More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1610 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1610  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
422 aa  848    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.297282  normal  0.614685 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7012  NADH dehydrogenase (quinone)  37.22 
 
 
345 aa  268  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0479  NADH dehydrogenase (quinone)  39.28 
 
 
414 aa  267  2.9999999999999995e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.215089 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1239  NADH dehydrogenase (quinone)  37.76 
 
 
350 aa  267  2.9999999999999995e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  38.73 
 
 
341 aa  262  1e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4081  NADH dehydrogenase (quinone)  36.41 
 
 
359 aa  260  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  36.58 
 
 
364 aa  259  8e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  38.73 
 
 
329 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5105  NADH dehydrogenase (quinone)  36.92 
 
 
384 aa  253  6e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1375  NADH dehydrogenase I chain H  35.32 
 
 
342 aa  248  1e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00938294  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  36.96 
 
 
451 aa  248  1e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  36.23 
 
 
349 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  36.23 
 
 
349 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0161  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  39.6 
 
 
329 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  43.08 
 
 
348 aa  243  6e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.4 
 
 
337 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0325  NADH dehydrogenase (quinone)  38.73 
 
 
329 aa  239  9e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0635  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  35.48 
 
 
389 aa  239  9e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1630  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  35.48 
 
 
389 aa  239  9e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3186  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  35.48 
 
 
389 aa  239  9e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3175  NADH dehydrogenase (quinone)  35.48 
 
 
430 aa  237  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.616165  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  37.06 
 
 
330 aa  237  3e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  34.99 
 
 
349 aa  237  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0916  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  38.75 
 
 
389 aa  236  4e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0945521  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.83 
 
 
337 aa  236  6e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2236  NADH dehydrogenase (quinone)  36.03 
 
 
391 aa  236  7e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.249199  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0422  NADH dehydrogenase subunit H  35.91 
 
 
369 aa  235  9e-61  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00267889  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0617  NADH dehydrogenase subunit H  36.54 
 
 
367 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00942155  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6675  NADH dehydrogenase subunit H  36.95 
 
 
447 aa  234  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4075  NADH dehydrogenase (quinone)  35.24 
 
 
345 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.329571  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0174  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  37.47 
 
 
330 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.76533  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3088  NADH dehydrogenase (quinone)  36.25 
 
 
357 aa  233  6e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93742  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3388  NADH dehydrogenase (quinone)  35.14 
 
 
390 aa  232  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0156  NADH dehydrogenase (quinone)  36.96 
 
 
330 aa  232  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.615758 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1156  NADH dehydrogenase (quinone)  36.29 
 
 
348 aa  231  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0159  NADH dehydrogenase subunit H  41.59 
 
 
341 aa  230  3e-59  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1941  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  35.95 
 
 
331 aa  230  3e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7684  NADH dehydrogenase (quinone)  35.9 
 
 
472 aa  229  5e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4411  NADH dehydrogenase (quinone)  36.04 
 
 
438 aa  229  6e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6087  NADH dehydrogenase subunit H  36.52 
 
 
462 aa  228  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0085721  normal  0.0109132 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0395  NADH dehydrogenase (quinone)  36.2 
 
 
433 aa  228  1e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0591  NADH dehydrogenase (quinone)  34.91 
 
 
448 aa  227  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748809  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  35.57 
 
 
344 aa  227  3e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1042  NADH dehydrogenase (quinone)  36 
 
 
407 aa  227  4e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  33.97 
 
 
343 aa  227  4e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2050  NADH dehydrogenase (quinone)  36.68 
 
 
341 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1957  NADH dehydrogenase (quinone)  33.99 
 
 
352 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.206938  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1749  NADH dehydrogenase (quinone)  37.31 
 
 
349 aa  226  6e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.658277  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1878  NADH dehydrogenase subunit H  35.44 
 
 
411 aa  226  7e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.349775  normal  0.979867 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1308  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  36.7 
 
 
354 aa  226  7e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0370  NADH dehydrogenase (quinone)  35.14 
 
 
420 aa  225  1e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.455618  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3864  NADH dehydrogenase (quinone)  34.34 
 
 
390 aa  225  1e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1281  NADH dehydrogenase (quinone)  37.53 
 
 
447 aa  224  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.522555 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1597  NADH dehydrogenase subunit H  34.44 
 
 
416 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824688  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1573  NADH dehydrogenase subunit H  34.44 
 
 
416 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1543  NADH dehydrogenase subunit H  34.44 
 
 
416 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671965  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2055  NADH dehydrogenase subunit H  36.17 
 
 
354 aa  224  3e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.845348  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1884  NADH dehydrogenase subunit H  36.01 
 
 
354 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  36.86 
 
 
322 aa  223  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2207  NADH dehydrogenase subunit H  35.77 
 
 
354 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0163  NAD(P)H-quinone oxidoreductase chain 1 (NAD(P)hdehydrogenase I, chain 1)  32.44 
 
 
425 aa  222  8e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0956  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  38.72 
 
 
349 aa  222  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0350312  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03230  NADH dehydrogenase subunit H  35.54 
 
 
441 aa  222  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332103  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4456  NADH dehydrogenase subunit H  37.43 
 
 
448 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.498468  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0527  NADH dehydrogenase subunit H  40.65 
 
 
449 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2250  NADH dehydrogenase (quinone)  35.19 
 
 
341 aa  220  3e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6256  hitchhiker  0.0000133524 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2623  NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  35.19 
 
 
341 aa  220  3e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.434757  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4551  NADH dehydrogenase (quinone)  35.18 
 
 
486 aa  219  7e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0968  NADH dehydrogenase subunit H  35.11 
 
 
354 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000216716  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4488  NADH dehydrogenase subunit H  34.71 
 
 
410 aa  218  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0439887 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1500  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  34.14 
 
 
360 aa  218  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.407622  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1035  NADH dehydrogenase subunit H  36.13 
 
 
355 aa  216  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.262933  normal  0.291469 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1350  NADH dehydrogenase subunit H  36.58 
 
 
354 aa  216  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0612742  hitchhiker  0.00613103 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13173  NADH dehydrogenase subunit H  34.27 
 
 
413 aa  216  5e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1302  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  39.34 
 
 
347 aa  216  5e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0656687  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1098  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  34.09 
 
 
366 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4058  NADH dehydrogenase subunit H  37.44 
 
 
447 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3207  NADH dehydrogenase subunit H  35.16 
 
 
354 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.010712  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3609  NADH dehydrogenase subunit H  33.42 
 
 
335 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.339444  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1508  NADH dehydrogenase (quinone)  34.23 
 
 
352 aa  215  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00230102 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1068  NADH dehydrogenase subunit H  35.66 
 
 
354 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393482  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0545  NADH dehydrogenase subunit H  36.17 
 
 
449 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.629045  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3614  NADH dehydrogenase (quinone)  38.56 
 
 
328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5570  NADH dehydrogenase subunit H  35.86 
 
 
355 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.171146 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0934  NADH dehydrogenase subunit H  34.05 
 
 
354 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.284795  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0420  NADH dehydrogenase subunit H  35.4 
 
 
352 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1822  NADH dehydrogenase subunit H  35.4 
 
 
354 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2698  NADH-quinone oxidoreductase chain H  34.4 
 
 
340 aa  213  3.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1137  NADH dehydrogenase subunit H  35.4 
 
 
352 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.21954  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2159  NADH dehydrogenase subunit H  35.34 
 
 
355 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367995  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1297  NADH dehydrogenase subunit H  35.4 
 
 
354 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0730  NADH dehydrogenase subunit H  35.4 
 
 
352 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1306  NADH dehydrogenase subunit H  35.4 
 
 
354 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310295  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3335  NADH dehydrogenase (quinone)  41.88 
 
 
341 aa  213  3.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214759  normal  0.324573 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2280  NADH dehydrogenase subunit H  35.34 
 
 
355 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421689  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1442  NADH dehydrogenase subunit H  35.4 
 
 
333 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.583863  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3249  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  38.3 
 
 
359 aa  212  7.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.820751  normal  0.99493 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0553  NADH-quinone oxidoreductase chain H  36.7 
 
 
340 aa  212  9e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1610  NADH dehydrogenase (ubiquinone), H subunit  36.7 
 
 
340 aa  212  9e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1431  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  35.5 
 
 
347 aa  212  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>