More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2023 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2023  flagellar biosynthesis regulator FlhF  100 
 
 
400 aa  816    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1131  flagellar biosynthesis regulator FlhF  52.37 
 
 
372 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3285  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  33.48 
 
 
441 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2152  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  31.44 
 
 
372 aa  209  9e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4133  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  32.46 
 
 
412 aa  208  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.535146  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3445  GTP-binding signal recognition particle  33.77 
 
 
446 aa  208  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1161  flagellar GTP-binding protein  34.26 
 
 
419 aa  206  6e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1314  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  36.17 
 
 
402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1672  GTP-binding signal recognition particle  31.88 
 
 
341 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2030  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  32.43 
 
 
389 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1747  flagellar biosynthesis regulator FlhF  32.94 
 
 
413 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16670  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  31.67 
 
 
356 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4110  GTP-binding signal recognition particle  33.93 
 
 
447 aa  194  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.963643  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0870  hypothetical protein  30.6 
 
 
395 aa  194  3e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1411  flagellar biosynthetic protein FlhF  34.29 
 
 
381 aa  194  3e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0427  GTP-binding signal recognition particle  31.17 
 
 
452 aa  192  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2694  GTP-binding signal recognition particle  30.28 
 
 
404 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0293  flagellar biosynthetic protein FlhF  31.93 
 
 
423 aa  182  1e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0113568  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1437  flagellar biosynthesis regulator FlhF  30.4 
 
 
373 aa  178  1e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0705  flagellar biosynthesis regulator FlhF  31.64 
 
 
438 aa  176  6e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1508  flagellar biosynthesis regulator FlhF  27.93 
 
 
435 aa  176  8e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0377  flagellar biosynthesis regulator FlhF  34.33 
 
 
372 aa  173  3.9999999999999995e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2028  flagellar biosynthetic protein FlhF  33 
 
 
350 aa  171  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0589  flagellar biosynthetic protein FlhF  31.05 
 
 
437 aa  171  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0020  flagellar biosynthesis regulator FlhF  33.59 
 
 
378 aa  169  6e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000398912  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0020  flagellar biosynthesis regulator FlhF  33.59 
 
 
378 aa  169  6e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.652201  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0367  flagellar biosynthesis regulator FlhF  28.12 
 
 
458 aa  169  1e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00655433  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0486  GTP-binding signal recognition particle  44.74 
 
 
403 aa  169  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0367  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.57 
 
 
452 aa  167  2.9999999999999998e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0407274  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0791  flagellar biosynthesis regulator FlhF  32.11 
 
 
392 aa  167  4e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0874551  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1399  GTP-binding signal recognition particle  28.94 
 
 
438 aa  159  8e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0102  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.4 
 
 
484 aa  157  2e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0061  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.4 
 
 
484 aa  156  7e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1414  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  43.85 
 
 
466 aa  155  9e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.37115 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0074  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.03 
 
 
481 aa  155  1e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3055  flagellar biosynthetic protein FlhF, putative  35.66 
 
 
441 aa  155  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3429  GTP-binding signal recognition particle  29.13 
 
 
427 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.911214  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0745  flagellar biosynthesis regulator FlhF  28.64 
 
 
388 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0233  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.86 
 
 
461 aa  153  5.9999999999999996e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3766  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  39.15 
 
 
468 aa  151  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3850  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  38.62 
 
 
481 aa  150  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000866601 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0703  flagellar biosynthesis regulator FlhF  33.09 
 
 
362 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1139  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  41.27 
 
 
626 aa  148  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2391  flagellar biosynthesis regulator FlhF  30.58 
 
 
405 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45660  flagellar biosynthesis regulator FlhF  30.95 
 
 
429 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.311812 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2292  flagellar biosynthesis regulator FlhF  39.13 
 
 
484 aa  141  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2561  flagellar biosynthesis regulator FlhF  29.11 
 
 
460 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.287894  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1656  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.79 
 
 
495 aa  139  7.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000227361  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3212  flagellar biosynthesis regulator FlhF  29.28 
 
 
458 aa  139  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2157  flagellar biosynthesis regulator FlhF  29.03 
 
 
393 aa  139  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1485  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  28.39 
 
 
373 aa  138  2e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1946  flagellar biosynthesis regulator FlhF  25.73 
 
 
536 aa  138  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3700  flagellar biosynthesis regulator FlhF  29.47 
 
 
825 aa  138  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.528557  normal  0.0206253 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1357  flagellar biosynthesis regulator FlhF  29.91 
 
 
458 aa  138  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.592498  normal  0.109972 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2921  flagellar biosynthesis regulator FlhF  28.9 
 
 
460 aa  137  4e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1364  flagellar biosynthesis regulator FlhF  29.91 
 
 
458 aa  136  5e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.789112  normal  0.915737 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1297  flagellar biosynthesis regulator FlhF  29.91 
 
 
458 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.113598  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1452  flagellar biosynthesis regulator FlhF  28.83 
 
 
460 aa  136  8e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3053  flagellar biosynthesis regulator FlhF  28.83 
 
 
460 aa  136  8e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.432908  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2911  flagellar biosynthesis regulator FlhF  28.67 
 
 
460 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002830  flagellar biosynthesis protein FlhF  32.88 
 
 
505 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00231681  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1336  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  28.92 
 
 
424 aa  135  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.550768  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03146  flagellar biosynthesis regulator FlhF  32.78 
 
 
503 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3439  flagellar biosynthesis regulator FlhF  28.67 
 
 
442 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3874  flagellar biosynthesis regulator FlhF  30.24 
 
 
429 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.571871  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0983  GTP-binding signal recognition particle  27.95 
 
 
466 aa  134  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.10552 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1748  flagellar biosynthesis regulator FlhF  28.5 
 
 
379 aa  134  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2807  flagellar biosynthesis regulator FlhF  30.25 
 
 
437 aa  133  6e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.16054 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1748  flagellar biosynthesis regulator FlhF  28.5 
 
 
379 aa  133  6.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3039  GTP-binding signal recognition particle  39.25 
 
 
452 aa  132  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1977  flagellar biosynthesis protein FlhF  28.57 
 
 
442 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.218828  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2500  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  31.02 
 
 
382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0691788  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0276  flagellar biosynthesis regulator FlhF  25.85 
 
 
388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1561  flagellar biosynthesis regulator FlhF  28.77 
 
 
446 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.37144  normal  0.111794 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4343  flagellar biosynthesis regulator FlhF  29.45 
 
 
435 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.615719  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3669  flagellar biosynthesis regulator FlhF  30.12 
 
 
435 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.421511  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0180  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  36.14 
 
 
657 aa  126  6e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000220728  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1524  flagellar biosynthesis regulator FlhF  29.69 
 
 
435 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.142564  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2596  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  33.22 
 
 
380 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00656754  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2014  GTP-binding signal recognition particle SRP54, G-protein  27.63 
 
 
729 aa  124  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0741  flagellar biosynthesis regulator FlhF  27.77 
 
 
487 aa  123  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0715  flagellar biosynthetic protein FlhF  38.33 
 
 
485 aa  124  4e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.858547  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1341  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.17 
 
 
462 aa  123  5e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.672672  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3912  flagellar biosynthesis regulator FlhF  29.69 
 
 
435 aa  123  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2282  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.14 
 
 
463 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.451131  normal  0.682206 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1173  flagellar biosynthetic protein FlhF  26.89 
 
 
424 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.141847  normal  0.243928 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1197  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.42 
 
 
461 aa  120  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.137335  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1650  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  32.49 
 
 
399 aa  119  7.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000418792  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1633  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.61 
 
 
467 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0994643  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4142  flagellar biosynthesis regulator FlhF  32.41 
 
 
784 aa  118  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1376  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.26 
 
 
470 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0597735  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3051  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.61 
 
 
464 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.03242 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1977  GTP-binding signal recognition particle  35.08 
 
 
437 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1311  flagellar biosynthesis regulator FlhF  29.76 
 
 
570 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2686  flagellar biosynthetic protein FlhF  36.41 
 
 
446 aa  116  8.999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.303629  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0479  GTP-binding signal recognition particle  36.41 
 
 
585 aa  116  8.999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.530078  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1381  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35.52 
 
 
474 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.286129 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5617  flagellar biosynthesis regulator FlhF  30.57 
 
 
804 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.51958  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1517  flagellar biosynthesis regulator FlhF  33.87 
 
 
513 aa  111  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3168  flagellar biosynthesis regulator FlhF  29.66 
 
 
577 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>