More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6027 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6027  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 160 aa  318  1.9999999999999998e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0705  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.85 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105618  normal  0.350278 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0612  ExbD/TolR family protein  37.5 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1227  tolR protein  33.96 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2215  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.59 
 
 		 154 aa  77  0.00000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0861  protein TolR  39.52 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000417761  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0267  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.43 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.927385  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0289  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.71 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.231798  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0391  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.5 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0278  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.71 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.618045  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2163  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.72 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0401461  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.77 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0748  protein TolR  36.72 
 
 		 155 aa  74.3  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.031429  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  34.15 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1851  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.97 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  34.68 
 
 		 139 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.76 
 
 		 147 aa  73.6  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0244  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.76 
 
 		 149 aa  73.6  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  33.33 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0695  protein TolR  31.82 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0696  protein TolR  31.82 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1908  ExbD/TolR family protein  35.43 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0745  protein TolR  35.94 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000786072  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2120  biopolymer transport TolR  31.79 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0523748  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0661  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.82 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602006  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1525  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.21 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0168753  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0671  ExbD/TolR family protein  34.11 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045773  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2324  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.11 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0663066  normal  0.292388 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1015  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.88 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0840  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.21 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0352738 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3203  protein TolR  33.09 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.349327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2192  biopolymer transport TolR  36.72 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0164726  normal  0.458286 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3498  protein TolR  33.09 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1587  protein TolR  34.81 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.437138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0856  protein TolR  39.85 
 
 		 157 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4538  TolR protein  35.81 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1396  protein TolR  37.4 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51740  TolR protein  35.81 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101841  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0857  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.16 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.345374  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3142  biopolymer transport transmembrane protein, ExbD/TolR like  36.64 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421775  normal  0.0460891 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0150  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.14 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000194485  hitchhiker  0.00605756 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2418  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.14 
 
 		 144 aa  70.5  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2462  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.11 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0870388  normal  0.859311 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2977  TolR protein  34.85 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2733  protein TolR  33.33 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0139663  hitchhiker  0.0000179602 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1460  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.59 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00381179  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0443  biopolymer ExbD/TolR family transporter  34.33 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.102103  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0670  biopolymer ExbD/TolR family transporter  34.33 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.198674  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.62 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2212  biopolymer transport TolR  30.34 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000948089  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4404  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0822226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  37.01 
 
 		 167 aa  67.4  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1220  biopolymer transport protein TolR  33.77 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.336788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4429  protein TolR  34.11 
 
 		 173 aa  67.4  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.681247 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1109  biopolymer transport TolR  37.21 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00176605  normal  0.311844 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1249  biopolymer transport, TolR  33.77 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1407  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.47 
 
 		 139 aa  67  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.757544  normal  0.100791 
 
 
-
 
NC_004310  BR1699  ExbD/TolR family TonB system transport protein  35.33 
 
 		 150 aa  67  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2772  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.31 
 
 		 141 aa  67  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2088  tolR protein  33.99 
 
 		 145 aa  67  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00030908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1641  protein TolR  35.33 
 
 		 150 aa  67  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0594  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.11 
 
 		 143 aa  67  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0205  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.96 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000105504  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0506  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.04 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529067  hitchhiker  0.000695312 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2533  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.25 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432796  normal  0.100758 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2566  biopolymer transport TolR  34.56 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000208666  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1855  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.13 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126112  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2262  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.66 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.144392  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0560  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.56 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3166  protein TolR  36.36 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2370  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.25 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000201992  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0173  biopolymer ExbD/TolR family transporter  29.2 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.311198  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1744  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.29 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0135  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.77 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.09 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000781876  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1216  biopolymer transport TolR  33.1 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  36.36 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4198  protein TolR  34.44 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.843588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1740  biopolymer transport TolR  35.29 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000388711  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.91 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2540  protein TolR  35.29 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000662541  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3058  biopolymer transport TolR  34.35 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0312035  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.94 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.8914  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2229  inner membrane protein  34.75 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243191  normal  0.205918 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0684  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.2 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.508331  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  36.3 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2226  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.21 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.267348  hitchhiker  0.000328891 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0289  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.41 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  36.3 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0586  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.28 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3630  biopolymer ExbD/TolR family transporter  37.1 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1783  protein TolR  34.56 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000043737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.14 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2629  biopolymer transport TolR  34.27 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2750  tolr protein  32.05 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1713  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.35 
 
 		 136 aa  63.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.117298  hitchhiker  0.0021985 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1460  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.14 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0146  protein TolR  32.31 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3995  protein TolR  33.77 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>