More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1805 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1805  Glycine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 424 aa  847    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.632012  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  58.8 
 
 		 417 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  57.66 
 
 		 412 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  56.04 
 
 		 410 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  55.5 
 
 		 414 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  58.31 
 
 		 417 aa  468  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  58.07 
 
 		 417 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  58.31 
 
 		 417 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  55.74 
 
 		 415 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  56.94 
 
 		 412 aa  467  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  55.56 
 
 		 410 aa  465  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  56.7 
 
 		 411 aa  463  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  55.98 
 
 		 415 aa  456  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  55.98 
 
 		 415 aa  456  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  55.8 
 
 		 420 aa  457  1e-127  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  56.25 
 
 		 418 aa  456  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  53.49 
 
 		 417 aa  454  1.0000000000000001e-126  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  54.18 
 
 		 413 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  54.83 
 
 		 412 aa  453  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  55.98 
 
 		 415 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  55.5 
 
 		 413 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  54.07 
 
 		 412 aa  453  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  54.07 
 
 		 412 aa  453  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  55.26 
 
 		 415 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1377  glycine hydroxymethyltransferase  55.13 
 
 		 411 aa  453  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0756  serine hydroxymethyltransferase  55.08 
 
 		 425 aa  451  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0782  serine hydroxymethyltransferase  55.08 
 
 		 425 aa  451  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  54.5 
 
 		 422 aa  451  1e-125  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  54.78 
 
 		 415 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  54.07 
 
 		 412 aa  446  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24721  serine hydroxymethyltransferase  55.77 
 
 		 424 aa  445  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  53.88 
 
 		 415 aa  448  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  53.98 
 
 		 416 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  55.29 
 
 		 413 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3717  serine hydroxymethyltransferase  58.78 
 
 		 418 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.982412  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1813  serine hydroxymethyltransferase  53.35 
 
 		 414 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  54.07 
 
 		 412 aa  447  1.0000000000000001e-124  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  56.36 
 
 		 414 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  54.31 
 
 		 413 aa  442  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  54.31 
 
 		 413 aa  444  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  54.55 
 
 		 413 aa  444  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  54.46 
 
 		 414 aa  442  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  54.46 
 
 		 414 aa  441  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  54.7 
 
 		 414 aa  443  1e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  54.31 
 
 		 413 aa  443  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2312  serine hydroxymethyltransferase  53.98 
 
 		 412 aa  444  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.297378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  54.31 
 
 		 413 aa  443  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  53.61 
 
 		 423 aa  441  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  54.7 
 
 		 422 aa  442  1e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  54.55 
 
 		 413 aa  444  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02911  serine hydroxymethyltransferase  53.85 
 
 		 423 aa  444  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  54.55 
 
 		 413 aa  443  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  54.31 
 
 		 413 aa  442  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1617  serine hydroxymethyltransferase  55.83 
 
 		 414 aa  444  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  52.37 
 
 		 424 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  54.57 
 
 		 419 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584892  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1624  serine hydroxymethyltransferase  53.62 
 
 		 411 aa  438  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2316  serine hydroxymethyltransferase  52.27 
 
 		 412 aa  438  9.999999999999999e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  55.23 
 
 		 417 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  55.8 
 
 		 415 aa  438  9.999999999999999e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  52.64 
 
 		 423 aa  438  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  55.53 
 
 		 429 aa  441  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03361  serine hydroxymethyltransferase  53.62 
 
 		 411 aa  441  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.498926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1854  serine hydroxymethyltransferase  55.74 
 
 		 412 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3354  serine hydroxymethyltransferase  55.92 
 
 		 432 aa  440  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0554425  normal  0.88347 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  52.52 
 
 		 412 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1389  Glycine hydroxymethyltransferase  55.05 
 
 		 427 aa  438  9.999999999999999e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000692081  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  51.18 
 
 		 423 aa  437  1e-121  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1463  glycine hydroxymethyltransferase  53.12 
 
 		 415 aa  437  1e-121  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21550  serine hydroxymethyltransferase  56.8 
 
 		 418 aa  437  1e-121  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.968894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  54.78 
 
 		 427 aa  436  1e-121  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  55.53 
 
 		 431 aa  437  1e-121  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0075  serine hydroxymethyltransferase  51.33 
 
 		 413 aa  437  1e-121  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0851  glycine hydroxymethyltransferase  54.03 
 
 		 419 aa  436  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0407045  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  56.39 
 
 		 416 aa  437  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4898  glycine hydroxymethyltransferase  53 
 
 		 427 aa  435  1e-121  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0207  serine hydroxymethyltransferase  54.78 
 
 		 427 aa  436  1e-121  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  52.64 
 
 		 423 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2187  Glycine hydroxymethyltransferase  53.77 
 
 		 418 aa  436  1e-121  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0127  Glycine hydroxymethyltransferase  54.02 
 
 		 435 aa  433  1e-120  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3097  serine hydroxymethyltransferase  55.5 
 
 		 412 aa  434  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175089 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0004  serine hydroxymethyltransferase  54.09 
 
 		 416 aa  432  1e-120  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0959  Glycine hydroxymethyltransferase  54.07 
 
 		 410 aa  434  1e-120  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.587194  normal  0.162631 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  52.64 
 
 		 425 aa  432  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0389  serine hydroxymethyltransferase  52.73 
 
 		 436 aa  434  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285606 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02841  serine hydroxymethyltransferase  52.64 
 
 		 416 aa  434  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1155  serine hydroxymethyltransferase  52.74 
 
 		 436 aa  432  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1661  Glycine hydroxymethyltransferase  58.84 
 
 		 421 aa  429  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1678  serine hydroxymethyltransferase  56.09 
 
 		 426 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  55.29 
 
 		 427 aa  430  1e-119  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1142  serine hydroxymethyltransferase  55.99 
 
 		 434 aa  429  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0469  serine hydroxymethyltransferase  55.31 
 
 		 474 aa  429  1e-119  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00996315  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  54.44 
 
 		 417 aa  430  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  53.57 
 
 		 417 aa  431  1e-119  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2311  Glycine hydroxymethyltransferase  50.96 
 
 		 466 aa  426  1e-118  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000314902  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2076  serine hydroxymethyltransferase  54.33 
 
 		 427 aa  427  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.745833  hitchhiker  0.000706319 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  54.68 
 
 		 413 aa  428  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0759  serine hydroxymethyltransferase  53.48 
 
 		 417 aa  425  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1264  serine hydroxymethyltransferase  54.94 
 
 		 426 aa  427  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0373  serine hydroxymethyltransferase  55.85 
 
 		 419 aa  427  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.238829  normal  0.155765 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>