More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_27480 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_27480  Major Facilitator Superfamily transporter  100 
 
 		 428 aa  840    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2384  major facilitator superfamily MFS_1  61.93 
 
 		 441 aa  456  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000361861  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  27.9 
 
 		 494 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1327  major facilitator superfamily MFS_1  28.27 
 
 		 433 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 		 453 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  25.95 
 
 		 435 aa  107  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 418 aa  106  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4354  major facilitator superfamily MFS_1  29.25 
 
 		 431 aa  106  8e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  24.79 
 
 		 418 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 		 417 aa  105  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05410  arabinose efflux permease family protein  27.99 
 
 		 429 aa  103  7e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0915887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 410 aa  102  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  26.97 
 
 		 440 aa  100  5e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 474 aa  100  7e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  26.63 
 
 		 418 aa  99.8  9e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 		 450 aa  99  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  26.57 
 
 		 415 aa  98.2  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 		 423 aa  98.2  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 413 aa  96.7  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0234  protein of unknown function DUF894, DitE  26.16 
 
 		 419 aa  96.3  9e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 450 aa  96.3  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 474 aa  95.9  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3288  major facilitator superfamily protein  26.55 
 
 		 405 aa  95.9  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.234831 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  24.64 
 
 		 412 aa  95.5  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  25.3 
 
 		 431 aa  94.7  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  25.6 
 
 		 436 aa  94.7  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  23.32 
 
 		 424 aa  94.4  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  22.14 
 
 		 409 aa  94.4  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  26.05 
 
 		 413 aa  94.4  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3284  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 403 aa  93.2  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  28.11 
 
 		 457 aa  92.8  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 		 415 aa  92  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  28.78 
 
 		 451 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  26.01 
 
 		 428 aa  91.3  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  20.15 
 
 		 403 aa  90.5  5e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1281  major facilitator transporter  20.78 
 
 		 413 aa  90.1  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.835892  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  25.53 
 
 		 442 aa  89.4  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  25.42 
 
 		 415 aa  89  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 416 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0950  hypothetical protein  27 
 
 		 414 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  22.45 
 
 		 421 aa  87.4  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  25.66 
 
 		 416 aa  87  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  26.97 
 
 		 429 aa  87  5e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  27.53 
 
 		 445 aa  87  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3437  protein of unknown function DUF894 DitE  29.41 
 
 		 551 aa  86.7  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.545505  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4656  hypothetical protein  25.48 
 
 		 427 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3596  major facilitator superfamily MFS_1  24.81 
 
 		 417 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  27.45 
 
 		 433 aa  85.5  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2754  major facilitator superfamily MFS_1  25.8 
 
 		 453 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1484  major facilitator transporter  22.94 
 
 		 406 aa  85.9  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178978  normal  0.0348378 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  21.86 
 
 		 430 aa  86.3  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4288  hypothetical protein  26.53 
 
 		 433 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  24.37 
 
 		 447 aa  85.1  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  27 
 
 		 461 aa  85.1  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  27.6 
 
 		 420 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  24.62 
 
 		 426 aa  83.6  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 416 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 416 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  26.16 
 
 		 413 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  25.73 
 
 		 404 aa  83.2  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0652  major facilitator transporter  25.45 
 
 		 423 aa  82.4  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0291479  normal  0.182714 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  26.63 
 
 		 416 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  26.65 
 
 		 446 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  25.62 
 
 		 413 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  25.62 
 
 		 413 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0163  MFS permease  27.03 
 
 		 542 aa  82  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  26.94 
 
 		 420 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2480  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 457 aa  81.6  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.553694 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3776  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 412 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  26.16 
 
 		 414 aa  80.9  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  26.3 
 
 		 416 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2101  major facilitator superfamily MFS_1  26.96 
 
 		 479 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0786  major facilitator transporter  27.38 
 
 		 406 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  24.59 
 
 		 403 aa  80.5  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2519  major facilitator superfamily MFS_1  26.35 
 
 		 404 aa  80.5  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 418 aa  80.1  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3450  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 418 aa  79.3  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1264  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 		 422 aa  79.7  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62642  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8792  major facilitator superfamily MFS_1  25.45 
 
 		 420 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462854  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 		 417 aa  78.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 		 418 aa  78.2  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5002  MFS family membrane efflux protein  25.55 
 
 		 441 aa  79  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  24.87 
 
 		 452 aa  78.6  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  22.59 
 
 		 432 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1807  hypothetical protein  24.45 
 
 		 553 aa  77.8  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  26.05 
 
 		 416 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  25.49 
 
 		 416 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49890  membrame protein  26.9 
 
 		 454 aa  77.4  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3881  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 509 aa  77  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4026  major facilitator superfamily MFS_1  25.3 
 
 		 416 aa  77  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.557727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4337  major facilitator transporter  27.37 
 
 		 414 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 524 aa  77  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  25.31 
 
 		 401 aa  76.6  0.0000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 		 441 aa  76.6  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  26.16 
 
 		 413 aa  76.6  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4414  protein of unknown function DUF894, DitE  27.45 
 
 		 557 aa  76.3  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0612118  normal  0.91404 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  20.61 
 
 		 412 aa  75.9  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  25.12 
 
 		 425 aa  76.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  25.68 
 
 		 442 aa  76.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0980  major facilitator transporter  25.54 
 
 		 413 aa  76.3  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>