26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0550 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0288  hypothetical protein  94.65 
 
 
467 aa  897    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1369  hypothetical protein  93.78 
 
 
468 aa  884    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0615  hypothetical protein  67.52 
 
 
468 aa  644    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.948448  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0550  hypothetical protein  100 
 
 
467 aa  940    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1435  hypothetical protein  53.49 
 
 
501 aa  523  1e-147  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.95663  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2153  hypothetical protein  24.81 
 
 
400 aa  80.1  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0824  hypothetical protein  25.33 
 
 
379 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0690  hypothetical protein  22.73 
 
 
376 aa  74.3  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000847515 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1909  domain of unknown function DUF1745  23.22 
 
 
408 aa  72.4  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2107  domain of unknown function DUF1745  22.8 
 
 
401 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.206498 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2079  domain of unknown function DUF1745  23.96 
 
 
417 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00286991  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1352  domain of unknown function DUF1745  23.83 
 
 
396 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3322200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1269  hypothetical protein  20.26 
 
 
387 aa  57.4  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2864  domain of unknown function DUF1745  22.71 
 
 
396 aa  55.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.965957  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4131  domain of unknown function DUF1745  25.65 
 
 
396 aa  54.3  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2151  hypothetical protein  22.34 
 
 
383 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.509879 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1434  domain of unknown function DUF1745  29.48 
 
 
402 aa  51.2  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.318192  normal  0.236861 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1892  hypothetical protein  40 
 
 
382 aa  50.4  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.056146  normal  0.181862 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0732  hypothetical protein  20.85 
 
 
386 aa  49.7  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4040  domain of unknown function DUF1745  25.76 
 
 
396 aa  48.9  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2659  hypothetical protein  23.41 
 
 
406 aa  46.6  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2592  hypothetical protein  21.31 
 
 
386 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71341  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1250  hypothetical protein  21.22 
 
 
386 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.7579 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2119  hypothetical protein  22.49 
 
 
402 aa  44.7  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2665  domain of unknown function DUF1745  27.6 
 
 
427 aa  44.7  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.955158 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3657  domain of unknown function DUF1745  21.54 
 
 
416 aa  43.5  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>