More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1524 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4343  flagellar biosynthesis regulator FlhF  99.54 
 
 		 435 aa  872    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.615719  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1977  flagellar biosynthesis protein FlhF  82.35 
 
 		 442 aa  718    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.218828  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3439  flagellar biosynthesis regulator FlhF  82.13 
 
 		 442 aa  721    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3669  flagellar biosynthesis regulator FlhF  93.79 
 
 		 435 aa  771    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.421511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1561  flagellar biosynthesis regulator FlhF  82.62 
 
 		 446 aa  721    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.37144  normal  0.111794 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3912  flagellar biosynthesis regulator FlhF  98.62 
 
 		 435 aa  866    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1524  flagellar biosynthesis regulator FlhF  100 
 
 		 435 aa  874    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.142564  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2807  flagellar biosynthesis regulator FlhF  68.43 
 
 		 437 aa  587  1e-166  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.16054 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45660  flagellar biosynthesis regulator FlhF  66.82 
 
 		 429 aa  560  1e-158  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.311812 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3874  flagellar biosynthesis regulator FlhF  66.13 
 
 		 429 aa  550  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.571871  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2157  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.7 
 
 		 393 aa  266  4e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0983  GTP-binding signal recognition particle  36.92 
 
 		 466 aa  254  2.0000000000000002e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10552 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2292  flagellar biosynthesis regulator FlhF  34.27 
 
 		 484 aa  247  2e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1977  GTP-binding signal recognition particle  37.71 
 
 		 437 aa  247  3e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3051  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.28 
 
 		 464 aa  246  6e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.03242 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1336  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  38.48 
 
 		 424 aa  245  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.550768  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0745  flagellar biosynthesis regulator FlhF  34.05 
 
 		 388 aa  242  7e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1452  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.74 
 
 		 460 aa  233  5e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3053  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.74 
 
 		 460 aa  233  5e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.432908  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1341  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35.12 
 
 		 462 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.672672  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1633  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.4 
 
 		 467 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0994643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2921  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.51 
 
 		 460 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2911  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.51 
 
 		 460 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1197  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35.52 
 
 		 461 aa  230  3e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.137335  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002830  flagellar biosynthesis protein FlhF  40.57 
 
 		 505 aa  230  5e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00231681  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1364  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.15 
 
 		 458 aa  229  7e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.789112  normal  0.915737 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2282  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.43 
 
 		 463 aa  229  9e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.451131  normal  0.682206 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2561  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38 
 
 		 460 aa  228  1e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.287894  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03146  flagellar biosynthesis regulator FlhF  40.57 
 
 		 503 aa  229  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1297  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.92 
 
 		 458 aa  228  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.113598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3429  GTP-binding signal recognition particle  36.43 
 
 		 427 aa  227  4e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.911214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1357  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.15 
 
 		 458 aa  227  4e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.592498  normal  0.109972 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3212  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35.92 
 
 		 458 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1656  flagellar biosynthesis regulator FlhF  39.93 
 
 		 495 aa  224  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000227361  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1946  flagellar biosynthesis regulator FlhF  34.32 
 
 		 536 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3032  GTP-binding signal recognition particle  35.02 
 
 		 443 aa  221  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0479  GTP-binding signal recognition particle  41.3 
 
 		 585 aa  220  5e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.530078  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1376  flagellar biosynthesis regulator FlhF  34.45 
 
 		 470 aa  219  7e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0597735  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1381  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35.38 
 
 		 474 aa  216  5e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.286129 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02872  flagellar biosynthesis protein  34.7 
 
 		 477 aa  214  3.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1517  flagellar biosynthesis regulator FlhF  33.9 
 
 		 513 aa  212  9e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1748  flagellar biosynthesis regulator FlhF  34.22 
 
 		 379 aa  211  3e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1748  flagellar biosynthesis regulator FlhF  34.22 
 
 		 379 aa  210  4e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3700  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35.89 
 
 		 825 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.528557  normal  0.0206253 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2166  flagellar biosynthetic protein FlhF  39.37 
 
 		 527 aa  207  3e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0741  flagellar biosynthesis regulator FlhF  33.4 
 
 		 487 aa  203  4e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1247  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.32 
 
 		 414 aa  203  5e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0715  flagellar biosynthetic protein FlhF  34.24 
 
 		 485 aa  202  9.999999999999999e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.858547  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2936  flagellar biosynthesis regulator FlhF  40.91 
 
 		 489 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0148742  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0061  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.83 
 
 		 583 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3842  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.83 
 
 		 583 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2845  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.83 
 
 		 374 aa  186  7e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3421  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.83 
 
 		 374 aa  186  7e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3923  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.83 
 
 		 583 aa  186  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1697  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.83 
 
 		 374 aa  186  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3168  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.83 
 
 		 577 aa  186  8e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0196  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.13 
 
 		 588 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.625172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3802  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.29 
 
 		 624 aa  184  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3372  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.46 
 
 		 587 aa  184  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0303605  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4142  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.81 
 
 		 784 aa  184  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0183  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.79 
 
 		 588 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1392  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.49 
 
 		 615 aa  182  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.70556  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0132  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.95 
 
 		 657 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2838  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.05 
 
 		 592 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0269  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.05 
 
 		 592 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.147151  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0251  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.13 
 
 		 582 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.789642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0177  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.84 
 
 		 583 aa  180  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.167387 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2962  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.68 
 
 		 644 aa  179  9e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.168283  normal  0.0622523 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4068  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.81 
 
 		 632 aa  179  9e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4180  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.81 
 
 		 632 aa  179  9e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2014  GTP-binding signal recognition particle SRP54, G-protein  32.63 
 
 		 729 aa  179  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5617  flagellar biosynthesis regulator FlhF  39.25 
 
 		 804 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.51958  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1311  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.91 
 
 		 570 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1864  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.5 
 
 		 542 aa  172  7.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.625266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06207  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.46 
 
 		 551 aa  169  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106259  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00959  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.46 
 
 		 551 aa  169  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.136085  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3079  flagellar GTP-binding protein  38.79 
 
 		 521 aa  168  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.783936 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1173  flagellar biosynthetic protein FlhF  31.01 
 
 		 424 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.141847  normal  0.243928 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1620  GTP-binding signal recognition particle  36.3 
 
 		 592 aa  159  9e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00835044 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3708  GTP-binding signal recognition particle  29.09 
 
 		 479 aa  147  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1161  flagellar GTP-binding protein  32.48 
 
 		 419 aa  145  9e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1178  flagellar biosynthetic protein FlhF  37.06 
 
 		 375 aa  145  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3821  GTP-binding signal recognition particle  35.4 
 
 		 530 aa  144  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.236698 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3094  AAA ATPase  35.4 
 
 		 530 aa  144  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0870  hypothetical protein  27.4 
 
 		 395 aa  144  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0589  flagellar biosynthetic protein FlhF  28.47 
 
 		 437 aa  143  5e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27900  flagellar biosynthesis protein  42.11 
 
 		 758 aa  142  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0457594  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2023  flagellar biosynthesis regulator FlhF  29.69 
 
 		 400 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4110  GTP-binding signal recognition particle  28.48 
 
 		 447 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.963643  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4414  GTP-binding signal recognition particle  33.01 
 
 		 524 aa  139  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0564624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3445  GTP-binding signal recognition particle  27.7 
 
 		 446 aa  137  5e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0598  GTP-binding signal recognition particle  35.25 
 
 		 548 aa  136  9e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0427  GTP-binding signal recognition particle  29.02 
 
 		 452 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1131  flagellar biosynthesis regulator FlhF  33.33 
 
 		 372 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1414  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  25.55 
 
 		 466 aa  127  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.37115 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0705  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.5 
 
 		 438 aa  127  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4133  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  29.86 
 
 		 412 aa  126  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.535146  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0791  flagellar biosynthesis regulator FlhF  30.05 
 
 		 392 aa  124  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0874551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1672  GTP-binding signal recognition particle  32 
 
 		 341 aa  124  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3285  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  36.22 
 
 		 441 aa  123  7e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>