More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3186 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0635  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  100 
 
 		 389 aa  784    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1630  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  100 
 
 		 389 aa  784    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3186  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  100 
 
 		 389 aa  784    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4516  NADH dehydrogenase (quinone)  46.15 
 
 		 373 aa  312  6.999999999999999e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.566795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5105  NADH dehydrogenase (quinone)  38.15 
 
 		 384 aa  257  3e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4081  NADH dehydrogenase (quinone)  38.23 
 
 		 359 aa  255  9e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1239  NADH dehydrogenase (quinone)  37.25 
 
 		 350 aa  253  4.0000000000000004e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1375  NADH dehydrogenase I chain H  39.13 
 
 		 342 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00938294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1295  NADH dehydrogenase (quinone)  41.89 
 
 		 450 aa  252  6e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2565  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  41.21 
 
 		 460 aa  252  9.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1283  NADH dehydrogenase (quinone)  41.21 
 
 		 460 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1384  NADH dehydrogenase (quinone)  40.93 
 
 		 460 aa  249  4e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7012  NADH dehydrogenase (quinone)  36.84 
 
 		 345 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  38.33 
 
 		 341 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0370  NADH dehydrogenase (quinone)  39.5 
 
 		 420 aa  243  5e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.455618  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4075  NADH dehydrogenase (quinone)  36.84 
 
 		 345 aa  235  9e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.329571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1610  NADH dehydrogenase (quinone)  35.48 
 
 		 422 aa  232  7.000000000000001e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.297282  normal  0.614685 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  38.74 
 
 		 329 aa  232  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  38.94 
 
 		 337 aa  231  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0156  NADH dehydrogenase (quinone)  40.05 
 
 		 330 aa  231  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.615758 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3388  NADH dehydrogenase (quinone)  35.75 
 
 		 390 aa  229  7e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  39.15 
 
 		 349 aa  229  8e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0712  NADH dehydrogenase (quinone)  39.24 
 
 		 318 aa  228  1e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.272404  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  38.94 
 
 		 348 aa  228  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0174  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  39.25 
 
 		 330 aa  228  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.76533  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0325  NADH dehydrogenase (quinone)  38.46 
 
 		 329 aa  227  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0161  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  38.26 
 
 		 329 aa  227  3e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2236  NADH dehydrogenase (quinone)  36.03 
 
 		 391 aa  225  8e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.249199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  38.44 
 
 		 349 aa  225  9e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_002936  DET0927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  37.57 
 
 		 353 aa  225  1e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_798  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)  37.57 
 
 		 353 aa  225  1e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  37.57 
 
 		 364 aa  224  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  36.64 
 
 		 451 aa  225  1e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1308  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  39.68 
 
 		 354 aa  224  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  38.1 
 
 		 353 aa  223  4e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  37.71 
 
 		 349 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3088  NADH dehydrogenase (quinone)  35.28 
 
 		 357 aa  222  8e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93742  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  36.01 
 
 		 330 aa  220  3e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0527  NADH dehydrogenase subunit H  36.74 
 
 		 449 aa  220  3e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1626  NADH dehydrogenase (quinone)  35.94 
 
 		 440 aa  219  5e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0675277 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4551  NADH dehydrogenase (quinone)  36.91 
 
 		 486 aa  218  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6675  NADH dehydrogenase subunit H  36.9 
 
 		 447 aa  217  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1042  NADH dehydrogenase (quinone)  37.69 
 
 		 407 aa  218  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0402  NADH dehydrogenase  36.57 
 
 		 372 aa  217  4e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6087  NADH dehydrogenase subunit H  37.9 
 
 		 462 aa  216  5e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0085721  normal  0.0109132 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5094  NADH dehydrogenase subunit H  39.27 
 
 		 333 aa  216  5e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3614  NADH dehydrogenase (quinone)  34.73 
 
 		 328 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5421  NADH dehydrogenase subunit H  38.98 
 
 		 333 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5146  NADH dehydrogenase subunit H  38.98 
 
 		 333 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4978  NADH dehydrogenase subunit H  38.98 
 
 		 333 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4996  NADH dehydrogenase subunit H  38.98 
 
 		 333 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5538  NADH dehydrogenase subunit H  38.98 
 
 		 333 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5472  NADH dehydrogenase subunit H  38.98 
 
 		 333 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5387  NADH dehydrogenase subunit H  38.98 
 
 		 333 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14052e-18 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5533  NADH dehydrogenase subunit H  38.98 
 
 		 333 aa  216  7e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5417  NADH dehydrogenase subunit H  38.98 
 
 		 333 aa  216  7e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1941  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  37.15 
 
 		 331 aa  215  8e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3815  NADH dehydrogenase subunit H  37.57 
 
 		 333 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2714  NADH dehydrogenase subunit H  35.39 
 
 		 372 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.834243  normal  0.483082 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3864  NADH dehydrogenase (quinone)  33.6 
 
 		 390 aa  213  4.9999999999999996e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1343  NADH dehydrogenase subunit H  35.66 
 
 		 372 aa  213  5.999999999999999e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1019  NADH dehydrogenase subunit H  35.97 
 
 		 317 aa  213  5.999999999999999e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0916  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  36.31 
 
 		 389 aa  213  5.999999999999999e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0945521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0163  NAD(P)H-quinone oxidoreductase chain 1 (NAD(P)hdehydrogenase I, chain 1)  40.85 
 
 		 425 aa  212  7e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3222  NADH dehydrogenase subunit H  37.78 
 
 		 441 aa  212  7.999999999999999e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3175  NADH dehydrogenase (quinone)  36.01 
 
 		 430 aa  212  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.616165  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26911  NADH dehydrogenase subunit H  35.58 
 
 		 384 aa  211  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1015  NADH dehydrogenase subunit H  35.58 
 
 		 322 aa  211  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0545  NADH dehydrogenase subunit H  37.01 
 
 		 449 aa  210  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.629045  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0395  NADH dehydrogenase (quinone)  36.06 
 
 		 433 aa  211  3e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1276  NADH dehydrogenase (quinone)  36.46 
 
 		 415 aa  210  4e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.815883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7684  NADH dehydrogenase (quinone)  35 
 
 		 472 aa  210  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1666  NADH dehydrogenase subunit H  34.84 
 
 		 372 aa  209  7e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0422  NADH dehydrogenase subunit H  35.81 
 
 		 369 aa  209  7e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00267889  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02331  NADH dehydrogenase subunit H  36.84 
 
 		 372 aa  208  1e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.896857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1527  NADH dehydrogenase subunit H  36.26 
 
 		 372 aa  208  2e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.732572  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2866  NADH dehydrogenase (quinone)  37.06 
 
 		 317 aa  207  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.473976  normal  0.0334094 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01771  NADH dehydrogenase subunit H  36.84 
 
 		 384 aa  206  4e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0970603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3297  NADH dehydrogenase subunit H  34.66 
 
 		 333 aa  206  5e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0288  NADH dehydrogenase  36.34 
 
 		 452 aa  206  5e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.957088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1281  NADH dehydrogenase (quinone)  36.17 
 
 		 447 aa  206  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.522555 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0479  NADH dehydrogenase (quinone)  36.05 
 
 		 414 aa  206  6e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215089 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3609  NADH dehydrogenase subunit H  36.71 
 
 		 335 aa  206  7e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.339444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0617  NADH dehydrogenase subunit H  35.92 
 
 		 367 aa  206  8e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00942155  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4411  NADH dehydrogenase (quinone)  35.39 
 
 		 438 aa  206  8e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3371  NADH dehydrogenase I, H subunit  36.39 
 
 		 335 aa  205  9e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.606059  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3203  NADH dehydrogenase subunit H  36.11 
 
 		 335 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0243703  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0162  NADH dehydrogenase subunit H  35.1 
 
 		 372 aa  205  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1285  NADH dehydrogenase (quinone)  36.12 
 
 		 455 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.853788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4488  NADH dehydrogenase subunit H  35.69 
 
 		 410 aa  205  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0439887 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01891  NADH dehydrogenase subunit H  35.47 
 
 		 372 aa  205  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2050  NADH dehydrogenase (quinone)  33.86 
 
 		 341 aa  204  2e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01801  NADH dehydrogenase subunit H  36.39 
 
 		 372 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.624846  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0203  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  33.89 
 
 		 329 aa  204  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.746542  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0981  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  32.88 
 
 		 348 aa  204  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1114  NADH dehydrogenase subunit H  36.76 
 
 		 323 aa  204  3e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.787039  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2668  NADH dehydrogenase subunit H  35.77 
 
 		 325 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2506  NADH dehydrogenase subunit H  35.77 
 
 		 325 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01781  NADH dehydrogenase subunit H  35.1 
 
 		 372 aa  203  4e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.236332  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2561  NADH dehydrogenase subunit H  35.77 
 
 		 325 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.12488  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>