72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3242 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3242  domain of unknown function DUF1745  100 
 
 		 371 aa  744    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0186777  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0889  hypothetical protein  53.53 
 
 		 374 aa  345  7e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2568  FIST C domain protein  48.53 
 
 		 375 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0105627  normal  0.0110126 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1108  domain of unknown function DUF1745  46.01 
 
 		 378 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1387  hypothetical protein  46.01 
 
 		 378 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0438  domain of unknown function DUF1745  40.23 
 
 		 398 aa  212  9e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3636  hypothetical protein  36.01 
 
 		 408 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0371475  normal  0.276921 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4934  hypothetical protein  35.1 
 
 		 422 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4508  hypothetical protein  36.71 
 
 		 439 aa  184  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260066 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2912  hypothetical protein  36.75 
 
 		 387 aa  182  8.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0622  hypothetical protein  35.44 
 
 		 427 aa  181  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5581  hypothetical protein  35.71 
 
 		 396 aa  180  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.19369  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3160  domain of unknown function DUF1745  36.98 
 
 		 421 aa  178  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3887  hypothetical protein  36.98 
 
 		 421 aa  178  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.894307 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0750  domain of unknown function DUF1745  34.69 
 
 		 426 aa  174  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0306  hypothetical protein  34.09 
 
 		 447 aa  173  3.9999999999999995e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3261  hypothetical protein  34.69 
 
 		 419 aa  173  5e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.389498 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0450  hypothetical protein  33.09 
 
 		 430 aa  168  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0360  hypothetical protein  30.79 
 
 		 398 aa  126  7e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.435591  normal  0.396986 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4044  hypothetical protein  32.95 
 
 		 401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1561  hypothetical protein  27.18 
 
 		 404 aa  112  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8558  hypothetical protein  31.66 
 
 		 398 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1891  hypothetical protein  30.63 
 
 		 391 aa  106  5e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.473859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10639  hypothetical protein  36.79 
 
 		 383 aa  102  7e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000135133  normal  0.805152 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4241  domain of unknown function DUF1745  27.14 
 
 		 411 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000432273  hitchhiker  0.00000452646 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1400  domain of unknown function DUF1745  26.14 
 
 		 398 aa  102  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.653815  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0940  domain of unknown function DUF1745  27.7 
 
 		 414 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0913  domain of unknown function DUF1745  27.7 
 
 		 414 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0527  hypothetical protein  34.98 
 
 		 411 aa  101  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.437223  hitchhiker  0.00000299697 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2063  hypothetical protein  27.96 
 
 		 425 aa  99.8  7e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.748308  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4078  domain of unknown function DUF1745  32.08 
 
 		 411 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10891  hypothetical protein  30.19 
 
 		 386 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.824347  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3113  hypothetical protein  29.97 
 
 		 397 aa  99  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.680527  hitchhiker  0.0000208643 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0281  hypothetical protein  27.6 
 
 		 431 aa  98.2  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.812324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24381  hypothetical protein  26.65 
 
 		 429 aa  96.7  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3254  domain of unknown function DUF1745  32.32 
 
 		 385 aa  96.7  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126453  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1055  domain of unknown function DUF1745  32.7 
 
 		 389 aa  96.3  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0444  hypothetical protein  31.8 
 
 		 412 aa  96.3  9e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3390  hypothetical protein  26.19 
 
 		 414 aa  96.3  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.0973611 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2119  hypothetical protein  24.17 
 
 		 402 aa  94.4  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3246  domain of unknown function DUF1745  30.3 
 
 		 396 aa  94.4  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116005  normal  0.61148 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1049  hypothetical protein  25.85 
 
 		 406 aa  92.8  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198533 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1352  domain of unknown function DUF1745  27.59 
 
 		 396 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3322200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2864  domain of unknown function DUF1745  26.76 
 
 		 396 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.965957  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0091  domain of unknown function DUF1745  30.69 
 
 		 383 aa  79.7  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4040  domain of unknown function DUF1745  24.08 
 
 		 396 aa  79  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4131  domain of unknown function DUF1745  23.48 
 
 		 396 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2954  hypothetical protein  27.54 
 
 		 395 aa  69.3  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1899  hypothetical protein  28.9 
 
 		 395 aa  67  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.598311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1241  hypothetical protein  26.17 
 
 		 381 aa  65.5  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3184  hypothetical protein  27.01 
 
 		 377 aa  65.1  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1520  domain of unknown function DUF1745  30.16 
 
 		 1101 aa  64.3  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.593307 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2151  hypothetical protein  25.21 
 
 		 383 aa  60.5  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.509879 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0012  hypothetical protein  27.32 
 
 		 379 aa  57.8  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0572769  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2191  diguanylate cyclase  23.75 
 
 		 806 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00068502 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3322  domain of unknown function DUF1745  20.22 
 
 		 373 aa  53.1  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0268  diguanylate cyclase  27.87 
 
 		 933 aa  51.6  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0380534  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29005  predicted protein  27.1 
 
 		 313 aa  49.7  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.161534  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1203  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  24.87 
 
 		 932 aa  49.3  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00343755  normal  0.259486 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0294  hypothetical protein  25.44 
 
 		 375 aa  48.5  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1269  hypothetical protein  27.37 
 
 		 387 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4141  hypothetical protein  27.98 
 
 		 365 aa  47.8  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2659  hypothetical protein  28.36 
 
 		 406 aa  47.4  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1154  hypothetical protein  30.28 
 
 		 338 aa  45.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0140  FIST C domain protein  23.94 
 
 		 379 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02305  hypothetical protein  33.33 
 
 		 395 aa  45.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2153  hypothetical protein  25.84 
 
 		 400 aa  44.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02432  hypothetical protein  22.12 
 
 		 391 aa  43.5  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3657  domain of unknown function DUF1745  23.12 
 
 		 416 aa  43.1  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0852  hypothetical protein  25.22 
 
 		 366 aa  43.1  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.214609  normal  0.0568349 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0996  hypothetical protein  25.22 
 
 		 366 aa  43.1  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0343118  normal  0.112953 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1202  fused sensor protein/response regulator  24.21 
 
 		 934 aa  42.7  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127641  normal  0.087847 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>