111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2954 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2954  hypothetical protein  100 
 
 		 395 aa  798    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4141  hypothetical protein  56.47 
 
 		 365 aa  402  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3322  domain of unknown function DUF1745  44.44 
 
 		 373 aa  302  6.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1899  hypothetical protein  44.38 
 
 		 395 aa  299  6e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.598311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1241  hypothetical protein  43.5 
 
 		 381 aa  296  4e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0012  hypothetical protein  41.51 
 
 		 379 aa  284  2.0000000000000002e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0572769  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1520  domain of unknown function DUF1745  41.97 
 
 		 1101 aa  278  8e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.593307 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0354  hypothetical protein  40.42 
 
 		 387 aa  277  2e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0331  hypothetical protein  40.94 
 
 		 387 aa  277  2e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3184  hypothetical protein  39.95 
 
 		 377 aa  271  1e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0140  FIST C domain protein  39.9 
 
 		 379 aa  260  3e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3884  domain of unknown function DUF1745  37.67 
 
 		 1852 aa  209  8e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2107  domain of unknown function DUF1745  32.04 
 
 		 401 aa  152  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.206498 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1909  domain of unknown function DUF1745  30 
 
 		 408 aa  147  4.0000000000000006e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2153  hypothetical protein  32.8 
 
 		 400 aa  145  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2079  domain of unknown function DUF1745  31.62 
 
 		 417 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00286991  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2151  hypothetical protein  28.45 
 
 		 383 aa  140  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.509879 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2305  domain of unknown function DUF1745  29.8 
 
 		 389 aa  124  4e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1352  domain of unknown function DUF1745  27.42 
 
 		 396 aa  119  7e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3322200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2119  hypothetical protein  26.98 
 
 		 402 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2864  domain of unknown function DUF1745  27.96 
 
 		 396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.965957  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0690  hypothetical protein  27.27 
 
 		 376 aa  114  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000847515 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1269  hypothetical protein  27.95 
 
 		 387 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0294  hypothetical protein  25.73 
 
 		 375 aa  105  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4131  domain of unknown function DUF1745  26.42 
 
 		 396 aa  103  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4040  domain of unknown function DUF1745  26.68 
 
 		 396 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0824  hypothetical protein  28.65 
 
 		 379 aa  100  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0268  diguanylate cyclase  24.27 
 
 		 933 aa  96.7  7e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0380534  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1476  domain of unknown function DUF1745  25.81 
 
 		 629 aa  91.3  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.153758  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3657  domain of unknown function DUF1745  28.93 
 
 		 416 aa  90.5  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2665  domain of unknown function DUF1745  25.25 
 
 		 427 aa  84  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.955158 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1203  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  24.05 
 
 		 932 aa  83.6  0.000000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00343755  normal  0.259486 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1204  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  23.23 
 
 		 931 aa  80.5  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271509 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1202  fused sensor protein/response regulator  22.98 
 
 		 934 aa  77  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127641  normal  0.087847 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4044  hypothetical protein  26.95 
 
 		 401 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002115  sensory box/GGDEF family protein  28 
 
 		 828 aa  70.1  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0889  hypothetical protein  33.48 
 
 		 374 aa  69.7  0.00000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3242  domain of unknown function DUF1745  27.54 
 
 		 371 aa  69.3  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0186777  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0696  transcriptional regulator, TrmB  23.51 
 
 		 512 aa  66.2  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00305  sensory transduction protein kinase  27.94 
 
 		 828 aa  64.7  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3254  domain of unknown function DUF1745  29.89 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126453  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0911  hypothetical protein  23.48 
 
 		 400 aa  63.9  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.36206  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0444  hypothetical protein  33.62 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0526  hypothetical protein  24.62 
 
 		 380 aa  63.2  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8558  hypothetical protein  29.89 
 
 		 398 aa  62.8  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0895  FIST C domain protein  23.9 
 
 		 350 aa  62  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000443325  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2052  domain of unknown function DUF1745  24.11 
 
 		 379 aa  62  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0128  hypothetical protein  24.35 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.193314  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0091  domain of unknown function DUF1745  30.67 
 
 		 383 aa  61.2  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3362  hypothetical protein  25.09 
 
 		 377 aa  61.2  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.103972 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1891  hypothetical protein  32.75 
 
 		 391 aa  61.2  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.473859  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1561  hypothetical protein  24.47 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0688  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.5 
 
 		 951 aa  61.2  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00399648  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3953  hypothetical protein  25.81 
 
 		 389 aa  60.5  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2474  hypothetical protein  28.38 
 
 		 447 aa  59.7  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2912  hypothetical protein  31.32 
 
 		 387 aa  59.7  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5581  hypothetical protein  32.07 
 
 		 396 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.19369  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3113  hypothetical protein  27.69 
 
 		 397 aa  57  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.680527  hitchhiker  0.0000208643 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2389  GGDEF family protein  26.15 
 
 		 829 aa  56.2  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1108  domain of unknown function DUF1745  28.21 
 
 		 378 aa  55.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1387  hypothetical protein  28.21 
 
 		 378 aa  55.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1139  hypothetical protein  26.6 
 
 		 392 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3140  hypothetical protein  30.04 
 
 		 387 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6102  domain of unknown function DUF1745  25.67 
 
 		 386 aa  55.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2663  hypothetical protein  30.43 
 
 		 387 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3246  domain of unknown function DUF1745  23.27 
 
 		 396 aa  54.7  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116005  normal  0.61148 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2542  hypothetical protein  24.9 
 
 		 395 aa  53.9  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1661  hypothetical protein  27.42 
 
 		 384 aa  53.5  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1049  hypothetical protein  25.2 
 
 		 406 aa  53.9  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198533 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2171  hypothetical protein  30.04 
 
 		 387 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1717  hypothetical protein  27.42 
 
 		 392 aa  53.5  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1924  hypothetical protein  27.42 
 
 		 392 aa  53.5  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2313  GfdT protein  27.42 
 
 		 392 aa  53.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0600  hypothetical protein  27.42 
 
 		 392 aa  53.5  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0710  hypothetical protein  27.42 
 
 		 384 aa  53.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.251408  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3141  hypothetical protein  23.95 
 
 		 460 aa  53.1  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2230  hypothetical protein  27.42 
 
 		 392 aa  53.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1055  domain of unknown function DUF1745  28.85 
 
 		 389 aa  52.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0732  hypothetical protein  27.27 
 
 		 386 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2675  hypothetical protein  27.52 
 
 		 399 aa  52  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0296571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2339  domain of unknown function DUF1745  28.69 
 
 		 383 aa  51.2  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2568  FIST C domain protein  29.02 
 
 		 375 aa  51.2  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0105627  normal  0.0110126 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3344  hypothetical protein  26.27 
 
 		 464 aa  50.8  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0466  domain of unknown function DUF1745  26.86 
 
 		 385 aa  50.8  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0438  domain of unknown function DUF1745  28.11 
 
 		 398 aa  50.8  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1434  domain of unknown function DUF1745  25.75 
 
 		 402 aa  50.8  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.318192  normal  0.236861 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1054  hypothetical protein  25.51 
 
 		 405 aa  50.4  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2659  hypothetical protein  28.1 
 
 		 406 aa  50.1  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10891  hypothetical protein  27.46 
 
 		 386 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.824347  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1883  hypothetical protein  26.15 
 
 		 382 aa  49.7  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1872  hypothetical protein  25.86 
 
 		 381 aa  50.1  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3390  hypothetical protein  24.48 
 
 		 414 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.0973611 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1527  hypothetical protein  27.17 
 
 		 390 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.039182 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1503  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.57 
 
 		 947 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2881  hypothetical protein  26.56 
 
 		 390 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3636  hypothetical protein  27.41 
 
 		 408 aa  47.8  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0371475  normal  0.276921 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4045  hypothetical protein  26.82 
 
 		 378 aa  47.4  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02432  hypothetical protein  21.29 
 
 		 391 aa  47.4  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0360  hypothetical protein  27 
 
 		 398 aa  47.4  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.435591  normal  0.396986 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3617  hypothetical protein  27.02 
 
 		 378 aa  47  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0308687  normal  0.0797948 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>