 aa  91.3  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2918  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.46 
 
 		 669 aa  91.3  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2083  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.83 
 
 		 647 aa  77.4  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0223967  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1269  hypothetical protein  25.56 
 
 		 387 aa  73.9  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2665  domain of unknown function DUF1745  27.35 
 
 		 427 aa  73.6  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.955158 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1866  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.71 
 
 		 650 aa  65.5  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1054  hypothetical protein  26.14 
 
 		 405 aa  61.6  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0824  hypothetical protein  26.61 
 
 		 379 aa  60.1  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3657  domain of unknown function DUF1745  23.21 
 
 		 416 aa  57.4  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1202  fused sensor protein/response regulator  22.88 
 
 		 934 aa  55.8  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127641  normal  0.087847 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1909  domain of unknown function DUF1745  25.07 
 
 		 408 aa  55.8  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05570  hypothetical protein  29.66 
 
 		 387 aa  54.7  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0690  hypothetical protein  26.89 
 
 		 376 aa  53.5  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000847515 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0696  transcriptional regulator, TrmB  22.19 
 
 		 512 aa  53.1  0.000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3322  domain of unknown function DUF1745  24.92 
 
 		 373 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1241  hypothetical protein  24.63 
 
 		 381 aa  51.2  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1520  domain of unknown function DUF1745  26.43 
 
 		 1101 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.593307 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1204  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  22.9 
 
 		 931 aa  50.8  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271509 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1203  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  24.07 
 
 		 932 aa  50.4  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00343755  normal  0.259486 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2079  domain of unknown function DUF1745  25.07 
 
 		 417 aa  49.3  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00286991  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1476  domain of unknown function DUF1745  23.4 
 
 		 629 aa  47.8  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.153758  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2542  hypothetical protein  23.27 
 
 		 395 aa  47.8  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0615  hypothetical protein  24.58 
 
 		 468 aa  47  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.948448  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1561  hypothetical protein  22.69 
 
 		 394 aa  46.6  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0408772  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003465  hypothetical protein  22.89 
 
 		 393 aa  46.6  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0296  hypothetical protein  32.95 
 
 		 160 aa  46.2  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0911  hypothetical protein  24.2 
 
 		 400 aa  45.1  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.36206  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0550  hypothetical protein  25.45 
 
 		 467 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1369  hypothetical protein  25.27 
 
 		 468 aa  43.5  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3184  hypothetical protein  26.4 
 
 		 377 aa  43.5  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2151  hypothetical protein  22.63 
 
 		 383 aa  43.5  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.509879 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>