263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1470 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1470  GTP-binding signal recognition particle  100 
 
 		 293 aa  577  1e-164  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0533  GTP-binding signal recognition particle  35.05 
 
 		 368 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.868683  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0680  GTP-binding signal recognition particle  27.71 
 
 		 330 aa  91.3  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.665283 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0715  flagellar biosynthetic protein FlhF  30.54 
 
 		 485 aa  67.4  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.858547  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1485  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  28.43 
 
 		 373 aa  67  0.0000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0367  flagellar biosynthesis regulator FlhF  27.55 
 
 		 458 aa  65.5  0.0000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00655433  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1964  signal recognition particle protein Srp54  31.73 
 
 		 443 aa  65.5  0.0000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4133  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  30.93 
 
 		 412 aa  65.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.535146  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0233  flagellar biosynthesis regulator FlhF  25.13 
 
 		 461 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0367  flagellar biosynthesis regulator FlhF  25.37 
 
 		 452 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0407274  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  28.12 
 
 		 447 aa  64.7  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0074  flagellar biosynthesis regulator FlhF  24.87 
 
 		 481 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1508  flagellar biosynthesis regulator FlhF  26.8 
 
 		 435 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0061  flagellar biosynthesis regulator FlhF  24.87 
 
 		 484 aa  64.3  0.000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0102  flagellar biosynthesis regulator FlhF  24.87 
 
 		 484 aa  63.9  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1474  signal recognition particle protein Srp54  28.85 
 
 		 446 aa  62.8  0.000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.570422  decreased coverage  0.000118802 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3470  flagellar biosynthesis protein FlhF, putative  25.22 
 
 		 353 aa  62.4  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3055  flagellar biosynthetic protein FlhF, putative  29.19 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4110  GTP-binding signal recognition particle  28.73 
 
 		 447 aa  61.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.963643  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0427  GTP-binding signal recognition particle  28.72 
 
 		 452 aa  60.8  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1864  flagellar biosynthesis regulator FlhF  29.17 
 
 		 542 aa  60.8  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.625266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0703  flagellar biosynthesis regulator FlhF  24.37 
 
 		 362 aa  60.5  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0369  signal recognition particle protein Srp54  30.33 
 
 		 444 aa  60.5  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3850  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  28.8 
 
 		 481 aa  60.1  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000866601 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00959  flagellar biosynthesis regulator FlhF  29.74 
 
 		 551 aa  60.5  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.136085  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06207  flagellar biosynthesis regulator FlhF  29.74 
 
 		 551 aa  60.5  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106259  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3766  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  28.35 
 
 		 468 aa  60.1  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1261  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  27.32 
 
 		 469 aa  60.1  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0983  GTP-binding signal recognition particle  31.07 
 
 		 466 aa  59.3  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10552 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3285  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  28.16 
 
 		 441 aa  59.3  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0141  signal recognition particle protein Srp54  26.34 
 
 		 439 aa  58.2  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  31.68 
 
 		 469 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2028  flagellar biosynthetic protein FlhF  24.15 
 
 		 350 aa  57.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0870  hypothetical protein  23.18 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0918  signal recognition particle protein Srp54  25.71 
 
 		 443 aa  57.4  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2686  flagellar biosynthetic protein FlhF  25.97 
 
 		 446 aa  56.6  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.303629  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1650  signal recognition particle protein  28.08 
 
 		 446 aa  56.6  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1139  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  29.58 
 
 		 626 aa  57  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0589  flagellar biosynthetic protein FlhF  26.86 
 
 		 437 aa  57  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1748  flagellar biosynthesis regulator FlhF  23.21 
 
 		 379 aa  56.6  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1748  flagellar biosynthesis regulator FlhF  22.92 
 
 		 379 aa  56.2  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2157  flagellar biosynthesis regulator FlhF  28.71 
 
 		 393 aa  56.2  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1802  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  25.45 
 
 		 464 aa  56.2  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0556  signal recognition particle protein  26.4 
 
 		 444 aa  56.2  0.0000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.521586  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1226  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  27.09 
 
 		 468 aa  55.8  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0531  GTP-binding signal recognition particle  31.37 
 
 		 442 aa  55.8  0.0000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0638  signal recognition particle protein  27.23 
 
 		 444 aa  55.8  0.0000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000602256  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0544  signal recognition particle protein Srp54  27.4 
 
 		 440 aa  55.8  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0717053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3023  signal recognition particle protein Srp54  29.38 
 
 		 437 aa  55.8  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2996  signal recognition particle protein  27.88 
 
 		 454 aa  55.5  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000641047  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3038  signal recognition particle protein  27.88 
 
 		 454 aa  55.5  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000193458  normal  0.986059 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1950  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  25.12 
 
 		 447 aa  55.1  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.910344  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0745  flagellar biosynthesis regulator FlhF  24.88 
 
 		 388 aa  55.5  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0293  flagellar biosynthetic protein FlhF  24.74 
 
 		 423 aa  55.1  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0113568  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  28.57 
 
 		 449 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0510  signal recognition particle protein  29.58 
 
 		 517 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.659229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0675  signal recognition particle protein  25 
 
 		 446 aa  54.3  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.511297  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  29.41 
 
 		 446 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0479  GTP-binding signal recognition particle  31.03 
 
 		 585 aa  55.1  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.530078  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0809  signal recognition particle protein  25.51 
 
 		 445 aa  54.3  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0791  flagellar biosynthesis regulator FlhF  31.58 
 
 		 392 aa  53.9  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0874551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3039  GTP-binding signal recognition particle  29.12 
 
 		 452 aa  53.9  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0732  signal recognition particle protein  25.51 
 
 		 445 aa  53.9  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.124171  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1434  signal recognition particle protein  23.98 
 
 		 446 aa  53.5  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.158506  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1006  signal recognition particle protein  26.92 
 
 		 434 aa  53.5  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0974  normal  0.236237 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0540  signal recognition particle protein  26.48 
 
 		 449 aa  53.5  0.000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.733534  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45660  flagellar biosynthesis regulator FlhF  27.47 
 
 		 429 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.311812 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1650  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  24.76 
 
 		 399 aa  53.5  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000418792  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1877  signal recognition particle protein Srp54  27.57 
 
 		 441 aa  53.1  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.189511 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  26.7 
 
 		 448 aa  53.1  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1386  flagellar biosynthesis regulator FlhF  25.63 
 
 		 434 aa  53.1  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1547  flagellar biosynthesis regulator FlhF  23.62 
 
 		 436 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3035  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  26.24 
 
 		 454 aa  52.8  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3445  GTP-binding signal recognition particle  25 
 
 		 446 aa  52.8  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3874  flagellar biosynthesis regulator FlhF  27.17 
 
 		 429 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.571871  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0221  signal recognition particle protein  29.95 
 
 		 514 aa  52.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115082  hitchhiker  0.0089568 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1297  signal recognition particle protein  25 
 
 		 445 aa  52.8  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3802  flagellar biosynthesis regulator FlhF  24.16 
 
 		 624 aa  52.4  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  29.85 
 
 		 449 aa  52.4  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  29.85 
 
 		 449 aa  52.4  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3912  flagellar biosynthesis regulator FlhF  27.8 
 
 		 435 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4343  flagellar biosynthesis regulator FlhF  27.8 
 
 		 435 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.615719  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  29.85 
 
 		 449 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  29.85 
 
 		 449 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1558  flagellar biosynthesis regulator FlhF  23.62 
 
 		 436 aa  52  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  29.85 
 
 		 449 aa  51.6  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  29.85 
 
 		 449 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  29.85 
 
 		 449 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf350  signal recognition particle  24.64 
 
 		 441 aa  51.6  0.00001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.826641  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0777  signal recognition particle protein  29 
 
 		 441 aa  52  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17061  signal recognition particle protein (SRP54)  27.36 
 
 		 487 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0353  signal recognition particle protein  29.58 
 
 		 514 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.547183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0246  signal recognition particle protein  28.64 
 
 		 516 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1594  flagellar biosynthesis regulator FlhF  25.25 
 
 		 436 aa  52  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1524  flagellar biosynthesis regulator FlhF  27.8 
 
 		 435 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.142564  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0865  signal recognition particle protein Srp54  25.89 
 
 		 450 aa  52  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0440978  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1039  signal recognition particle protein  23.98 
 
 		 448 aa  51.6  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00689452  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0496  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  25.6 
 
 		 464 aa  52  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.50914 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2807  flagellar biosynthesis regulator FlhF  28.57 
 
 		 437 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.16054 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0853  signal recognition particle protein  27.36 
 
 		 487 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>