More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1381 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1452  flagellar biosynthesis regulator FlhF  69.12 
 
 		 460 aa  647    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3212  flagellar biosynthesis regulator FlhF  69.96 
 
 		 458 aa  651    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1633  flagellar biosynthesis regulator FlhF  79.25 
 
 		 467 aa  753    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0994643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1381  flagellar biosynthesis regulator FlhF  100 
 
 		 474 aa  967    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.286129 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1376  flagellar biosynthesis regulator FlhF  73.16 
 
 		 470 aa  703    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0597735  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2561  flagellar biosynthesis regulator FlhF  71.49 
 
 		 460 aa  673    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.287894  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1357  flagellar biosynthesis regulator FlhF  72.97 
 
 		 458 aa  650    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.592498  normal  0.109972 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2282  flagellar biosynthesis regulator FlhF  73.32 
 
 		 463 aa  672    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.451131  normal  0.682206 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1341  flagellar biosynthesis regulator FlhF  67.02 
 
 		 462 aa  640    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.672672  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2911  flagellar biosynthesis regulator FlhF  68.75 
 
 		 460 aa  647    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3053  flagellar biosynthesis regulator FlhF  69.12 
 
 		 460 aa  647    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.432908  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1297  flagellar biosynthesis regulator FlhF  72.23 
 
 		 458 aa  636    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.113598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1197  flagellar biosynthesis regulator FlhF  69.6 
 
 		 461 aa  655    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.137335  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2921  flagellar biosynthesis regulator FlhF  69.12 
 
 		 460 aa  647    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3051  flagellar biosynthesis regulator FlhF  78.75 
 
 		 464 aa  748    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.03242 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1364  flagellar biosynthesis regulator FlhF  72.01 
 
 		 458 aa  633  1e-180  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.789112  normal  0.915737 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1656  flagellar biosynthesis regulator FlhF  44.62 
 
 		 495 aa  377  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000227361  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002830  flagellar biosynthesis protein FlhF  45.33 
 
 		 505 aa  367  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00231681  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03146  flagellar biosynthesis regulator FlhF  44.55 
 
 		 503 aa  365  1e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2292  flagellar biosynthesis regulator FlhF  44.12 
 
 		 484 aa  363  5.0000000000000005e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1517  flagellar biosynthesis regulator FlhF  41.4 
 
 		 513 aa  349  6e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02872  flagellar biosynthesis protein  40.79 
 
 		 477 aa  285  1.0000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3032  GTP-binding signal recognition particle  40.3 
 
 		 443 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0983  GTP-binding signal recognition particle  36.92 
 
 		 466 aa  245  9.999999999999999e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10552 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2157  flagellar biosynthesis regulator FlhF  43.41 
 
 		 393 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1977  GTP-binding signal recognition particle  35.27 
 
 		 437 aa  236  5.0000000000000005e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1946  flagellar biosynthesis regulator FlhF  33.82 
 
 		 536 aa  234  3e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0715  flagellar biosynthetic protein FlhF  35.31 
 
 		 485 aa  233  5e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.858547  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0741  flagellar biosynthesis regulator FlhF  33.82 
 
 		 487 aa  233  7.000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3429  GTP-binding signal recognition particle  35.14 
 
 		 427 aa  229  8e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.911214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3439  flagellar biosynthesis regulator FlhF  34.34 
 
 		 442 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0479  GTP-binding signal recognition particle  41.97 
 
 		 585 aa  217  4e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.530078  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2807  flagellar biosynthesis regulator FlhF  33.91 
 
 		 437 aa  217  4e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.16054 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45660  flagellar biosynthesis regulator FlhF  33.41 
 
 		 429 aa  217  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.311812 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1336  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  40.65 
 
 		 424 aa  213  5.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.550768  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3912  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35.32 
 
 		 435 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3874  flagellar biosynthesis regulator FlhF  32.83 
 
 		 429 aa  207  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.571871  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0745  flagellar biosynthesis regulator FlhF  40.33 
 
 		 388 aa  205  2e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1524  flagellar biosynthesis regulator FlhF  34.44 
 
 		 435 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.142564  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4343  flagellar biosynthesis regulator FlhF  34.44 
 
 		 435 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.615719  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2936  flagellar biosynthesis regulator FlhF  40.65 
 
 		 489 aa  196  9e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0148742  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1311  flagellar biosynthesis regulator FlhF  39.37 
 
 		 570 aa  193  6e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4414  GTP-binding signal recognition particle  33.47 
 
 		 524 aa  189  7e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0564624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0183  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.26 
 
 		 588 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0196  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.26 
 
 		 588 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.625172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3079  flagellar GTP-binding protein  40.71 
 
 		 521 aa  187  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.783936 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2014  GTP-binding signal recognition particle SRP54, G-protein  38.1 
 
 		 729 aa  187  4e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1748  flagellar biosynthesis regulator FlhF  39.72 
 
 		 379 aa  186  7e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00959  flagellar biosynthesis regulator FlhF  39.86 
 
 		 551 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.136085  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06207  flagellar biosynthesis regulator FlhF  39.86 
 
 		 551 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106259  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1748  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.68 
 
 		 379 aa  186  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4142  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.18 
 
 		 784 aa  184  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3802  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.52 
 
 		 624 aa  184  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0177  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38 
 
 		 583 aa  183  6e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.167387 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4068  flagellar biosynthesis regulator FlhF  39.58 
 
 		 632 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1977  flagellar biosynthesis protein FlhF  40.49 
 
 		 442 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.218828  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4180  flagellar biosynthesis regulator FlhF  39.58 
 
 		 632 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0132  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.16 
 
 		 657 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3168  flagellar biosynthesis regulator FlhF  39.16 
 
 		 577 aa  181  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0061  flagellar biosynthesis regulator FlhF  39.16 
 
 		 583 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3923  flagellar biosynthesis regulator FlhF  39.16 
 
 		 583 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1392  flagellar biosynthesis regulator FlhF  40.28 
 
 		 615 aa  180  4.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.70556  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3421  flagellar biosynthesis regulator FlhF  39.16 
 
 		 374 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2845  flagellar biosynthesis regulator FlhF  39.16 
 
 		 374 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1697  flagellar biosynthesis regulator FlhF  39.16 
 
 		 374 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3842  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.28 
 
 		 583 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2962  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.52 
 
 		 644 aa  179  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.168283  normal  0.0622523 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0251  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.25 
 
 		 582 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.789642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2838  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.25 
 
 		 592 aa  179  9e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0269  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.25 
 
 		 592 aa  179  9e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.147151  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1561  flagellar biosynthesis regulator FlhF  40.21 
 
 		 446 aa  179  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.37144  normal  0.111794 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3372  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.91 
 
 		 587 aa  178  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0303605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1864  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.63 
 
 		 542 aa  178  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.625266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27900  flagellar biosynthesis protein  40.34 
 
 		 758 aa  177  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0457594  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4110  GTP-binding signal recognition particle  32.14 
 
 		 447 aa  176  7e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.963643  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3094  AAA ATPase  39.08 
 
 		 530 aa  176  9e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5617  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.67 
 
 		 804 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.51958  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3821  GTP-binding signal recognition particle  39.08 
 
 		 530 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.236698 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3700  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.33 
 
 		 825 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.528557  normal  0.0206253 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0598  GTP-binding signal recognition particle  40.27 
 
 		 548 aa  171  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1747  flagellar biosynthesis regulator FlhF  30.11 
 
 		 413 aa  169  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2166  flagellar biosynthetic protein FlhF  35.51 
 
 		 527 aa  166  5.9999999999999996e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3445  GTP-binding signal recognition particle  30.43 
 
 		 446 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3708  GTP-binding signal recognition particle  30.5 
 
 		 479 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1247  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.5 
 
 		 414 aa  162  9e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3285  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  29.65 
 
 		 441 aa  159  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1178  flagellar biosynthetic protein FlhF  37.06 
 
 		 375 aa  157  3e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0427  GTP-binding signal recognition particle  40.69 
 
 		 452 aa  157  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0589  flagellar biosynthetic protein FlhF  29.78 
 
 		 437 aa  156  8e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1173  flagellar biosynthetic protein FlhF  34.3 
 
 		 424 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.141847  normal  0.243928 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3766  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  38.07 
 
 		 468 aa  152  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3850  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  38.07 
 
 		 481 aa  152  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000866601 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1161  flagellar GTP-binding protein  44.39 
 
 		 419 aa  151  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3055  flagellar biosynthetic protein FlhF, putative  40.47 
 
 		 441 aa  151  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0930  GTP-binding signal recognition particle  37.24 
 
 		 479 aa  150  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0705  flagellar biosynthesis regulator FlhF  40.88 
 
 		 438 aa  151  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0791  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.46 
 
 		 392 aa  147  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0874551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1314  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  37.45 
 
 		 402 aa  141  3e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0293  flagellar biosynthetic protein FlhF  28.84 
 
 		 423 aa  140  4.999999999999999e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0113568  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0870  hypothetical protein  32.46 
 
 		 395 aa  138  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>