262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3708 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3708  GTP-binding signal recognition particle  100 
 
 		 479 aa  967    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4414  GTP-binding signal recognition particle  63 
 
 		 524 aa  629  1e-179  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0564624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3821  GTP-binding signal recognition particle  60.94 
 
 		 530 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.236698 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3094  AAA ATPase  60.94 
 
 		 530 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0930  GTP-binding signal recognition particle  60.71 
 
 		 479 aa  539  9.999999999999999e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0598  GTP-binding signal recognition particle  53.15 
 
 		 548 aa  522  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3079  flagellar GTP-binding protein  38.13 
 
 		 521 aa  344  2e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.783936 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1620  GTP-binding signal recognition particle  48.86 
 
 		 592 aa  306  5.0000000000000004e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00835044 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0741  flagellar biosynthesis regulator FlhF  34.53 
 
 		 487 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1946  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.02 
 
 		 536 aa  226  8e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2962  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.93 
 
 		 644 aa  219  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.168283  normal  0.0622523 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3802  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.97 
 
 		 624 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0132  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.97 
 
 		 657 aa  209  7e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0196  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.82 
 
 		 588 aa  209  8e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.625172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1178  flagellar biosynthetic protein FlhF  41.94 
 
 		 375 aa  208  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3168  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.58 
 
 		 577 aa  209  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0183  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.82 
 
 		 588 aa  209  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3923  flagellar biosynthesis regulator FlhF  39.48 
 
 		 583 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0061  flagellar biosynthesis regulator FlhF  39.48 
 
 		 583 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3842  flagellar biosynthesis regulator FlhF  39.48 
 
 		 583 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1697  flagellar biosynthesis regulator FlhF  39.48 
 
 		 374 aa  207  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2845  flagellar biosynthesis regulator FlhF  39.48 
 
 		 374 aa  207  5e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3421  flagellar biosynthesis regulator FlhF  39.48 
 
 		 374 aa  207  5e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1392  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.63 
 
 		 615 aa  206  7e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.70556  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1311  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.58 
 
 		 570 aa  206  9e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3372  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.3 
 
 		 587 aa  205  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0303605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0177  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.65 
 
 		 583 aa  206  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.167387 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4180  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.41 
 
 		 632 aa  204  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4068  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.41 
 
 		 632 aa  204  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0251  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.68 
 
 		 582 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.789642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2936  flagellar biosynthesis regulator FlhF  41.07 
 
 		 489 aa  201  3e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0148742  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2838  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.36 
 
 		 592 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0269  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.36 
 
 		 592 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.147151  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4142  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.11 
 
 		 784 aa  192  9e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1247  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.17 
 
 		 414 aa  190  5e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27900  flagellar biosynthesis protein  37.97 
 
 		 758 aa  186  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0457594  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1197  flagellar biosynthesis regulator FlhF  31.51 
 
 		 461 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.137335  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1633  flagellar biosynthesis regulator FlhF  33.76 
 
 		 467 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0994643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2014  GTP-binding signal recognition particle SRP54, G-protein  36.52 
 
 		 729 aa  182  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1341  flagellar biosynthesis regulator FlhF  31.51 
 
 		 462 aa  176  7e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.672672  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5617  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35.47 
 
 		 804 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.51958  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3700  flagellar biosynthesis regulator FlhF  32.56 
 
 		 825 aa  176  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.528557  normal  0.0206253 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1376  flagellar biosynthesis regulator FlhF  31.12 
 
 		 470 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0597735  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3051  flagellar biosynthesis regulator FlhF  31.16 
 
 		 464 aa  172  9e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.03242 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2561  flagellar biosynthesis regulator FlhF  32.03 
 
 		 460 aa  172  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.287894  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1364  flagellar biosynthesis regulator FlhF  32.13 
 
 		 458 aa  169  9e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.789112  normal  0.915737 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1297  flagellar biosynthesis regulator FlhF  32.13 
 
 		 458 aa  169  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.113598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1452  flagellar biosynthesis regulator FlhF  32.25 
 
 		 460 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3053  flagellar biosynthesis regulator FlhF  32.25 
 
 		 460 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.432908  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2921  flagellar biosynthesis regulator FlhF  31.14 
 
 		 460 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2911  flagellar biosynthesis regulator FlhF  31.29 
 
 		 460 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3212  flagellar biosynthesis regulator FlhF  32.16 
 
 		 458 aa  166  8e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0715  flagellar biosynthetic protein FlhF  31.47 
 
 		 485 aa  166  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.858547  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1357  flagellar biosynthesis regulator FlhF  31.96 
 
 		 458 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.592498  normal  0.109972 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1381  flagellar biosynthesis regulator FlhF  30.11 
 
 		 474 aa  164  3e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.286129 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2282  flagellar biosynthesis regulator FlhF  31.67 
 
 		 463 aa  164  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.451131  normal  0.682206 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1656  flagellar biosynthesis regulator FlhF  28.43 
 
 		 495 aa  160  4e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000227361  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1864  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.94 
 
 		 542 aa  160  4e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.625266  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1748  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35.89 
 
 		 379 aa  159  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1748  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35.89 
 
 		 379 aa  158  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1336  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  29.27 
 
 		 424 aa  158  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.550768  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06207  flagellar biosynthesis regulator FlhF  39.34 
 
 		 551 aa  157  4e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106259  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00959  flagellar biosynthesis regulator FlhF  39.34 
 
 		 551 aa  157  4e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.136085  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0983  GTP-binding signal recognition particle  30.27 
 
 		 466 aa  157  5.0000000000000005e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10552 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0745  flagellar biosynthesis regulator FlhF  31.53 
 
 		 388 aa  155  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2292  flagellar biosynthesis regulator FlhF  28.03 
 
 		 484 aa  153  7e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2157  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.2 
 
 		 393 aa  152  8.999999999999999e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3032  GTP-binding signal recognition particle  28.51 
 
 		 443 aa  152  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3439  flagellar biosynthesis regulator FlhF  29.9 
 
 		 442 aa  152  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002830  flagellar biosynthesis protein FlhF  31.6 
 
 		 505 aa  149  9e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00231681  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03146  flagellar biosynthesis regulator FlhF  31.97 
 
 		 503 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2807  flagellar biosynthesis regulator FlhF  31.18 
 
 		 437 aa  147  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.16054 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45660  flagellar biosynthesis regulator FlhF  27.77 
 
 		 429 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.311812 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1977  flagellar biosynthesis protein FlhF  34.53 
 
 		 442 aa  144  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.218828  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1517  flagellar biosynthesis regulator FlhF  32.48 
 
 		 513 aa  142  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02872  flagellar biosynthesis protein  28.51 
 
 		 477 aa  142  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1977  GTP-binding signal recognition particle  30.07 
 
 		 437 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0479  GTP-binding signal recognition particle  32.27 
 
 		 585 aa  141  3e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.530078  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3874  flagellar biosynthesis regulator FlhF  31.6 
 
 		 429 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.571871  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3429  GTP-binding signal recognition particle  28.51 
 
 		 427 aa  138  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.911214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1561  flagellar biosynthesis regulator FlhF  33.66 
 
 		 446 aa  138  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.37144  normal  0.111794 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3912  flagellar biosynthesis regulator FlhF  28.6 
 
 		 435 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3669  flagellar biosynthesis regulator FlhF  27.89 
 
 		 435 aa  134  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.421511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1524  flagellar biosynthesis regulator FlhF  29.45 
 
 		 435 aa  130  6e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.142564  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4343  flagellar biosynthesis regulator FlhF  32.35 
 
 		 435 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.615719  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1173  flagellar biosynthetic protein FlhF  31.56 
 
 		 424 aa  127  5e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.141847  normal  0.243928 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2166  flagellar biosynthetic protein FlhF  28.92 
 
 		 527 aa  126  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4110  GTP-binding signal recognition particle  37.57 
 
 		 447 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.963643  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3850  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  34.36 
 
 		 481 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000866601 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3766  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  34.36 
 
 		 468 aa  114  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0870  hypothetical protein  29.17 
 
 		 395 aa  111  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0705  flagellar biosynthesis regulator FlhF  33.77 
 
 		 438 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3445  GTP-binding signal recognition particle  30.43 
 
 		 446 aa  108  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1139  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  30.56 
 
 		 626 aa  105  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1161  flagellar GTP-binding protein  28.12 
 
 		 419 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3285  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  33.33 
 
 		 441 aa  102  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0427  GTP-binding signal recognition particle  28.36 
 
 		 452 aa  102  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1414  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  28.34 
 
 		 466 aa  101  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.37115 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1357  GTP-binding signal recognition particle  34.94 
 
 		 378 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.138394  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0589  flagellar biosynthetic protein FlhF  30.74 
 
 		 437 aa  100  6e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>