146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3470 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3470  flagellar biosynthesis protein FlhF, putative  100 
 
 		 353 aa  730    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0327  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  42 
 
 		 347 aa  291  8e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.114959  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0157  flagellar biosynthesis protein FlhF, putative  41.44 
 
 		 365 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.585819  normal  0.305357 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2013  flagellar biosynthesis protein FlhF, putative  36.14 
 
 		 419 aa  258  1e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0381  flagellar biosynthesis protein FlhF, putative  35.65 
 
 		 362 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.896845  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2030  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  24.87 
 
 		 389 aa  89  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16670  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  22.67 
 
 		 356 aa  84.3  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1672  GTP-binding signal recognition particle  24.64 
 
 		 341 aa  82.8  0.000000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2152  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  22.31 
 
 		 372 aa  79  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0020  flagellar biosynthesis regulator FlhF  23.73 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000398912  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0020  flagellar biosynthesis regulator FlhF  23.73 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.652201  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1864  flagellar biosynthesis regulator FlhF  25.76 
 
 		 542 aa  70.9  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.625266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1314  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  26.8 
 
 		 402 aa  70.5  0.00000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1139  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  27.37 
 
 		 626 aa  70.1  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0791  flagellar biosynthesis regulator FlhF  24.56 
 
 		 392 aa  69.7  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0874551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1485  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  26.94 
 
 		 373 aa  67.4  0.0000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0745  flagellar biosynthesis regulator FlhF  23.87 
 
 		 388 aa  64.3  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0589  flagellar biosynthetic protein FlhF  28.02 
 
 		 437 aa  64.3  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0870  hypothetical protein  24.61 
 
 		 395 aa  63.5  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2028  flagellar biosynthetic protein FlhF  25.21 
 
 		 350 aa  63.5  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1517  flagellar biosynthesis regulator FlhF  28.49 
 
 		 513 aa  63.2  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1656  flagellar biosynthesis regulator FlhF  24.48 
 
 		 495 aa  63.2  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000227361  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1392  flagellar biosynthesis regulator FlhF  26.55 
 
 		 615 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.70556  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4180  flagellar biosynthesis regulator FlhF  26.55 
 
 		 632 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3285  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  23.32 
 
 		 441 aa  62.4  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1470  GTP-binding signal recognition particle  25.22 
 
 		 293 aa  62.4  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0705  flagellar biosynthesis regulator FlhF  27.64 
 
 		 438 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4068  flagellar biosynthesis regulator FlhF  26.55 
 
 		 632 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4110  GTP-binding signal recognition particle  24.23 
 
 		 447 aa  61.6  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.963643  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1748  flagellar biosynthesis regulator FlhF  23.82 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0427  GTP-binding signal recognition particle  27.78 
 
 		 452 aa  61.2  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1437  flagellar biosynthesis regulator FlhF  21.54 
 
 		 373 aa  60.8  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1131  flagellar biosynthesis regulator FlhF  23.08 
 
 		 372 aa  60.1  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03146  flagellar biosynthesis regulator FlhF  24.56 
 
 		 503 aa  59.3  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1748  flagellar biosynthesis regulator FlhF  23.56 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06207  flagellar biosynthesis regulator FlhF  26.37 
 
 		 551 aa  59.3  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106259  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00959  flagellar biosynthesis regulator FlhF  26.37 
 
 		 551 aa  59.3  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.136085  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2694  GTP-binding signal recognition particle  24.87 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3055  flagellar biosynthetic protein FlhF, putative  30 
 
 		 441 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002830  flagellar biosynthesis protein FlhF  24.38 
 
 		 505 aa  58.5  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00231681  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1977  GTP-binding signal recognition particle  28.06 
 
 		 437 aa  58.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2023  flagellar biosynthesis regulator FlhF  23.19 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2157  flagellar biosynthesis regulator FlhF  22.75 
 
 		 393 aa  57.4  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2807  flagellar biosynthesis regulator FlhF  25.54 
 
 		 437 aa  57  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.16054 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0367  flagellar biosynthesis regulator FlhF  24.35 
 
 		 452 aa  57  0.0000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0407274  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1173  flagellar biosynthetic protein FlhF  22.05 
 
 		 424 aa  56.6  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.141847  normal  0.243928 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1357  GTP-binding signal recognition particle  26.78 
 
 		 378 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.138394  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2292  flagellar biosynthesis regulator FlhF  23.67 
 
 		 484 aa  55.5  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0183  flagellar biosynthesis regulator FlhF  25.7 
 
 		 588 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0196  flagellar biosynthesis regulator FlhF  25.7 
 
 		 588 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.625172  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3212  flagellar biosynthesis regulator FlhF  24.1 
 
 		 458 aa  54.3  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1357  flagellar biosynthesis regulator FlhF  24.42 
 
 		 458 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.592498  normal  0.109972 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2686  flagellar biosynthetic protein FlhF  23 
 
 		 446 aa  54.3  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.303629  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1297  flagellar biosynthesis regulator FlhF  24.42 
 
 		 458 aa  53.9  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.113598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1364  flagellar biosynthesis regulator FlhF  24.42 
 
 		 458 aa  53.9  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.789112  normal  0.915737 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1508  flagellar biosynthesis regulator FlhF  23.12 
 
 		 435 aa  53.5  0.000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0377  flagellar biosynthesis regulator FlhF  24.06 
 
 		 372 aa  53.5  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2845  flagellar biosynthesis regulator FlhF  23.91 
 
 		 374 aa  53.1  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3421  flagellar biosynthesis regulator FlhF  23.91 
 
 		 374 aa  53.1  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1697  flagellar biosynthesis regulator FlhF  23.91 
 
 		 374 aa  53.1  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0479  GTP-binding signal recognition particle  28.98 
 
 		 585 aa  52.8  0.000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.530078  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1791  flagellar biosynthesis regulator FlhF  24.44 
 
 		 436 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1595  flagellar biosynthesis regulator FlhF  23.71 
 
 		 281 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.859817  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1547  flagellar biosynthesis regulator FlhF  25.14 
 
 		 436 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0061  flagellar biosynthesis regulator FlhF  23.91 
 
 		 583 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3700  flagellar biosynthesis regulator FlhF  21.28 
 
 		 825 aa  52.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.528557  normal  0.0206253 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3842  flagellar biosynthesis regulator FlhF  23.91 
 
 		 583 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1558  flagellar biosynthesis regulator FlhF  24.44 
 
 		 436 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3372  flagellar biosynthesis regulator FlhF  24.58 
 
 		 587 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0303605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3168  flagellar biosynthesis regulator FlhF  23.91 
 
 		 577 aa  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1452  flagellar biosynthesis regulator FlhF  23.84 
 
 		 460 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3802  flagellar biosynthesis regulator FlhF  25.54 
 
 		 624 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2596  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  27.32 
 
 		 380 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00656754  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3923  flagellar biosynthesis regulator FlhF  23.91 
 
 		 583 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2500  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  27.32 
 
 		 382 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0691788  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3053  flagellar biosynthesis regulator FlhF  23.84 
 
 		 460 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.432908  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1633  flagellar biosynthesis regulator FlhF  24.42 
 
 		 467 aa  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0994643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0276  flagellar biosynthesis regulator FlhF  21.8 
 
 		 388 aa  50.8  0.00003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1768  flagellar biosynthesis regulator FlhF  24.44 
 
 		 436 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3445  GTP-binding signal recognition particle  23.67 
 
 		 446 aa  50.8  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2911  flagellar biosynthesis regulator FlhF  23.84 
 
 		 460 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2921  flagellar biosynthesis regulator FlhF  23.84 
 
 		 460 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0367  flagellar biosynthesis regulator FlhF  22.55 
 
 		 458 aa  51.2  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00655433  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0715  flagellar biosynthetic protein FlhF  25.93 
 
 		 485 aa  50.4  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.858547  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0132  flagellar biosynthesis regulator FlhF  25.54 
 
 		 657 aa  50.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1341  flagellar biosynthesis regulator FlhF  23.84 
 
 		 462 aa  50.4  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.672672  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1376  flagellar biosynthesis regulator FlhF  24.42 
 
 		 470 aa  50.1  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0597735  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2962  flagellar biosynthesis regulator FlhF  25.7 
 
 		 644 aa  50.4  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.168283  normal  0.0622523 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1846  flagellar biosynthesis regulator FlhF  23.89 
 
 		 436 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0703  flagellar biosynthesis regulator FlhF  23.53 
 
 		 362 aa  50.1  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2838  flagellar biosynthesis regulator FlhF  24.02 
 
 		 592 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0269  flagellar biosynthesis regulator FlhF  24.02 
 
 		 592 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.147151  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2561  flagellar biosynthesis regulator FlhF  23.84 
 
 		 460 aa  50.1  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.287894  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3051  flagellar biosynthesis regulator FlhF  23.84 
 
 		 464 aa  50.1  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.03242 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0251  flagellar biosynthesis regulator FlhF  24.02 
 
 		 582 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.789642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2014  GTP-binding signal recognition particle SRP54, G-protein  23.38 
 
 		 729 aa  50.1  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1399  GTP-binding signal recognition particle  25.75 
 
 		 438 aa  49.7  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1411  flagellar biosynthetic protein FlhF  25.77 
 
 		 381 aa  49.7  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3766  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  23.59 
 
 		 468 aa  49.7  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1381  flagellar biosynthesis regulator FlhF  24.42 
 
 		 474 aa  49.3  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.286129 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>