70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4519 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4519  domain of unknown function DUF1745  100 
 
 		 387 aa  773    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317884  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3668  hypothetical protein  88.98 
 
 		 385 aa  629  1e-179  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432885  hitchhiker  0.00253652 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3617  hypothetical protein  68.44 
 
 		 378 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0308687  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4193  domain of unknown function DUF1745  69.11 
 
 		 386 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351241  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2940  hypothetical protein  69.35 
 
 		 402 aa  488  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00513133 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2201  domain of unknown function DUF1745  61.98 
 
 		 398 aa  462  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1925  hypothetical protein  61.98 
 
 		 398 aa  464  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.795435 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1816  protein of unknown function DUF1745  61.34 
 
 		 389 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.988519 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3518  hypothetical protein  62.83 
 
 		 400 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.49503  normal  0.689004 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0700  hypothetical protein  41.02 
 
 		 380 aa  256  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.155862  normal  0.0832434 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6102  domain of unknown function DUF1745  37.74 
 
 		 386 aa  251  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2538  hypothetical protein  36.97 
 
 		 382 aa  247  3e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0732  hypothetical protein  40.32 
 
 		 386 aa  247  3e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2313  GfdT protein  39.89 
 
 		 392 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1924  hypothetical protein  39.89 
 
 		 392 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1717  hypothetical protein  39.89 
 
 		 392 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0600  hypothetical protein  39.89 
 
 		 392 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1661  hypothetical protein  39.89 
 
 		 384 aa  244  3e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2230  hypothetical protein  39.62 
 
 		 392 aa  242  6e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0710  hypothetical protein  39.62 
 
 		 384 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.251408  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2663  hypothetical protein  39.36 
 
 		 387 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1939  hypothetical protein  39.95 
 
 		 384 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2171  hypothetical protein  39.1 
 
 		 387 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3320  hypothetical protein  41.27 
 
 		 387 aa  239  5e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2247  hypothetical protein  35.43 
 
 		 382 aa  238  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00169518  normal  0.316904 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3140  hypothetical protein  39.08 
 
 		 387 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38990  hypothetical protein  42.86 
 
 		 387 aa  236  6e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.880326  normal  0.566256 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1872  hypothetical protein  35.52 
 
 		 381 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2675  hypothetical protein  38.48 
 
 		 399 aa  231  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0296571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1139  hypothetical protein  39.06 
 
 		 392 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1883  hypothetical protein  34.15 
 
 		 382 aa  229  4e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1527  hypothetical protein  39.88 
 
 		 390 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.039182 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2881  hypothetical protein  39.65 
 
 		 390 aa  224  3e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2592  hypothetical protein  37.99 
 
 		 386 aa  224  3e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71341  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1250  hypothetical protein  37.99 
 
 		 386 aa  224  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.7579 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2724  domain of unknown function DUF1745  35.73 
 
 		 374 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.43445  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2339  domain of unknown function DUF1745  35.26 
 
 		 383 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1931  hypothetical protein  38.34 
 
 		 385 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.429127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3953  hypothetical protein  34.44 
 
 		 389 aa  205  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2479  hypothetical protein  35.07 
 
 		 379 aa  203  4e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.492023 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2353  hypothetical protein  36.87 
 
 		 393 aa  200  3.9999999999999996e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.18015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0466  domain of unknown function DUF1745  31.83 
 
 		 385 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4045  hypothetical protein  32.49 
 
 		 378 aa  179  7e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2474  hypothetical protein  29.87 
 
 		 447 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3141  hypothetical protein  30.08 
 
 		 460 aa  162  9e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3551  hypothetical protein  31 
 
 		 371 aa  160  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2993  hypothetical protein  29.68 
 
 		 368 aa  144  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3344  hypothetical protein  29.74 
 
 		 464 aa  130  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5004  chemotaxis sensory transducer  28.27 
 
 		 672 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.71371 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2083  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.35 
 
 		 647 aa  87  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0223967  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2590  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.51 
 
 		 675 aa  81.3  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182127  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0690  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 		 1186 aa  79  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1269  hypothetical protein  29.09 
 
 		 387 aa  75.1  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0982  domain of unknown function DUF1745  25.69 
 
 		 666 aa  74.3  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.505903  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2918  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.67 
 
 		 669 aa  73.2  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1909  domain of unknown function DUF1745  27.95 
 
 		 408 aa  70.5  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1866  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.09 
 
 		 650 aa  68.9  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2665  domain of unknown function DUF1745  30.43 
 
 		 427 aa  65.5  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.955158 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003465  hypothetical protein  22.9 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1241  hypothetical protein  25.33 
 
 		 381 aa  59.3  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1054  hypothetical protein  20.9 
 
 		 405 aa  50.8  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0911  hypothetical protein  24.65 
 
 		 400 aa  49.7  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.36206  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02305  hypothetical protein  20.39 
 
 		 395 aa  47.8  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1561  hypothetical protein  21.49 
 
 		 394 aa  47  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0408772  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3322  domain of unknown function DUF1745  26.73 
 
 		 373 aa  46.6  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2153  hypothetical protein  24.09 
 
 		 400 aa  46.6  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1202  fused sensor protein/response regulator  20.97 
 
 		 934 aa  45.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127641  normal  0.087847 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1520  domain of unknown function DUF1745  24.44 
 
 		 1101 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.593307 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2079  domain of unknown function DUF1745  24.41 
 
 		 417 aa  43.5  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00286991  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0354  hypothetical protein  23.95 
 
 		 387 aa  43.1  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>