46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1561 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1561  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  821    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0408772  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003465  hypothetical protein  42.49 
 
 		 393 aa  352  7e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02305  hypothetical protein  44.56 
 
 		 395 aa  343  2.9999999999999997e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1054  hypothetical protein  43.18 
 
 		 405 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1434  domain of unknown function DUF1745  38.15 
 
 		 402 aa  275  9e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.318192  normal  0.236861 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1892  hypothetical protein  34.51 
 
 		 382 aa  234  3e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.056146  normal  0.181862 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2542  hypothetical protein  34.13 
 
 		 395 aa  192  6e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02432  hypothetical protein  32.84 
 
 		 391 aa  191  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05570  hypothetical protein  24.4 
 
 		 387 aa  94.4  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1269  hypothetical protein  21.32 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2474  hypothetical protein  22.7 
 
 		 447 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2864  domain of unknown function DUF1745  22.79 
 
 		 396 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.965957  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0824  hypothetical protein  20.81 
 
 		 379 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1352  domain of unknown function DUF1745  19.75 
 
 		 396 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3322200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0690  hypothetical protein  23.53 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000847515 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3141  hypothetical protein  22.19 
 
 		 460 aa  62  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2119  hypothetical protein  20.72 
 
 		 402 aa  61.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2151  hypothetical protein  24.25 
 
 		 383 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.509879 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3344  hypothetical protein  22.75 
 
 		 464 aa  57  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1939  hypothetical protein  23.43 
 
 		 384 aa  57  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0911  hypothetical protein  21.24 
 
 		 400 aa  57  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.36206  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2247  hypothetical protein  22.88 
 
 		 382 aa  53.1  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00169518  normal  0.316904 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4040  domain of unknown function DUF1745  22.17 
 
 		 396 aa  50.8  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3518  hypothetical protein  20.5 
 
 		 400 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.49503  normal  0.689004 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1203  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  22.65 
 
 		 932 aa  48.5  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00343755  normal  0.259486 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1872  hypothetical protein  21.38 
 
 		 381 aa  48.1  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1816  protein of unknown function DUF1745  21.13 
 
 		 389 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.988519 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1925  hypothetical protein  20.99 
 
 		 398 aa  47  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.795435 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2201  domain of unknown function DUF1745  20.99 
 
 		 398 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3617  hypothetical protein  19.26 
 
 		 378 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0308687  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1520  domain of unknown function DUF1745  20.27 
 
 		 1101 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.593307 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0732  hypothetical protein  22.88 
 
 		 386 aa  46.2  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1204  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  25.24 
 
 		 931 aa  46.2  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271509 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4141  hypothetical protein  18.62 
 
 		 365 aa  45.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2305  domain of unknown function DUF1745  23.11 
 
 		 389 aa  45.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4131  domain of unknown function DUF1745  19.91 
 
 		 396 aa  45.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0268  diguanylate cyclase  20.27 
 
 		 933 aa  45.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0380534  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1909  domain of unknown function DUF1745  20.37 
 
 		 408 aa  45.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3873  hypothetical protein  24.56 
 
 		 380 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4045  hypothetical protein  17.28 
 
 		 378 aa  44.7  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1202  fused sensor protein/response regulator  22.95 
 
 		 934 aa  44.7  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127641  normal  0.087847 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2052  domain of unknown function DUF1745  20.59 
 
 		 379 aa  44.3  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2954  hypothetical protein  19.73 
 
 		 395 aa  44.7  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0700  hypothetical protein  21.29 
 
 		 380 aa  43.9  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.155862  normal  0.0832434 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0294  hypothetical protein  25.19 
 
 		 375 aa  43.1  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2993  hypothetical protein  18.55 
 
 		 368 aa  42.7  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>