76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1400 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1400  domain of unknown function DUF1745  100 
 
 		 398 aa  815    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.653815  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8558  hypothetical protein  38.99 
 
 		 398 aa  269  8e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1891  hypothetical protein  38.99 
 
 		 391 aa  252  6e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.473859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1055  domain of unknown function DUF1745  38.04 
 
 		 389 aa  248  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3113  hypothetical protein  36.84 
 
 		 397 aa  239  5e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.680527  hitchhiker  0.0000208643 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0444  hypothetical protein  36.59 
 
 		 412 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3246  domain of unknown function DUF1745  34.1 
 
 		 396 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116005  normal  0.61148 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10891  hypothetical protein  39.11 
 
 		 386 aa  233  5e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.824347  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0091  domain of unknown function DUF1745  38.38 
 
 		 383 aa  228  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10639  hypothetical protein  40.55 
 
 		 383 aa  228  1e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000135133  normal  0.805152 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4044  hypothetical protein  35.26 
 
 		 401 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1561  hypothetical protein  34.01 
 
 		 404 aa  223  4e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0940  domain of unknown function DUF1745  34.72 
 
 		 414 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0913  domain of unknown function DUF1745  34.72 
 
 		 414 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4241  domain of unknown function DUF1745  33.09 
 
 		 411 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000432273  hitchhiker  0.00000452646 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1049  hypothetical protein  34.17 
 
 		 406 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198533 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4078  domain of unknown function DUF1745  34.47 
 
 		 411 aa  209  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3390  hypothetical protein  32.86 
 
 		 414 aa  209  7e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.0973611 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3254  domain of unknown function DUF1745  35.07 
 
 		 385 aa  206  8e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126453  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0360  hypothetical protein  34.24 
 
 		 398 aa  202  9.999999999999999e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.435591  normal  0.396986 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24381  hypothetical protein  32.37 
 
 		 429 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2063  hypothetical protein  31.19 
 
 		 425 aa  158  1e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.748308  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0281  hypothetical protein  31.03 
 
 		 431 aa  148  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.812324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0889  hypothetical protein  25.7 
 
 		 374 aa  120  6e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3242  domain of unknown function DUF1745  26.4 
 
 		 371 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0186777  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3636  hypothetical protein  26.56 
 
 		 408 aa  107  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0371475  normal  0.276921 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4040  domain of unknown function DUF1745  26.29 
 
 		 396 aa  107  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4131  domain of unknown function DUF1745  26.37 
 
 		 396 aa  105  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1352  domain of unknown function DUF1745  25 
 
 		 396 aa  103  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3322200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2119  hypothetical protein  24.62 
 
 		 402 aa  103  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1387  hypothetical protein  27.22 
 
 		 378 aa  101  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1108  domain of unknown function DUF1745  27.22 
 
 		 378 aa  101  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2864  domain of unknown function DUF1745  24.73 
 
 		 396 aa  99.4  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.965957  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0306  hypothetical protein  27.85 
 
 		 447 aa  95.5  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2568  FIST C domain protein  30 
 
 		 375 aa  91.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0105627  normal  0.0110126 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0750  domain of unknown function DUF1745  28.05 
 
 		 426 aa  89.4  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5581  hypothetical protein  26.39 
 
 		 396 aa  88.6  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.19369  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0438  domain of unknown function DUF1745  27.18 
 
 		 398 aa  87.8  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0450  hypothetical protein  25.12 
 
 		 430 aa  87  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2912  hypothetical protein  26.16 
 
 		 387 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3160  domain of unknown function DUF1745  26.67 
 
 		 421 aa  78.6  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3887  hypothetical protein  26.67 
 
 		 421 aa  78.6  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.894307 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0622  hypothetical protein  24.26 
 
 		 427 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3261  hypothetical protein  27.64 
 
 		 419 aa  77.4  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.389498 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4934  hypothetical protein  27.08 
 
 		 422 aa  72.8  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1269  hypothetical protein  25.21 
 
 		 387 aa  63.5  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4508  hypothetical protein  24.61 
 
 		 439 aa  62.4  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260066 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1241  hypothetical protein  24.87 
 
 		 381 aa  59.3  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0996  hypothetical protein  23.18 
 
 		 366 aa  58.5  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0343118  normal  0.112953 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0852  hypothetical protein  23.18 
 
 		 366 aa  58.5  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.214609  normal  0.0568349 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29005  predicted protein  23.22 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.161534  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0690  hypothetical protein  24.66 
 
 		 376 aa  56.2  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000847515 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0268  diguanylate cyclase  21.41 
 
 		 933 aa  56.2  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0380534  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2305  domain of unknown function DUF1745  24.14 
 
 		 389 aa  55.1  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0824  hypothetical protein  24.59 
 
 		 379 aa  53.5  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3184  hypothetical protein  24.21 
 
 		 377 aa  53.1  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4045  hypothetical protein  25.32 
 
 		 378 aa  49.7  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3141  hypothetical protein  21.95 
 
 		 460 aa  48.9  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1154  hypothetical protein  26.42 
 
 		 338 aa  48.5  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0012  hypothetical protein  21.88 
 
 		 379 aa  48.5  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0572769  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1909  domain of unknown function DUF1745  23.27 
 
 		 408 aa  47.8  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0527  hypothetical protein  22.87 
 
 		 411 aa  48.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.437223  hitchhiker  0.00000299697 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2191  diguanylate cyclase  24.62 
 
 		 806 aa  47.4  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00068502 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1202  fused sensor protein/response regulator  22.91 
 
 		 934 aa  46.6  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127641  normal  0.087847 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2659  hypothetical protein  24.58 
 
 		 406 aa  46.6  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2151  hypothetical protein  20.43 
 
 		 383 aa  46.6  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.509879 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3657  domain of unknown function DUF1745  28.25 
 
 		 416 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1203  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  19.33 
 
 		 932 aa  45.8  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00343755  normal  0.259486 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1899  hypothetical protein  26.22 
 
 		 395 aa  46.2  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.598311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1204  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  21.36 
 
 		 931 aa  45.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271509 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2665  domain of unknown function DUF1745  25.85 
 
 		 427 aa  44.7  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.955158 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1939  hypothetical protein  25.97 
 
 		 384 aa  44.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2954  hypothetical protein  24.15 
 
 		 395 aa  43.9  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2079  domain of unknown function DUF1745  21.3 
 
 		 417 aa  43.5  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00286991  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0294  hypothetical protein  19.78 
 
 		 375 aa  43.5  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4141  hypothetical protein  26.8 
 
 		 365 aa  43.5  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>