51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0750 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0750  domain of unknown function DUF1745  100 
 
 		 426 aa  850    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0622  hypothetical protein  71.13 
 
 		 427 aa  592  1e-168  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0306  hypothetical protein  69.59 
 
 		 447 aa  585  1e-166  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0450  hypothetical protein  68.43 
 
 		 430 aa  576  1.0000000000000001e-163  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4508  hypothetical protein  69.04 
 
 		 439 aa  561  1.0000000000000001e-159  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260066 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4934  hypothetical protein  67.91 
 
 		 422 aa  560  1e-158  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3160  domain of unknown function DUF1745  64.27 
 
 		 421 aa  482  1e-135  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3887  hypothetical protein  64.27 
 
 		 421 aa  482  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.894307 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3636  hypothetical protein  55.35 
 
 		 408 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0371475  normal  0.276921 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3261  hypothetical protein  56.64 
 
 		 419 aa  384  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.389498 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5581  hypothetical protein  49.88 
 
 		 396 aa  363  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.19369  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0438  domain of unknown function DUF1745  46.9 
 
 		 398 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2912  hypothetical protein  46.37 
 
 		 387 aa  312  5.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0527  hypothetical protein  44.65 
 
 		 411 aa  279  7e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.437223  hitchhiker  0.00000299697 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0889  hypothetical protein  40.46 
 
 		 374 aa  228  1e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1108  domain of unknown function DUF1745  35.76 
 
 		 378 aa  224  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1387  hypothetical protein  35.76 
 
 		 378 aa  224  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3242  domain of unknown function DUF1745  34.93 
 
 		 371 aa  179  8e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0186777  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2568  FIST C domain protein  33.92 
 
 		 375 aa  177  3e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0105627  normal  0.0110126 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1049  hypothetical protein  28.67 
 
 		 406 aa  113  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198533 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0360  hypothetical protein  27.19 
 
 		 398 aa  112  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.435591  normal  0.396986 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1561  hypothetical protein  26.73 
 
 		 404 aa  105  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8558  hypothetical protein  30.55 
 
 		 398 aa  100  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0913  domain of unknown function DUF1745  26.57 
 
 		 414 aa  99.8  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0940  domain of unknown function DUF1745  26.57 
 
 		 414 aa  99.8  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4044  hypothetical protein  28.57 
 
 		 401 aa  99.8  9e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3113  hypothetical protein  30.94 
 
 		 397 aa  97.8  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.680527  hitchhiker  0.0000208643 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4241  domain of unknown function DUF1745  27.09 
 
 		 411 aa  96.3  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000432273  hitchhiker  0.00000452646 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1891  hypothetical protein  29.01 
 
 		 391 aa  91.3  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.473859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24381  hypothetical protein  26.78 
 
 		 429 aa  90.5  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1055  domain of unknown function DUF1745  31.98 
 
 		 389 aa  87.8  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4078  domain of unknown function DUF1745  23.46 
 
 		 411 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1400  domain of unknown function DUF1745  28.29 
 
 		 398 aa  84.3  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.653815  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3390  hypothetical protein  24.39 
 
 		 414 aa  83.2  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.0973611 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10639  hypothetical protein  31.84 
 
 		 383 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000135133  normal  0.805152 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10891  hypothetical protein  30.4 
 
 		 386 aa  77  0.0000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.824347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3246  domain of unknown function DUF1745  25.36 
 
 		 396 aa  74.3  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116005  normal  0.61148 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0444  hypothetical protein  29.27 
 
 		 412 aa  74.3  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2063  hypothetical protein  24.32 
 
 		 425 aa  69.3  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.748308  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0091  domain of unknown function DUF1745  28.73 
 
 		 383 aa  67.8  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3254  domain of unknown function DUF1745  27.99 
 
 		 385 aa  65.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126453  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2119  hypothetical protein  22.44 
 
 		 402 aa  62  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2864  domain of unknown function DUF1745  25.18 
 
 		 396 aa  62  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.965957  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1352  domain of unknown function DUF1745  24.82 
 
 		 396 aa  59.7  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3322200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0281  hypothetical protein  26.58 
 
 		 431 aa  59.3  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.812324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2659  hypothetical protein  27.47 
 
 		 406 aa  50.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4131  domain of unknown function DUF1745  23.17 
 
 		 396 aa  50.1  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2954  hypothetical protein  28.44 
 
 		 395 aa  50.1  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4040  domain of unknown function DUF1745  22.36 
 
 		 396 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1899  hypothetical protein  26.16 
 
 		 395 aa  48.5  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.598311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2191  diguanylate cyclase  22.13 
 
 		 806 aa  47.4  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00068502 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>