More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4611 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4611  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
283 aa  551  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0202  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.05 
 
 
284 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0558  ABC transporter, permease protein  34.5 
 
 
293 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0542  transmembrane transport protein  34.11 
 
 
293 aa  162  8.000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.16 
 
 
303 aa  159  7e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.31 
 
 
271 aa  158  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.7 
 
 
294 aa  157  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0399924  normal  0.454019 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1945  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.32 
 
 
271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.232263  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.98 
 
 
285 aa  153  4e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.587185  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23830  ABC-type sugar transport system, permease component  33.58 
 
 
303 aa  149  6e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.31 
 
 
281 aa  148  8e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.94 
 
 
298 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.370604  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6935  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.5 
 
 
300 aa  142  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111402  normal  0.938789 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2694  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.68 
 
 
279 aa  142  7e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2049  sugar ABC transporter (permease)  32.22 
 
 
303 aa  142  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.907779  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7705  sugar ABC transporter (permease)  32.14 
 
 
301 aa  142  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3677  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.69 
 
 
304 aa  140  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.842824 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1707  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.33 
 
 
303 aa  140  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1617  putative binding-protein-dependent transport protein  34.83 
 
 
304 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.201797  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2192  putative sugar ABC transporter, permease protein  32.62 
 
 
283 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
281 aa  138  7.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0887  sugar ABC transporter, permease protein  35.41 
 
 
280 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.453961  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2253  sugar ABC transporter (permease)  30.57 
 
 
281 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.273878 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3155  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.84 
 
 
279 aa  137  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.358123  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0067  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  32.64 
 
 
295 aa  137  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2714  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.18 
 
 
288 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01530  carbohydrate ABC transporter membrane protein  30.77 
 
 
276 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0760  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.25 
 
 
280 aa  136  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0312496  normal  0.789995 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0061  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
297 aa  135  5e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.47 
 
 
293 aa  135  7.000000000000001e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0624061  hitchhiker  0.00160002 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
292 aa  135  8e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5530  sugar ABC transporter (permease)  33.33 
 
 
292 aa  135  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.30156 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.56 
 
 
275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275064  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3244  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.59 
 
 
294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.377096 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11560  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.68 
 
 
301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.626059  hitchhiker  0.00742077 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5493  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
276 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.173525 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2104  permease protein  33.1 
 
 
329 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.377288  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.82 
 
 
294 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.829969 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.59 
 
 
278 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1531  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.92 
 
 
275 aa  132  6e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.08 
 
 
279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1115  sugar ABC transporter, permease protein  32.06 
 
 
285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0469179  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2470  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.5 
 
 
279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.86 
 
 
281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0384109 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.46 
 
 
284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.771633  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0023  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.64 
 
 
277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.275556  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0974  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.95 
 
 
296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0288746 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2708  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.37 
 
 
279 aa  129  6e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169914  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2406  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
276 aa  129  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000118681  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2717  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.68 
 
 
276 aa  129  7.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal  0.190746 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3943  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  31.25 
 
 
281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0114669  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.65 
 
 
279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0981879  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2857  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.45 
 
 
298 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.705306  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0306  sugar ABC transporter, permease protein  32.3 
 
 
275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.147324  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.86 
 
 
287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.44 
 
 
298 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0294  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  28.79 
 
 
278 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8234  maltose transport protein  33.33 
 
 
271 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367769  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.06 
 
 
276 aa  125  6e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.194012 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02950  carbohydrate ABC transporter membrane protein  29.39 
 
 
297 aa  125  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4549  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.71 
 
 
280 aa  125  6e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.71 
 
 
281 aa  125  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.87 
 
 
273 aa  125  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1939  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.68 
 
 
314 aa  125  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0503026  normal  0.979613 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3249  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
276 aa  125  8.000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0127547  normal  0.0523369 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.62 
 
 
279 aa  124  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21170  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.25 
 
 
302 aa  125  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.281989  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0260  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.43 
 
 
280 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3073  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.72 
 
 
315 aa  124  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.79 
 
 
305 aa  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29030  carbohydrate ABC transporter membrane protein  29.23 
 
 
275 aa  124  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.42 
 
 
279 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0154166  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2528  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.48 
 
 
312 aa  125  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.98 
 
 
288 aa  124  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.66 
 
 
279 aa  124  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.52 
 
 
275 aa  125  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.667129  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3528  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.27 
 
 
277 aa  124  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0186  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.15 
 
 
304 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4440  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.96 
 
 
277 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.062682  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.96 
 
 
276 aa  124  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.576524 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.43 
 
 
295 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48115  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.22 
 
 
287 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.65 
 
 
279 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.239478  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0519  sugar ABC transporter, permease protein  31.18 
 
 
279 aa  123  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.633758  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1314  ABC transporter, permease protein  30.35 
 
 
273 aa  123  3e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.66 
 
 
294 aa  123  3e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0452  sugar ABC transporter, permease protein  31.18 
 
 
279 aa  124  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.1 
 
 
273 aa  123  4e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.354113  normal  0.0704722 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.69 
 
 
316 aa  122  7e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1117  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.04 
 
 
275 aa  122  7e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.26 
 
 
276 aa  122  8e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.898693  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.83 
 
 
274 aa  122  9e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1877  MalG-type ABC sugar transport system permease component  34.29 
 
 
216 aa  122  9e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
288 aa  122  9e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2655  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.38 
 
 
276 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00701283  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.49 
 
 
284 aa  121  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.95 
 
 
290 aa  121  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000548355  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.37 
 
 
274 aa  122  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.18 
 
 
279 aa  121  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.67338  normal  0.16615 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>