107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_4040 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_4040  domain of unknown function DUF1745  100 
 
 		 396 aa  822    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4131  domain of unknown function DUF1745  94.19 
 
 		 396 aa  773    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2119  hypothetical protein  64.3 
 
 		 402 aa  559  1e-158  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1352  domain of unknown function DUF1745  62.12 
 
 		 396 aa  530  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3322200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2864  domain of unknown function DUF1745  61.87 
 
 		 396 aa  527  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.965957  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1269  hypothetical protein  27.86 
 
 		 387 aa  145  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1909  domain of unknown function DUF1745  25.88 
 
 		 408 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8558  hypothetical protein  29.37 
 
 		 398 aa  129  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2107  domain of unknown function DUF1745  25.39 
 
 		 401 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.206498 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0690  hypothetical protein  26.21 
 
 		 376 aa  124  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000847515 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0911  hypothetical protein  22.47 
 
 		 400 aa  117  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.36206  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1055  domain of unknown function DUF1745  29.29 
 
 		 389 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2079  domain of unknown function DUF1745  24.5 
 
 		 417 aa  114  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00286991  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0012  hypothetical protein  25.94 
 
 		 379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0572769  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3254  domain of unknown function DUF1745  27.41 
 
 		 385 aa  110  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126453  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3113  hypothetical protein  26.84 
 
 		 397 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.680527  hitchhiker  0.0000208643 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0824  hypothetical protein  26.41 
 
 		 379 aa  108  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2153  hypothetical protein  24.08 
 
 		 400 aa  103  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4141  hypothetical protein  25.33 
 
 		 365 aa  103  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3246  domain of unknown function DUF1745  24.11 
 
 		 396 aa  102  9e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116005  normal  0.61148 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2954  hypothetical protein  26.68 
 
 		 395 aa  102  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2151  hypothetical protein  24.29 
 
 		 383 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.509879 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1241  hypothetical protein  25.81 
 
 		 381 aa  100  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1400  domain of unknown function DUF1745  26.29 
 
 		 398 aa  99.4  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.653815  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1891  hypothetical protein  24.47 
 
 		 391 aa  97.8  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.473859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2659  hypothetical protein  27.23 
 
 		 406 aa  95.9  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0889  hypothetical protein  27.9 
 
 		 374 aa  95.1  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1561  hypothetical protein  25.53 
 
 		 404 aa  94.4  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0091  domain of unknown function DUF1745  26.8 
 
 		 383 aa  94.7  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3322  domain of unknown function DUF1745  26.69 
 
 		 373 aa  94.4  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4044  hypothetical protein  24.25 
 
 		 401 aa  94  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0444  hypothetical protein  25.74 
 
 		 412 aa  92.4  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10639  hypothetical protein  27.4 
 
 		 383 aa  92  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000135133  normal  0.805152 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2665  domain of unknown function DUF1745  23.88 
 
 		 427 aa  92.4  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.955158 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10891  hypothetical protein  27.85 
 
 		 386 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.824347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0360  hypothetical protein  29.28 
 
 		 398 aa  88.2  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.435591  normal  0.396986 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1520  domain of unknown function DUF1745  24.92 
 
 		 1101 aa  88.2  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.593307 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3390  hypothetical protein  26.98 
 
 		 414 aa  87.8  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.0973611 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0354  hypothetical protein  23.66 
 
 		 387 aa  85.5  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1899  hypothetical protein  26.49 
 
 		 395 aa  84.3  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.598311  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0331  hypothetical protein  23.92 
 
 		 387 aa  83.6  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0913  domain of unknown function DUF1745  23.77 
 
 		 414 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0940  domain of unknown function DUF1745  23.77 
 
 		 414 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3184  hypothetical protein  21.2 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1049  hypothetical protein  29.05 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198533 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3242  domain of unknown function DUF1745  24.08 
 
 		 371 aa  79  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0186777  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4241  domain of unknown function DUF1745  26.83 
 
 		 411 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000432273  hitchhiker  0.00000452646 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2568  FIST C domain protein  27.83 
 
 		 375 aa  77.4  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0105627  normal  0.0110126 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2191  diguanylate cyclase  24.62 
 
 		 806 aa  73.9  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00068502 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4078  domain of unknown function DUF1745  24.59 
 
 		 411 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3657  domain of unknown function DUF1745  25.19 
 
 		 416 aa  71.2  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1108  domain of unknown function DUF1745  24.06 
 
 		 378 aa  70.5  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1387  hypothetical protein  24.06 
 
 		 378 aa  70.5  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0438  domain of unknown function DUF1745  25.51 
 
 		 398 aa  67.8  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2305  domain of unknown function DUF1745  20.99 
 
 		 389 aa  66.6  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3636  hypothetical protein  23.68 
 
 		 408 aa  65.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0371475  normal  0.276921 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0294  hypothetical protein  23.02 
 
 		 375 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3884  domain of unknown function DUF1745  25.43 
 
 		 1852 aa  63.9  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0268  diguanylate cyclase  23.2 
 
 		 933 aa  62.8  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0380534  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1476  domain of unknown function DUF1745  23.4 
 
 		 629 aa  62.8  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.153758  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1203  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  23.33 
 
 		 932 aa  61.2  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00343755  normal  0.259486 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2063  hypothetical protein  24.48 
 
 		 425 aa  60.8  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.748308  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0281  hypothetical protein  24.48 
 
 		 431 aa  60.8  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.812324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0696  transcriptional regulator, TrmB  21.78 
 
 		 512 aa  60.5  0.00000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24381  hypothetical protein  23.14 
 
 		 429 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2912  hypothetical protein  24.69 
 
 		 387 aa  58.9  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5581  hypothetical protein  23.27 
 
 		 396 aa  56.2  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.19369  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0140  FIST C domain protein  23.56 
 
 		 379 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6102  domain of unknown function DUF1745  25 
 
 		 386 aa  55.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2052  domain of unknown function DUF1745  23.44 
 
 		 379 aa  54.3  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0615  hypothetical protein  26.1 
 
 		 468 aa  53.9  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.948448  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4045  hypothetical protein  24.45 
 
 		 378 aa  53.5  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1202  fused sensor protein/response regulator  22.83 
 
 		 934 aa  53.1  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127641  normal  0.087847 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1204  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  22.27 
 
 		 931 aa  53.1  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271509 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1369  hypothetical protein  26.52 
 
 		 468 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0732  hypothetical protein  22.41 
 
 		 386 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0306  hypothetical protein  23.57 
 
 		 447 aa  52  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3887  hypothetical protein  24.09 
 
 		 421 aa  51.6  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.894307 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1139  hypothetical protein  25.44 
 
 		 392 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3160  domain of unknown function DUF1745  24.09 
 
 		 421 aa  51.6  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1561  hypothetical protein  22.17 
 
 		 394 aa  50.8  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0408772  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1054  hypothetical protein  25.1 
 
 		 405 aa  49.7  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0550  hypothetical protein  25.76 
 
 		 467 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0527  hypothetical protein  23.11 
 
 		 411 aa  49.7  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.437223  hitchhiker  0.00000299697 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0288  hypothetical protein  25.5 
 
 		 467 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2339  domain of unknown function DUF1745  22.44 
 
 		 383 aa  48.9  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0895  FIST C domain protein  22.49 
 
 		 350 aa  48.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000443325  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0710  hypothetical protein  22.28 
 
 		 384 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.251408  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2230  hypothetical protein  22.28 
 
 		 392 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1661  hypothetical protein  21.85 
 
 		 384 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1717  hypothetical protein  21.85 
 
 		 392 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1924  hypothetical protein  21.85 
 
 		 392 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2313  GfdT protein  21.85 
 
 		 392 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0600  hypothetical protein  21.85 
 
 		 392 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02432  hypothetical protein  25 
 
 		 391 aa  46.2  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29005  predicted protein  22.22 
 
 		 313 aa  45.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.161534  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3953  hypothetical protein  22.8 
 
 		 389 aa  45.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1892  hypothetical protein  30.38 
 
 		 382 aa  45.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.056146  normal  0.181862 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3261  hypothetical protein  25.1 
 
 		 419 aa  45.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.389498 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1883  hypothetical protein  21.49 
 
 		 382 aa  44.7  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>