More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0258 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0258  phosphoribosyltransferase  100 
 
 
245 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.312916  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0236  phosphoribosyltransferase  76.86 
 
 
228 aa  238  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.269652  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0258  phosphoribosyltransferase  75.55 
 
 
228 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0247  phosphoribosyltransferase  75.55 
 
 
228 aa  232  5e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0559  phosphoribosyltransferase  46.96 
 
 
248 aa  148  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230828  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  41.7 
 
 
238 aa  142  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  39.57 
 
 
242 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  43.37 
 
 
246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  40 
 
 
243 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  38.91 
 
 
245 aa  131  9e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  37.28 
 
 
238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  43.53 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  34.6 
 
 
239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3140  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  33.73 
 
 
296 aa  126  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.012105  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  41.63 
 
 
236 aa  125  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1140  phosphoribosyltransferase  39.74 
 
 
264 aa  122  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0794906  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0601  phosphoribosyltransferase  40.25 
 
 
271 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  42.54 
 
 
228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2264  phosphoribosyltransferase  36.95 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.200709  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  40.36 
 
 
243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  40.61 
 
 
272 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  39.57 
 
 
267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  39.48 
 
 
259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  37.99 
 
 
233 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  42.45 
 
 
247 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  34.63 
 
 
258 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  37.35 
 
 
270 aa  116  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  26.43 
 
 
230 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 
213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  40.54 
 
 
243 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2292  ComF family protein  35.95 
 
 
286 aa  115  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  37.93 
 
 
271 aa  115  5e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  39.26 
 
 
253 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  36.46 
 
 
279 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  46.52 
 
 
227 aa  115  7.999999999999999e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  38.21 
 
 
249 aa  113  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2108  phosphoribosyltransferase  38.3 
 
 
269 aa  113  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.227962  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  35.17 
 
 
258 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2856  competence protein F  41.45 
 
 
240 aa  113  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0520  phosphoribosyltransferase  41.48 
 
 
269 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4841  competence protein ComF  37.95 
 
 
245 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399762  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  39.75 
 
 
255 aa  112  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  40.54 
 
 
239 aa  112  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  40.08 
 
 
262 aa  112  5e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0976  hypothetical protein  33.48 
 
 
229 aa  112  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0430992  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  32.44 
 
 
229 aa  112  6e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2971  phosphoribosyltransferase  38.13 
 
 
268 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566762 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1195  competence protein F  40.17 
 
 
240 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  36.05 
 
 
233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  28.63 
 
 
230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  40.77 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  34.76 
 
 
233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  36.13 
 
 
247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4633  gluconate periplasmic binding protein  36 
 
 
227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0351  competence protein F  36.73 
 
 
255 aa  110  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  38.84 
 
 
239 aa  109  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  36.06 
 
 
237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  30.33 
 
 
245 aa  109  5e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  38.33 
 
 
263 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2633  amidophosphoribosyltransferase-like protein  38.89 
 
 
240 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  41.07 
 
 
223 aa  108  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2902  competence protein F, putative  39 
 
 
243 aa  108  8.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  38.33 
 
 
237 aa  108  9.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  36.33 
 
 
255 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16480  amidophosphoribosyltransferase  29.29 
 
 
243 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.58809e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0592  putative phosphoribosyl transferase  39.38 
 
 
241 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  32.53 
 
 
247 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0295  competence protein F, putative  38.03 
 
 
242 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  29.51 
 
 
245 aa  106  3e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3540  ComF family protein  39.91 
 
 
242 aa  106  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  37.9 
 
 
255 aa  106  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  36.49 
 
 
244 aa  105  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3184  putative phosphoribosyl transferase  38.22 
 
 
230 aa  106  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.392419 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2863  phosphoribosyltransferase  40.18 
 
 
242 aa  105  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1678  ComF family protein  33.93 
 
 
230 aa  105  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.591029  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0911  hypothetical protein  31.03 
 
 
255 aa  105  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.466894  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0129  competence protein F  37.83 
 
 
237 aa  105  7e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  29.69 
 
 
232 aa  105  7e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3925  gluconate periplasmic binding protein  36.53 
 
 
233 aa  105  8e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  33.61 
 
 
233 aa  105  8e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  37.39 
 
 
243 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  35.75 
 
 
246 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  42.11 
 
 
217 aa  104  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4395  ComF family protein  37.96 
 
 
238 aa  104  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136408  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  35.41 
 
 
244 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  31.03 
 
 
220 aa  103  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  28.32 
 
 
220 aa  103  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1242  hypothetical protein  34.6 
 
 
271 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06360  putative phosphoribosyl transferase  38.16 
 
 
241 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  0.955973 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  31.58 
 
 
227 aa  103  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0875  hypothetical protein  34.48 
 
 
255 aa  103  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.656742  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4118  gluconate periplasmic binding protein  34.55 
 
 
233 aa  102  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  36.04 
 
 
246 aa  102  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  31.65 
 
 
234 aa  101  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2183  phosphoribosyltransferase  33.92 
 
 
230 aa  101  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000715358  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0423  ComF family protein  40 
 
 
255 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3415  ComF family protein  37.67 
 
 
241 aa  100  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  34.78 
 
 
262 aa  99.8  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  42.03 
 
 
215 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0225  phosphoribosyltransferase  39.56 
 
 
222 aa  99.8  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000513263  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>