33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2542 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2542  hypothetical protein  100 
 
 		 395 aa  818    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1892  hypothetical protein  38.36 
 
 		 382 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.056146  normal  0.181862 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02432  hypothetical protein  34.26 
 
 		 391 aa  243  5e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1434  domain of unknown function DUF1745  41.4 
 
 		 402 aa  226  4e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.318192  normal  0.236861 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003465  hypothetical protein  36.31 
 
 		 393 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1054  hypothetical protein  35.11 
 
 		 405 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1561  hypothetical protein  34.13 
 
 		 394 aa  192  6e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0408772  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02305  hypothetical protein  36.68 
 
 		 395 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05570  hypothetical protein  31.97 
 
 		 387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1269  hypothetical protein  26.64 
 
 		 387 aa  67.4  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0824  hypothetical protein  25.3 
 
 		 379 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2954  hypothetical protein  24.9 
 
 		 395 aa  53.9  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4141  hypothetical protein  25 
 
 		 365 aa  53.9  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3518  hypothetical protein  23.91 
 
 		 400 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.49503  normal  0.689004 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1909  domain of unknown function DUF1745  23.29 
 
 		 408 aa  50.1  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3362  hypothetical protein  24.07 
 
 		 377 aa  49.7  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.103972 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3322  domain of unknown function DUF1745  23.02 
 
 		 373 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2724  domain of unknown function DUF1745  23.27 
 
 		 374 aa  48.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.43445  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0354  hypothetical protein  24.7 
 
 		 387 aa  47.4  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0331  hypothetical protein  24.7 
 
 		 387 aa  47.4  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0696  transcriptional regulator, TrmB  23.83 
 
 		 512 aa  47.4  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3141  hypothetical protein  24.47 
 
 		 460 aa  46.6  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4131  domain of unknown function DUF1745  19.41 
 
 		 396 aa  46.2  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1520  domain of unknown function DUF1745  22.9 
 
 		 1101 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.593307 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3657  domain of unknown function DUF1745  22.52 
 
 		 416 aa  44.3  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1899  hypothetical protein  23.46 
 
 		 395 aa  43.9  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.598311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1816  protein of unknown function DUF1745  23.35 
 
 		 389 aa  43.5  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.988519 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0615  hypothetical protein  24.12 
 
 		 468 aa  43.9  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.948448  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2201  domain of unknown function DUF1745  23.79 
 
 		 398 aa  43.5  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0690  hypothetical protein  21.55 
 
 		 376 aa  43.5  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000847515 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3617  hypothetical protein  22.17 
 
 		 378 aa  43.1  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0308687  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1925  hypothetical protein  23.79 
 
 		 398 aa  43.1  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.795435 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0268  diguanylate cyclase  21.37 
 
 		 933 aa  42.7  0.01  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0380534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>