More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2384 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2384  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 441 aa  860    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000361861  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27480  Major Facilitator Superfamily transporter  60.29 
 
 		 428 aa  440  9.999999999999999e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  27.23 
 
 		 412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 494 aa  116  6.9999999999999995e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 441 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  27.66 
 
 		 426 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 474 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  26.34 
 
 		 418 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3596  major facilitator superfamily MFS_1  27.41 
 
 		 417 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  23.86 
 
 		 409 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  29.15 
 
 		 450 aa  112  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 447 aa  110  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  29.4 
 
 		 428 aa  108  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  23.82 
 
 		 430 aa  108  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 		 456 aa  107  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  25.12 
 
 		 474 aa  107  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4354  major facilitator superfamily MFS_1  32.01 
 
 		 431 aa  106  8e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 405 aa  106  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1327  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 		 433 aa  106  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  25.39 
 
 		 417 aa  105  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 		 442 aa  105  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 435 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 476 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 457 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  25.33 
 
 		 413 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1281  major facilitator transporter  20.74 
 
 		 413 aa  102  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.835892  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  28.4 
 
 		 441 aa  102  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  28.78 
 
 		 413 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 413 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 413 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 		 453 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  25.61 
 
 		 410 aa  100  6e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 416 aa  100  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  26.06 
 
 		 440 aa  100  7e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4414  protein of unknown function DUF894, DitE  29.47 
 
 		 557 aa  100  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0612118  normal  0.91404 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  27.45 
 
 		 440 aa  99.4  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  24.82 
 
 		 428 aa  99.4  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  28.11 
 
 		 407 aa  99.4  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  31.42 
 
 		 418 aa  99.8  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4026  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 		 416 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.557727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3284  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 403 aa  99  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  26.87 
 
 		 402 aa  98.6  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  22.61 
 
 		 424 aa  98.2  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  23.12 
 
 		 418 aa  98.2  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  27.66 
 
 		 446 aa  98.6  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2754  major facilitator superfamily MFS_1  29.19 
 
 		 453 aa  99  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0652  major facilitator transporter  27.16 
 
 		 423 aa  98.6  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0291479  normal  0.182714 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  26.95 
 
 		 452 aa  97.8  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  21.57 
 
 		 423 aa  98.2  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 425 aa  97.4  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  25.23 
 
 		 436 aa  97.8  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49890  membrame protein  30.94 
 
 		 454 aa  97.1  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  29.05 
 
 		 403 aa  97.1  6e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  27.69 
 
 		 416 aa  97.1  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3288  major facilitator superfamily protein  28.9 
 
 		 405 aa  96.7  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.234831 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  26.77 
 
 		 415 aa  96.7  7e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  28.13 
 
 		 412 aa  96.7  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  29.04 
 
 		 461 aa  96.7  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  27.58 
 
 		 404 aa  96.3  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0234  protein of unknown function DUF894, DitE  29.11 
 
 		 419 aa  96.3  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  27.58 
 
 		 446 aa  96.3  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  29.59 
 
 		 413 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05410  arabinose efflux permease family protein  30.05 
 
 		 429 aa  95.1  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0915887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  23.38 
 
 		 412 aa  95.1  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3705  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 		 411 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 450 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0163  MFS permease  27.15 
 
 		 542 aa  95.5  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 		 432 aa  95.1  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0990  major facilitator transporter  28.79 
 
 		 414 aa  94.4  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0950  hypothetical protein  28.64 
 
 		 414 aa  94  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 450 aa  94  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1702  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 		 438 aa  92.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101015  normal  0.0466104 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  26.59 
 
 		 429 aa  92.8  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  24.8 
 
 		 418 aa  92.4  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4358  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 426 aa  92  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.569485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  26.96 
 
 		 424 aa  92  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2668  protein of unknown function DUF894, DitE  28.45 
 
 		 541 aa  91.7  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  27.38 
 
 		 415 aa  91.3  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  23.4 
 
 		 421 aa  91.7  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  28.88 
 
 		 414 aa  91.3  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  25.25 
 
 		 401 aa  90.5  5e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  25.37 
 
 		 426 aa  90.1  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  25.37 
 
 		 410 aa  89.7  8e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  23.44 
 
 		 432 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 		 442 aa  89.7  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  25.81 
 
 		 413 aa  89  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4656  hypothetical protein  27.11 
 
 		 427 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4288  hypothetical protein  26.72 
 
 		 433 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5002  MFS family membrane efflux protein  25.95 
 
 		 441 aa  87.8  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  26.69 
 
 		 417 aa  87.4  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  23.41 
 
 		 428 aa  87  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2848  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 426 aa  87  6e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3776  major facilitator superfamily MFS_1  27.88 
 
 		 412 aa  87  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 		 424 aa  86.7  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0372  major facilitator superfamily MFS_1  25.81 
 
 		 416 aa  85.9  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.862207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  24.55 
 
 		 431 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4337  major facilitator transporter  28.82 
 
 		 414 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1250  major facilitator superfamily MFS_1  27.58 
 
 		 378 aa  85.5  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4151  MFS permease  27.42 
 
 		 410 aa  85.5  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>