20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3873 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3873  hypothetical protein  100 
 
 		 380 aa  775    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0128  hypothetical protein  27.2 
 
 		 379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.193314  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3362  hypothetical protein  27.22 
 
 		 377 aa  106  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.103972 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0690  hypothetical protein  26.25 
 
 		 376 aa  94  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000847515 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0526  hypothetical protein  23.9 
 
 		 380 aa  92  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1269  hypothetical protein  30.94 
 
 		 387 aa  91.3  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0824  hypothetical protein  29.09 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1909  domain of unknown function DUF1745  24.57 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0895  FIST C domain protein  27.41 
 
 		 350 aa  59.3  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000443325  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2153  hypothetical protein  24.37 
 
 		 400 aa  55.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2079  domain of unknown function DUF1745  23.74 
 
 		 417 aa  48.5  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00286991  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2052  domain of unknown function DUF1745  25.41 
 
 		 379 aa  48.5  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1434  domain of unknown function DUF1745  25.13 
 
 		 402 aa  47.8  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.318192  normal  0.236861 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3657  domain of unknown function DUF1745  26.14 
 
 		 416 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1561  hypothetical protein  24.56 
 
 		 394 aa  45.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0408772  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2665  domain of unknown function DUF1745  23.47 
 
 		 427 aa  45.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.955158 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1352  domain of unknown function DUF1745  24.7 
 
 		 396 aa  44.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3322200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2954  hypothetical protein  25.82 
 
 		 395 aa  43.9  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2864  domain of unknown function DUF1745  24.7 
 
 		 396 aa  43.5  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.965957  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2305  domain of unknown function DUF1745  23.32 
 
 		 389 aa  42.7  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>