More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0289 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0289  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 
137 aa  266  5e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0267  biopolymer transport protein ExbD/TolR  75.18 
 
 
139 aa  192  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.927385  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0278  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  74.45 
 
 
139 aa  191  3e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.618045  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0289  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  74.45 
 
 
139 aa  191  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.231798  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0391  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.22 
 
 
159 aa  94.7  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1216  biopolymer transport TolR  35.25 
 
 
150 aa  88.2  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  41.94 
 
 
147 aa  87.8  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1699  ExbD/TolR family TonB system transport protein  35.59 
 
 
150 aa  87  8e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  41.38 
 
 
139 aa  87  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1641  protein TolR  35.59 
 
 
150 aa  87  8e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4429  protein TolR  37.29 
 
 
173 aa  85.9  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.681247 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  39.83 
 
 
139 aa  84.3  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.59 
 
 
149 aa  84.3  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0856  protein TolR  43.09 
 
 
157 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0586  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.86 
 
 
136 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1227  tolR protein  35.38 
 
 
146 aa  82  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1396  protein TolR  43.09 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6027  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.41 
 
 
160 aa  81.3  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3136  protein TolR  41.53 
 
 
146 aa  80.9  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0696  protein TolR  36.03 
 
 
150 aa  80.5  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0661  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.03 
 
 
150 aa  80.5  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602006  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0695  protein TolR  36.03 
 
 
150 aa  80.5  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  38.98 
 
 
139 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1015  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.18 
 
 
150 aa  79.3  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0527  protein TolR  39.68 
 
 
155 aa  78.6  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4434  protein TolR  37.29 
 
 
147 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620039  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1744  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.88 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2540  protein TolR  35.88 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000662541  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1525  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.68 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0168753  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1740  biopolymer transport TolR  35.88 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000388711  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0330  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.7 
 
 
173 aa  77.8  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175992  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2533  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 
144 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432796  normal  0.100758 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  40.16 
 
 
167 aa  77.8  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2370  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 
144 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000201992  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3619  protein TolR  31.75 
 
 
152 aa  77.8  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2977  TolR protein  38.33 
 
 
144 aa  77.4  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1460  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.85 
 
 
142 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00381179  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2629  biopolymer transport TolR  31.75 
 
 
149 aa  77  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3203  protein TolR  30.23 
 
 
151 aa  77  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.349327  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3498  protein TolR  30.23 
 
 
151 aa  77  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1109  biopolymer transport TolR  36.97 
 
 
134 aa  76.3  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00176605  normal  0.311844 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1783  protein TolR  35.11 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000043737  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.66 
 
 
155 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.8914  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.07 
 
 
149 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1392  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.58 
 
 
142 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000255119  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1851  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.58 
 
 
145 aa  76.6  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2418  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.95 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0011  biopolymer transport ExbD1 protein  31.5 
 
 
139 aa  75.9  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1587  protein TolR  36.36 
 
 
138 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.437138  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0506  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.07 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529067  hitchhiker  0.000695312 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0470  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.14 
 
 
141 aa  75.9  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.923665 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3389  protein TolR  36.44 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436196  normal  0.250194 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3058  biopolymer transport TolR  32.79 
 
 
152 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0312035  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0010  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.07 
 
 
141 aa  75.1  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041719 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.59 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000781876  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03474  biopolymer transport ExbD1 protein  31.75 
 
 
129 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2733  protein TolR  33.87 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0139663  hitchhiker  0.0000179602 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2237  biopolymer ExbD/TolR family transporter  36.36 
 
 
134 aa  74.7  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271991  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0840  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.02 
 
 
137 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0352738 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.14 
 
 
139 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2120  biopolymer transport TolR  31.88 
 
 
152 aa  74.7  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0523748  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1855  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.82 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126112  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.97 
 
 
147 aa  74.3  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5304  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.59 
 
 
149 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.159444  normal  0.423662 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0705  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.07 
 
 
152 aa  73.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105618  normal  0.350278 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0560  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.14 
 
 
156 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0612  ExbD/TolR family protein  35.9 
 
 
143 aa  73.6  0.0000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4762  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.75 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.718124  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2088  tolR protein  31.58 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00030908  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5229  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.75 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.334933  normal  0.0672636 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2231  TolR protein  34.35 
 
 
148 aa  72.8  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0244  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.96 
 
 
149 aa  72.4  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0745  protein TolR  35.29 
 
 
140 aa  72  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000786072  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  39.02 
 
 
153 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2341  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.74 
 
 
128 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0374372  normal  0.103616 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1442  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 
140 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0746  protein TolR  35.59 
 
 
148 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2324  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.75 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0663066  normal  0.292388 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2719  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.74 
 
 
151 aa  71.2  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.746273  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0671  ExbD/TolR family protein  34.75 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045773  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  38.21 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  38.21 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0534  protein TolR  31.58 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156343  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0150  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 
149 aa  70.9  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000194485  hitchhiker  0.00605756 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2566  biopolymer transport TolR  33.33 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000208666  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2363  protein TolR  37.27 
 
 
139 aa  70.9  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372464 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1440  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.79 
 
 
136 aa  70.5  0.000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3313  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.96 
 
 
135 aa  70.5  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.93238  normal  0.758523 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2408  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.79 
 
 
136 aa  70.5  0.000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.692692  normal  0.803966 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0861  protein TolR  38.79 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000417761  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1908  ExbD/TolR family protein  37.07 
 
 
141 aa  70.1  0.000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0748  protein TolR  32.81 
 
 
155 aa  70.1  0.000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.031429  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0784  protein TolR  34.07 
 
 
138 aa  69.7  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0363173  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0684  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.24 
 
 
154 aa  70.1  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.508331  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.04 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3630  biopolymer ExbD/TolR family transporter  34.09 
 
 
146 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2998  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.58 
 
 
140 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0383  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.83 
 
 
141 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0787741 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0358  biopolymer ExbD/TolR family transporter  37.5 
 
 
135 aa  68.9  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0309097 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1762  protein TolR  33.59 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>