58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5581 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5581  hypothetical protein  100 
 
 
396 aa  797    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.19369  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3636  hypothetical protein  54.94 
 
 
408 aa  410  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0371475  normal  0.276921 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0438  domain of unknown function DUF1745  55.7 
 
 
398 aa  400  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2912  hypothetical protein  57.65 
 
 
387 aa  397  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4508  hypothetical protein  48.62 
 
 
439 aa  370  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.260066 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3261  hypothetical protein  53.14 
 
 
419 aa  366  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.389498 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0450  hypothetical protein  48.84 
 
 
430 aa  367  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2266  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0622  hypothetical protein  48.38 
 
 
427 aa  367  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0306  hypothetical protein  48.26 
 
 
447 aa  355  5.999999999999999e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0750  domain of unknown function DUF1745  50.12 
 
 
426 aa  355  7.999999999999999e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4934  hypothetical protein  48.21 
 
 
422 aa  353  4e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3160  domain of unknown function DUF1745  50.24 
 
 
421 aa  339  5.9999999999999996e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3887  hypothetical protein  50.24 
 
 
421 aa  339  5.9999999999999996e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.894307 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1387  hypothetical protein  36.59 
 
 
378 aa  249  8e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1108  domain of unknown function DUF1745  36.59 
 
 
378 aa  249  8e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0889  hypothetical protein  38.7 
 
 
374 aa  229  6e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0527  hypothetical protein  38.63 
 
 
411 aa  195  9e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.437223  hitchhiker  0.00000299697 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2568  FIST C domain protein  34.27 
 
 
375 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0105627  normal  0.0110126 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3242  domain of unknown function DUF1745  35.44 
 
 
371 aa  188  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0186777  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0360  hypothetical protein  30.27 
 
 
398 aa  119  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.435591  normal  0.396986 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1561  hypothetical protein  27.76 
 
 
404 aa  115  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1049  hypothetical protein  28.02 
 
 
406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198533 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4044  hypothetical protein  29.28 
 
 
401 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4241  domain of unknown function DUF1745  27.86 
 
 
411 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000432273  hitchhiker  0.00000452646 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24381  hypothetical protein  26.88 
 
 
429 aa  106  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8558  hypothetical protein  33.2 
 
 
398 aa  106  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0940  domain of unknown function DUF1745  27.95 
 
 
414 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0913  domain of unknown function DUF1745  27.95 
 
 
414 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3113  hypothetical protein  33.33 
 
 
397 aa  103  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.680527  hitchhiker  0.0000208643 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3246  domain of unknown function DUF1745  26.52 
 
 
396 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116005  normal  0.61148 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1055  domain of unknown function DUF1745  31.78 
 
 
389 aa  94.7  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3390  hypothetical protein  25.3 
 
 
414 aa  92  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.0973611 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1891  hypothetical protein  31.52 
 
 
391 aa  91.3  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.473859  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4078  domain of unknown function DUF1745  26.38 
 
 
411 aa  89.4  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0444  hypothetical protein  31.98 
 
 
412 aa  88.2  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1400  domain of unknown function DUF1745  26.46 
 
 
398 aa  87.4  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.653815  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3254  domain of unknown function DUF1745  29.33 
 
 
385 aa  85.5  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126453  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10639  hypothetical protein  30.71 
 
 
383 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000135133  normal  0.805152 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2063  hypothetical protein  23.68 
 
 
425 aa  82.8  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.748308  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10891  hypothetical protein  31.42 
 
 
386 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.824347  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0281  hypothetical protein  25.19 
 
 
431 aa  79.3  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.812324  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0091  domain of unknown function DUF1745  30 
 
 
383 aa  74.7  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189874  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2119  hypothetical protein  25.61 
 
 
402 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2864  domain of unknown function DUF1745  26.94 
 
 
396 aa  67  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.965957  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1352  domain of unknown function DUF1745  26.53 
 
 
396 aa  63.9  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3322200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2954  hypothetical protein  32.07 
 
 
395 aa  63.9  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4131  domain of unknown function DUF1745  22.95 
 
 
396 aa  59.7  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4040  domain of unknown function DUF1745  22.91 
 
 
396 aa  58.9  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3322  domain of unknown function DUF1745  30.1 
 
 
373 aa  56.6  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2659  hypothetical protein  27.75 
 
 
406 aa  55.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0911  hypothetical protein  25 
 
 
400 aa  54.7  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.36206  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1909  domain of unknown function DUF1745  28.37 
 
 
408 aa  53.9  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2191  diguanylate cyclase  24.54 
 
 
806 aa  53.9  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00068502 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1899  hypothetical protein  26.61 
 
 
395 aa  53.1  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.598311  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1241  hypothetical protein  26.17 
 
 
381 aa  52.4  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1520  domain of unknown function DUF1745  31.77 
 
 
1101 aa  49.7  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.593307 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2151  hypothetical protein  22.94 
 
 
383 aa  49.7  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.509879 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0140  FIST C domain protein  27.07 
 
 
379 aa  46.2  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>