27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0526 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0526  hypothetical protein  100 
 
 		 380 aa  780    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3362  hypothetical protein  33.24 
 
 		 377 aa  202  5e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.103972 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0128  hypothetical protein  29.41 
 
 		 379 aa  181  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.193314  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0895  FIST C domain protein  27.17 
 
 		 350 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000443325  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0690  hypothetical protein  27.84 
 
 		 376 aa  117  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000847515 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1269  hypothetical protein  32.44 
 
 		 387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3873  hypothetical protein  23.9 
 
 		 380 aa  92  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0824  hypothetical protein  24.36 
 
 		 379 aa  72  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2052  domain of unknown function DUF1745  31.05 
 
 		 379 aa  69.3  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2954  hypothetical protein  24.62 
 
 		 395 aa  63.2  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1899  hypothetical protein  22.14 
 
 		 395 aa  60.1  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.598311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1520  domain of unknown function DUF1745  24.25 
 
 		 1101 aa  57.4  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.593307 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3322  domain of unknown function DUF1745  21.69 
 
 		 373 aa  56.6  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0354  hypothetical protein  23.96 
 
 		 387 aa  55.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2665  domain of unknown function DUF1745  21.93 
 
 		 427 aa  53.5  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.955158 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1241  hypothetical protein  22.3 
 
 		 381 aa  52  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3657  domain of unknown function DUF1745  23.74 
 
 		 416 aa  51.6  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2107  domain of unknown function DUF1745  23.85 
 
 		 401 aa  49.7  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.206498 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0012  hypothetical protein  23.33 
 
 		 379 aa  48.9  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0572769  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4141  hypothetical protein  25.94 
 
 		 365 aa  49.3  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1909  domain of unknown function DUF1745  24.11 
 
 		 408 aa  47.8  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0331  hypothetical protein  24.11 
 
 		 387 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0140  FIST C domain protein  24.86 
 
 		 379 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0268  diguanylate cyclase  24.72 
 
 		 933 aa  45.1  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0380534  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3184  hypothetical protein  23.05 
 
 		 377 aa  44.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003465  hypothetical protein  24.85 
 
 		 393 aa  43.9  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0466  domain of unknown function DUF1745  25.82 
 
 		 385 aa  43.1  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>